KEGG   Bombus vancouverensis nearcticus: 117166587
Entry
117166587         CDS       T07628                                 
Name
(RefSeq) probable ATP-dependent RNA helicase DHX34
  KO
K20101  ATP-dependent RNA helicase DHX34 [EC:5.6.2.6]
Organism
bvan  Bombus vancouverensis nearcticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bvan00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:bvan03019]
    117166587
Enzymes [BR:bvan01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     117166587
Messenger RNA biogenesis [BR:bvan03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Surveillance factors
    Other surveillance factors
     117166587
SSDB
Motif
Pfam: zf-C2H2_DHX34 Helicase_C DEAD OB_NTP_bind HA2_C AAA_22 nSTAND3 AAA_19 ATPase HA2_N ABC_tran RsgA_GTPase
Other DBs
NCBI-GeneID: 117166587
NCBI-ProteinID: XP_033206566
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1159 aa
MSSRYKSNNKFRRKYQYDDEQKKSKYDSKLPYSADYDKKEILDQKSDFSQEITNKNTEDF
YFNKYKHELNKIFSGNLNVIQDTDDFWRFVNKYETVQKKLRTPDILPNFSLNTIGVPETY
HKLHCINFKLSYNFNELFARVMPVKALTKERLLKFQNIIILYLDFKQKEKFAKLKKLRKS
QVNLPVYQYKHEIIETIKQEQVVIIAGDTGCGKSTQVPQYLYTAGFQKIACTQPRRIACI
SLAKRVAFETLTENCNDVGYQIRFEKQRNQNTKITFITEGLLLRQLSGEFELLPYDVIVL
DEVHERHLHGDFLLGIMKCIINQRQDLKLVLMSATINIELFNNYFSKENVKVIQVPGRLY
PIQLLYRPVTIEDIRYKNDRFNPSPYIQIMQMIDQKYPAEEKGDLLIFLSGMSEITAVVD
AAKEYSQKKNNWIILALHSTLAISEQDKVFDFAPEGVRKCIVSTNIAETSITIDGIRFVA
DSGKVKEMSYDPSCKMQRLKEFWISKASAEQRKGRAGRTGPGVCYRLYSEEEYMSLEKYS
TPELQRVPLDSLLLQMIAMGLPDARKFPFIEPPSPENIENSILSLKEHGALTDNEKITCI
GKTLARLPVDITIGKMLIMGSIFHQVEPVLSLAAALSIQTPFTNRAYRDSECETSRKKLE
SDHGDPITLLNAFREWLEVKQQSSQESRGSGNSSRKWCKRRGLEEQRFYEMTKLRAQFKE
LLQDCKLLRSLPEPNSSMSSAERAIRHGELKLLKSLKRTYKQSEPRKRKQLKLESFDIQL
EDNDHDDGEIDIKDIEFRMKNDPNQVQNLLTAATACSYKDLTMLKLILCSGLYPQFACAD
EFNYCKTTNEQLFHTKSKPYIALHPMSFFGNHPQVLQLEEADIVSIPGFKSKTAVSPKHT
ILTYLSLLETTKPYLVNTLRMPAAQTLLLFTREIDTNSTFSIMICDSWLELKFPIPDSGQ
ILLMKATKLRHKWDFLLNQQLQDSSTSNDENQDFSEFEYTLTQDLIEYMHTTVPYTLKRL
LPADLKTIYVGCGENSILIDPNPFQSDFVVIPNSIKGGVRVTNTITYNCVKETEWSDRLS
TEILATQWHCSNCNMQAILTSIEKLQHQQSCVKTDIKDVEKHDNIKRKPNAQAYECSDCA
QILYLTPIEILKHKKSHVK
NT seq 3480 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagttcacgatacaaatctaataataaatttaggcgtaaatatcaatatgatgatgaa
caaaagaaaagtaaatacgattcaaaattaccatacagtgcagattatgataaaaaagag
attttagaccaaaaaagtgatttttctcaagaaatcactaataagaataccgaagacttt
tattttaataaatataagcatgaattgaataaaatattctcaggaaatttaaatgtaatc
caggatactgatgatttttggagatttgttaataaatatgaaactgtacagaaaaaacta
agaacaccagatattttacctaatttttcactaaatactatcggtgtgccagaaacatac
cacaaattacattgcataaatttcaaattaagttataattttaatgaattattcgcacgt
gtaatgccagttaaagcattaacaaaagaacgcttattgaagtttcagaacataattatt
ttatatttagactttaagcaaaaagaaaaatttgccaagttaaaaaaactcaggaaatca
caagtaaatctaccagtttatcaatataaacatgaaattattgaaacaataaaacaggaa
caggtagttataatagctggtgatactggttgtggaaaatccactcaagtgcctcaatac
ttatatacagcaggttttcaaaaaattgcttgtacacaaccaagaagaatagcttgtata
tctttagcaaaacgtgttgcttttgaaacattaacagaaaactgcaatgatgttggttac
caaattcgttttgaaaagcaaagaaatcaaaataccaaaattacatttataacagaaggt
cttttgttaagacagttatctggagaatttgaattattaccttatgatgtaattgttttg
gatgaagtgcatgaacgtcacctacatggagattttcttcttggtattatgaaatgtatt
attaatcaaaggcaagatctaaaattagtacttatgtctgctacgattaatattgaactt
tttaataattatttttcaaaggaaaatgttaaagtaatacaggttcctggaaggttgtat
cctattcagttgttgtacaggcctgttactatagaagatattcgatataaaaatgataga
ttcaatccaagtccttatatacaaataatgcaaatgattgatcaaaaatatccagctgaa
gaaaaaggcgatttattaatatttttaagtggaatgagtgaaattactgccgttgtagat
gcagcaaaagaatatagtcaaaaaaaaaataattggattatcttagcacttcacagcacc
ctagctattagtgagcaagataaagtatttgattttgctcctgaaggagtgagaaagtgt
attgtatctactaacattgctgaaacttctattactatagatggaataagatttgttgct
gacagtgggaaagtaaaagaaatgagttatgacccatcatgcaaaatgcaacgactcaaa
gaattttggattagcaaagctagcgcagaacaacggaaaggaagagctggtagaactgga
cctggagtatgttatagattatactctgaagaagaatatatgtctttggaaaaatactca
actcctgaattacaacgtgtacctttagattccttacttctacaaatgattgcaatggga
cttccagatgcacgaaaatttccattcatagaaccaccttcaccagaaaacattgaaaat
tctatattatctttaaaagaacatggtgcgctaacggataatgaaaaaataacatgtatt
ggaaaaacacttgcacgcttacctgttgacataacaatagggaaaatgttaataatgggt
tctatttttcaccaagtagaaccagtcttgtcattagctgctgccttaagcatacaaaca
ccatttacaaatagagcatatagggattcagaatgcgagacgtctaggaaaaaattggaa
tctgatcatggtgatccaataacattactaaatgcatttagagaatggttagaagtaaaa
caacaaagttctcaagaatccagaggtagtggtaacagtagtagaaaatggtgcaaaaga
agaggtttagaggaacagagattttatgaaatgacaaaattgagagcacagtttaaggaa
ttacttcaggattgcaaattactgaggagtctcccagaaccaaattcttctatgtccagt
gcagaacgtgctataagacatggagagcttaaacttttaaaatcattaaaaagaacctac
aaacaaagtgaacctagaaagcgaaaacaattaaaactagaatcatttgatattcaatta
gaagataatgatcatgatgatggtgaaattgacataaaagatatcgaatttcgaatgaaa
aatgatccaaatcaagtgcaaaatctattaacagcagccactgcatgtagctataaagat
ttaacaatgttaaaattaatactctgcagtggtttatatccacaatttgcatgtgccgat
gaatttaattattgtaagacaacaaacgagcaactgtttcatacaaaatcaaaaccatat
attgctttacacccaatgagtttctttggaaatcatccccaagtattgcaattggaggaa
gctgatattgtatcaataccaggttttaaaagtaaaactgccgttagtccaaaacataca
atattaacatatttatctcttttggagacaacaaagccttatctagtaaatacacttaga
atgcctgctgcacaaacattacttttatttacacgtgaaatcgacacaaatagtacattt
tcaataatgatatgtgattcctggttagaattaaaatttcctatacctgatagtggtcag
attttactgatgaaagctaccaaattacgacataaatgggatttcttattaaatcaacaa
ttacaagattcaagtaccagcaatgatgaaaatcaggatttcagtgaatttgagtacaca
cttactcaggatttaattgaatatatgcatacaactgttccatatacactaaaacggctt
ttaccggctgatcttaaaacaatatatgtgggatgtggtgaaaacagcatattgatagat
ccaaacccttttcaatcagattttgtagtaatacccaactcaattaaaggaggagttcgc
gtaacaaacactattacatataattgtgtaaaagaaactgaatggagtgatcgactttct
acagaaattttagcaacacaatggcattgttcgaattgtaacatgcaagcaattctaaca
agcatagaaaaattacaacaccaacaatcctgtgttaaaacagatataaaagatgttgaa
aaacatgacaatattaaacgtaaacctaatgcacaagcatatgaatgttctgattgtgca
caaatattatacttaacaccaattgaaattcttaaacataaaaaatctcatgttaaataa

DBGET integrated database retrieval system