Beta vulgaris (sugar beet): 104887887
Help
Entry
104887887 CDS
T03548
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
bvg
Beta vulgaris (sugar beet)
Pathway
bvg03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bvg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104887887
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
bvg03019
]
104887887
Messenger RNA biogenesis [BR:
bvg03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104887887
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104887887
NCBI-ProteinID:
XP_010670957
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(428926..432057)
Genome browser
AA seq
407 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFVGGISWETTEETLKDYFGQFGDVYQANIMRDKATGRPRGFGFVLFSDPSVI
DRVVQDKHTIDGRPVEAKRAMSREEQQNSGRGGNSNGGRNGGGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTDEGFRQYFENYGPVTDVVIMYDLNTRRPRGFGFISFESEESVDRVVQNTFHDLDGKQV
EVKRALPKDANPGMGSRGGGYNSGGGQNAYDGRMDSNRFMQSQSAGGAFPPYGSSGYGAA
GYGYGPANTGMGYGGYGGYGGANPGYGGPASAAYGNPNVANAARSSWNAQAASAYGAAAG
YGSAGSWGAAAAGSGGPTGQSPSGASGYGNQGYGYGNYGGGDGYGNRAGGAPGSNASAGG
GEMQGGYGSGYADTNGQGGYGAQAGGPHAAQMGYAGGYGGGQNRQAQ
NT seq
1224 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaaactgtttgtgggtgggatttcatgggaaacaactgaagaa
acactgaaagattattttggacaatttggtgatgtttatcaggctaatatcatgagagat
aaagctactggtagacctagaggttttgggtttgttctcttctcagatccttctgttatt
gatcgagttgttcaggataaacacaccattgatggtagacctgttgaggctaagcgagcg
atgtcaagagaagaacaacagaactctggtagaggtggaaacagcaatggtggtagaaat
ggaggtggaggtggaaacatcagaactaagaagatatttgttgggggtttgccgcctact
ttgactgatgaaggctttcggcagtattttgagaattatggccctgtaactgatgtagtt
ataatgtatgatctgaatacacggagaccccgaggttttggattcatttcttttgagagt
gaggagtcagtagatagagttgtacagaatacctttcatgacttagatggtaaacaagtt
gaggtgaagcgtgctctacccaaggatgccaaccctggtatgggtagtcgtggcggtggt
tataattctggtggtggtcaaaatgcttatgatggtagaatggattctaatagatttatg
caatcacagagtgccggaggcgcatttccaccttatggttcttctggatatggtgcggct
ggatacggatatgggcctgccaacactggcatgggctatggtgggtatggtggatatggg
ggtgcaaatcctgggtacggtggtcctgcaagtgctgcttatgggaaccccaatgttgcc
aatgctgcaaggagttcatggaatgcacaggcagcttctgcttatggtgccgcagctggc
tatgggagtgcaggctcttggggtgctgccgctgcaggaagtggtggaccaactggtcaa
tctccaagtggagcctctggatacggaaatcaaggttatggatatggtaactatggaggt
ggtgatgggtatggtaatcgtgctggaggagccccgggtagcaatgcctcagctggtggt
ggagaaatgcaagggggttatggtagcggatatgctgataccaacggtcagggaggctat
ggggctcaggcaggtggacctcatgctgcacagatgggctatgccggtggatatggtggg
ggccaaaatcgacaagcacagtag
DBGET
integrated database retrieval system