Entry |
|
Name |
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 isoform X1
|
KO |
|
Organism |
bvan Bombus vancouverensis nearcticus
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:bvan00001]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
117159526
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:bvan03021]
117159526
Enzymes [BR:bvan01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
117159526
Transcription machinery [BR:bvan03021]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
117159526
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
Unknown
|
AA seq |
1122 aa
MLIEPKLTNTSTNFGKPPEKQNPLLQSLGAPHIDSFNYMLEDGLSEAVRDNPLVYIHLPN
EDKIALWIDDVSIHQPNIPSGAIGVKNHKIYPTECRQRGCTYKGKIIVKLGWSINNKVQE
TLERDLGEIPIMIKSNRCHLSKMSPKDLVAHGEHEQEWGGYFIIKGLERIIRMLLMTRRN
YPIAIRRSGWKARGIQFSDLGLLLRSVRDDNTTANNTLHYVTDGSAKLMFSYRKVLYYVP
LILMLKCLVDVSDIFIYSALTAGCEDDLYYKGCILNMLRAVHEQGLNSHEECKAYIGRMF
RIKLFELPYDATDIDVCDFIIKHCIAIHLHDPLDKFYLLAFMTKKLFALANNKCAVEGAD
AVMMQECLLGGHLYLQVLKEKLYSWLTGLKMGILKRARSAGNRYTLNVQEMLNAMKHGNS
LESQMENFLSTGNIRSPTGLGLMQNTGLTIVAENINRMRYMSHFRAIHRGSFFQEMRTTE
ARQLLPDAWGFICPVHTPDGAPCGLLNHLTMNCIITKHTNPKLKANVPIILMDLGMIPLS
IADNWKKSYIVILDGKLIGLIDDNIISRVTDKLRLLKIKGQEVPSTMEIALVPKKNVPAQ
YPGLYLFTNPARMMRPVMNLAAKKVEYIGTFEQIYLNICVTPEEAYEGLTSHQELSKTAF
LSNLASLIPMPDCNQSPRNMYQCQMGKQTMGTPCHTWQLQSETKLYRLQTPATPLFRPVH
YDEINLDDFAMGTNAIVAVISYTGYDMEDAMIINKAAHDRGFAHGLIYKSEFVDLKDQKS
YFARNPDKPDLAEKLDVDGLPILGTMISEGDVYYCYYDADQSTYVTGKYHGKEDAYVDTV
KLCGTLHSHIPRRACITFRIPRNANVGDKFASRAGQKGICSQKWPAEDLPFTETGLIPDI
VFNPHGFPSRMTIAMMIEVMAGKSAAIHGLVHDATSFRFNEDETAVEYFGKLLERGGYNY
YGTERMYSGIDGREMTADIFFGVVHYQRLRHMVSDKWQVRSTGPIDVLTRQPIKGRRRGG
GVRFGEMERDSLLSHGCSFLLQDRLFHCSDKTTTLVCKKCGTLLGPVMEMGLSASGLNDK
TKCRLCGDDESVREVDIPYIFRYLVTQLTSCNINVKLSFAEK |
NT seq |
3369 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgttgattgaaccgaaattgacaaatacgtcaacaaatttcggcaaacctccagaaaag
cagaatcctttgttgcagagcttaggtgctccgcacatagattcttttaattatatgcta
gaagatggcctgtctgaggcagttagagacaatccacttgtttatattcatctgccaaat
gaagacaaaatagcattatggatcgacgatgtatctattcatcaaccaaatattccatct
ggcgcaattggggtgaagaatcataaaatctatcctacagaatgtagacaacgaggatgt
acttataaaggaaagataatagtcaaattaggatggtctatcaataataaagtgcaagag
acgcttgaaagggatttaggagaaattccaattatgattaaatctaatagatgtcattta
agtaagatgagtcctaaagatttagttgctcatggagaacatgaacaagaatggggtgga
tatttcatcattaaaggccttgagaggattataagaatgttattaatgacaaggaggaat
tatcctattgctattagaagatcaggctggaaagctcgtggcatacaatttagcgatctt
gggttactattaagaagtgtacgagatgataatactacagctaataatactttgcattat
gtaactgatggctcagcaaaattaatgttttcatataggaaagttttatactatgttcca
ttgatcttgatgttaaaatgcttggttgatgtttcggacatttttatttatagtgcatta
acagctggatgtgaagatgatttatattacaaaggttgtattttaaatatgctaagagct
gtacatgaacaaggtttaaatagtcatgaagaatgcaaagcttatatagggagaatgttt
agaataaaactttttgaattaccttatgatgctactgatattgatgtttgtgacttcata
attaagcattgtatagcaattcatcttcatgatccactggataaattttatttactcgca
tttatgacaaaaaagctatttgctcttgcaaataataaatgtgccgtagaaggtgctgat
gctgtgatgatgcaggaatgtttactgggtggtcatttatatttgcaagtattgaaagaa
aaattatatagttggttgactggtcttaaaatgggtattttgaaacgtgcaaggagtgct
ggtaataggtacaccttaaatgtgcaggaaatgctaaatgcaatgaaacatggaaattcg
ctggaatcacaaatggaaaattttttatctactggaaatataagatcaccaacaggttta
ggattgatgcaaaatacaggtctcacaattgtcgctgaaaatattaatagaatgcgatac
atgagccattttcgtgcaatacacagaggttcctttttccaagaaatgaggaccacagaa
gctagacaattattgccagatgcatggggtttcatttgtcctgtacatacacctgatggt
gcaccttgtggtcttcttaatcatttaacaatgaattgcatcattacgaaacatactaat
ccgaaattgaaagctaatgttcccatcatactaatggatcttggaatgattccactgtca
attgctgacaactggaaaaaatcttacattgtaatattggatggaaaattaataggatta
atagacgataatataatttcaagagtaacagacaagctacgattgcttaaaataaaaggc
caagaggttccgtctacgatggagatagcactggtgccaaaaaaaaatgtaccagcacaa
tatccaggattatatttatttacaaatccagctcgtatgatgagaccggtaatgaattta
gctgccaaaaaggtggaatatataggaacatttgaacagatttatttaaatatctgtgtt
acacctgaagaagcctatgaagggttgacatcacatcaagaattatcaaaaacggctttc
ttaagtaatttagcaagtcttatcccaatgccagattgtaatcaaagtccacgaaatatg
tatcaatgtcagatgggtaaacaaacaatgggcactccatgccatacatggcaattacaa
tctgaaactaaattatataggttgcaaacacctgcaacaccactctttcggccagtgcat
tatgacgaaattaatcttgatgattttgctatgggtactaatgcaattgttgccgttatt
tcttacacagggtatgatatggaagacgcgatgatcataaacaaagcagcgcacgatagg
ggttttgcacatggactgatttataaatctgaattcgtagatttgaaagatcagaaaagt
tattttgcgaggaatcctgataaacctgatcttgcagaaaaattggacgtcgatggcctt
cctattttaggtacaatgatttcagaaggtgatgtctattattgctattatgatgcagat
caatcaacatatgttactggtaaatatcatggaaaggaggatgcttatgttgatactgta
aaactttgtggaacattacatagtcatattccacgtagagcttgtatcacttttcgtatt
ccacgtaatgcaaatgttggagataaatttgcttcgagggcaggtcaaaagggtatctgt
tcacaaaaatggcctgcagaggatctaccatttacagaaacaggtttaattccagatatt
gtttttaatcctcatggttttccaagtcgtatgacaatagctatgatgatcgaggtgatg
gctggaaaatcagcagccatacatggattggtacatgatgcaacatcgtttagatttaac
gaggatgagacagctgttgaatattttggaaaattattggaacgcggtggttataattat
tatggaacagaaagaatgtattcaggaatagacggaagagaaatgactgctgatatattt
tttggagtagtacattatcaacgattacgtcacatggtttcagataagtggcaggtgaga
agtactgggccaattgatgttttaacaagacagcctataaagggtagaaggaggggtggt
ggtgttcgttttggagaaatggaacgagattcattactatctcatggttgttcgttctta
cttcaggatcgtcttttccattgttcagacaaaactaccactctagtttgtaaaaaatgt
ggaacgttattgggtccggtaatggaaatgggtctaagtgcatcaggattaaatgacaag
acaaaatgtcgtctttgcggtgatgatgaatctgtgagagaagttgacataccatacatt
ttccgatatctcgtaacgcaattaacatcttgcaatattaatgtaaagttgtcatttgcg
gagaaatga |