Bombus vosnesenskii (yellow-faced bumblebee): 117235880
Help
Entry
117235880 CDS
T07592
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
bvk
Bombus vosnesenskii (yellow-faced bumblebee)
Pathway
bvk03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bvk00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
117235880
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
bvk03021
]
117235880
Enzymes [BR:
bvk01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
117235880
Transcription machinery [BR:
bvk03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
117235880
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
AcetDehyd-dimer
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117235880
NCBI-ProteinID:
XP_033354224
UniProt:
A0A6J3KQT7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1385 aa
AA seq
DB search
MVKEQFRETDVARKISHVSFGVDSRHNMERQAHIHIVAKNLYNQDVEHTPVPYGVLDRKM
GTCNNTTNCISCGKSLNECIGHFGYIDLELPVFHVGYFRSIIGILQTICKNCSHVMLSEA
DKKHYLARVLNPNLGYLTRKALRKQILDKAKKTTVCQHCRDLNGTVKKAGLLKIVHEKYK
GKKKIDAIVQQKLAEYNNVLEDNKALEGVLQTGLISVLNPLEVQSILEKIPESDIPLLLM
NSEYALPKDLILTRIPVPPICIRPSVVSDLKAGTTEDHLTMKLSEIVFINDVIQKHRQSG
AKVQMYNEDWEFLQLHCALYINSEMSGIPLNMQPKKSGRGLVQRLKGKQGRFRGNLSGKR
VDFSSRTVISPDPNLRIEQVGVPIHVAKILTYPERVNPSNIELMRKLVRNGPDIHPGANF
IQQGKTQFKKFLKYGNRQKIAQDLQYGDIVERHLRDDDVVLFNRQPSLHKLSIMAHKAKV
LDHRTFRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHLPQTEEARAEALILMGNKSNLVTPRNGELLIA
ATQDFITGGYLLTQKDMFLNKAQASQLAGCLLAGPDIAMSITLPEPAILKPSMLWTGKQI
FSLILKPNSTCNIKANLKTKGRAYTSNQELCINDSYVIIRNSELLAGTMDKSTLGSGSKQ
NIFYILLRDWGEDIATIAMWRLARMASFFLMNRGFSIGIGDVTPGQGLLKAKEKLLNAGY
SKCTEYIRQMEEGRLVCQPGCSEEETLEAMILKELSVIRDHAGKACLKELHPSNSPLIMA
LSGSKGSFINISQMIACVGQQAISGHRVPNGFEDRALPHFERHSKIPAAKGFVENSFYSG
LTPTEFFFHTMGGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCLHYDMTVRNSVGDIVQIL
YGGDGLDPTYMEGKDCPVDYKRVLDHVTAKSPCKNEEPLDGPDLIKATNELLGSKDCECL
SEEFKQELSTFLKGVARKIIHLRYNAPSNIPVIFQLERITVSQLVEFIHTCKEKYMKAKI
EPGTAVGALAAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITQGVPRIKEIINANPKISTPIISA
ALENDVDPEYARRVKGRIEKTTLGEVTEYIEEVYLPDDCFLLVKLDIDRIKLLKLEVDVN
SIRYSICTSKLRLNPKLVNVRGDSIITVNPSKSKYSINYALTQLKETIPNIVIKGLPSVS
RAVIHNDDSSGKTRYKLFVEGNNMREVMATLGVLGRKTTSNNTIEVFKTLGIEAARATIM
TEIKLVMENHGMSIDRRHPMLVADLMTSRGEVLGITRQGLAKMKESVLNLASFEKTSDHL
FDAAYYGQKDVICGVSESIIMGIPVPVGTGIFKLLHKADKDEPRIKELIFDDPQFNKTTK
TTKKL
NT seq
4158 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaagaacaattcagagaaacagacgtagctcgcaaaatctctcatgtatcattc
ggagtggatagccgccataacatggaaaggcaagcccatatacatattgtggctaaaaat
ttatataatcaggatgttgaacatactccagttccatatggagttcttgataggaaaatg
ggtacttgtaataatactaccaattgtatatcatgtggtaaatctttaaacgaatgtatt
ggacactttggctacattgatttagaactgcctgtttttcatgttggttattttaggtct
attattggtattcttcaaactatttgtaaaaattgttctcatgttatgctatctgaagca
gacaaaaagcattatttagccagagtattaaatcctaatttgggatatttaacacgtaaa
gcattacgtaaacagattctagataaagctaagaaaactacagtttgtcaacattgtcgg
gatcttaatggaactgttaaaaaagccggtttacttaaaatagtgcatgaaaagtataaa
ggtaaaaagaaaatagatgctattgttcaacaaaaattagcagaatataacaatgtgctt
gaggataataaagcattagaaggagtacttcaaactggtttgattagtgtattaaatcct
ttggaggtacaaagcattttggaaaaaataccagaaagtgacattcctttgttattgatg
aattcggagtatgcattaccaaaagacttaatattgacaagaattcctgtgccaccaatt
tgtattagacctagtgttgtgtctgatctaaaagctggtacaacagaagatcatttaaca
atgaaattatcagaaatagtttttatcaatgatgttattcagaaacatagacaaagtgga
gctaaagtacaaatgtacaatgaagattgggaatttctacaattgcattgtgccctttat
ataaatagtgaaatgtctggtataccccttaatatgcaaccaaaaaaatctggtagagga
ttggttcaaagattaaaaggaaaacagggtcgttttcgaggaaatttatctggtaaacgt
gtagatttttctagtcgtactgttatttcaccagatcctaatctgaggattgagcaagtt
ggtgtacctattcatgttgccaaaattttaacatatcctgaaagagtaaatccatcaaat
atagaactaatgcgaaaacttgtaaggaatggtccagatatacatccaggtgcaaatttc
atacaacaagggaaaacacaatttaaaaaatttttaaaatatggtaaccgacaaaaaatt
gctcaagatttacagtacggtgatatcgttgaaaggcatctgagagacgatgatgtagta
ttattcaataggcagccgtcgttgcataaattaagcatcatggcacataaagcaaaagta
ttagatcacagaacatttagatttaatgagtgtgtttgtacaccatataatgccgatttt
gacggggacgaaatgaatttacaccttccccaaactgaagaagcaagagcagaggcttta
attttaatggggaataaatcaaatttagttacacctcgcaatggagaacttttaatagct
gcaacacaagatttcattactggtggatatctgctgacacaaaaggacatgtttttaaat
aaagctcaagcaagtcaactagctggttgtcttctagcaggacctgatattgccatgtct
ataactcttcctgaaccagctattttaaagccaagcatgttatggacagggaaacaaatc
tttagtttaattttaaaacctaatagtacttgtaatattaaagctaatttaaaaacaaaa
ggaagagcttatactagcaatcaggaattatgtattaatgattcttatgttattatccgg
aattcagaattattagcaggaaccatggataaatcgactttaggttcaggatcaaagcag
aatatattttatattctattacgcgactggggcgaagatattgcaacaatagctatgtgg
cgactagcaagaatggcaagtttctttcttatgaatagaggtttttctattggtattgga
gatgttacaccaggacaaggacttcttaaagccaaagaaaagcttttaaatgccgggtat
tctaaatgtacagaatacattcgtcaaatggaagaaggacgtcttgtatgtcaacctggc
tgttcagaggaagaaacattagaagcaatgatattgaaagaactttcagtaattcgtgat
catgctggtaaagcatgtttaaaagaactccatccaagtaacagtccattaattatggca
ttgtctggcagtaaaggaagctttatcaatatttctcaaatgattgcgtgtgtgggacaa
caagctattagcggtcatagagttccaaatggatttgaagacagagctctaccacacttt
gaaagacattcaaaaatccctgcagctaaaggtttcgtagaaaattcgttctattctggt
ttaacgccaacggaatttttcttccacactatgggtggaagagaaggtcttgttgataca
gcagttaaaactgcagagactggttacatgcaacgacgactagttaagagtttagaagat
ctgtgccttcattatgatatgacagttcgtaattcagtgggggatattgtacaaatattg
tatggtggcgatggtctagatcctacatacatggaaggaaaagattgtccagtagattat
aagagagtattggatcacgtaacagctaagtcgccatgcaaaaatgaagaaccactagac
ggtcctgatcttattaaagctacaaatgaattactaggttccaaagattgtgaatgtctc
agtgaagaatttaaacaagaattatccacattccttaaaggtgtagcacgcaaaataata
cacctacgatataatgctccatcgaatatacctgtaattttccaactcgaacgaatcaca
gtttctcaattagttgaatttattcatacctgtaaagaaaaatatatgaaagcaaaaata
gaaccaggtaccgctgtaggtgcacttgccgcacaaagtattggagaaccgggtacacaa
atgacattaaaaacatttcacttcgccggtgtagcatctatgaatattactcagggtgta
ccgcgtattaaagaaatcattaatgcaaatcctaagattagtactccaatcatctcagca
gctttagaaaatgacgtagatccggaatatgctagaagagtaaaaggcaggattgaaaaa
actactttaggagaagtgacagaatatattgaagaagtttatttgcccgatgattgtttc
ttattggtcaagttagatattgatagaataaaattattgaagttagaagtagatgttaac
tccatacgttattcgatctgtacatcaaaattaagattgaatccaaaattagtaaatgtt
agaggagattctattatcactgtaaatccaagcaaaagtaaatacagcataaattatgcc
ctcacacagcttaaagagacaattccaaatattgttataaagggtttaccatcagtttct
agagctgtaattcataacgatgattcaagtggtaaaacaaggtataaattgtttgtagaa
ggaaacaatatgcgagaagtaatggcaactcttggcgttctgggcagaaaaacaacttca
aacaatactattgaggttttcaaaactttaggaattgaggctgcaagagcaactataatg
acagaaatcaaattggtgatggaaaatcatggaatgagtattgatcgaagacatccaatg
cttgtagcagatttaatgactagtagaggtgaagtactgggtattacaagacaaggctta
gctaaaatgaaagaatctgtcttaaatttagcttcgtttgaaaaaacatctgatcatcta
tttgatgcagcttattatggtcaaaaggatgttatttgtggagtgtctgaatcaatcata
atgggtattccagttcctgtaggaacaggaattttcaaattacttcacaaagctgacaaa
gatgagccaagaataaaggagttgatatttgacgatccacaattcaacaaaactacaaaa
accacaaaaaaattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system