Phocaeicola vulgatus: BVU_2029
Help
Entry
BVU_2029 CDS
T00546
Name
(GenBank) putative outer membrane protein, probably involved in nutrient binding
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
bvu
Phocaeicola vulgatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bvu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bvu02000
]
BVU_2029
Transporters [BR:
bvu02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BVU_2029
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
STN
AbiJ_NTD4
Pept_S41_N_bact
FecR_C
DUF1806
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR39694
UniProt:
A6L1Y0
LinkDB
All DBs
Position
2623244..2626564
Genome browser
AA seq
1106 aa
AA seq
DB search
MKNKRKAILLVGALLCLNLNIFSQNIPLKMNKVSVKKAMTELKEKSGYSFVYIAGDLDTK
KIVDIDAEQLQEVIEQILEGQNVSYEIKDKNIIIRKKEVEQSMLNEKKLQDISGLVMDVM
GEPIVGVNVMEKGTTNGTITDMDGKFLLKAPANATLIISFIGYKTLAVNLEGEKNVNITL
KEDLEQLDEVVVVGYGTQKKSSLTASVATVPAKELSKQMGHSVAAALQGRAPGVEILQKG
GEAGADIKILVRGAGTFGATEPLYVIDGAFSNNGLNSLNPSDIESIEILKDGSAAAIYGS
RAANGVVLITTKHGQKGKAKVEISANYSLQTPSKYLDFLDANEHREYTKQIVANSTNQTQ
APENIHPTNPDINTDWQDAYLRNAPMYNLNASISGGGEYSTFNTSLGYFDQQGIMEFSGF
KKYNARVNGTFKKGRLTVSETLSAAFTNKEPQVRMVMGIPTVPMTDVEGRYVSAGKDYYV
NEGKVTNPFASYSNTVRRNKTVNVTGSLNIGLNLYKGLDYKLLLGGDYISTNNISRSIAF
DSNWDENGNADPDYSRTINSLSESRGQRFSYTIDNILTYKNMFAGHTIDAMVGTSWMREY
YRTMGIGSGSTDLGGPNITIFNGKGDITSEEYNSALLSFFARLNYDYKERYLVSASIRSD
KSSKFAKGNRVGYFPSVSVGWNIHEENFFNIEWISKMKIRASYGELGANFIDSYSFLSTA
YGPIPSVFGENQIGQSSVMNGYVTKFAQENLTWEKSISKNVALEMAFLNNKISFTAEYFW
KDNNDLLAPLLPLASSGQTIMTNGGDLPVFNSASVENKGFEFTVGYRNNWKDWSLDVTAN
ISALRNKVKSLGEGVQPIKAEVMMSGSFNDRPTITKPGLPIGTFWGYVVEGFDNDGNFIF
QDNNGSVNGVLTGKPDGKIDENDKTDIGNPHPDFTYGLNINVGYKNWDLTAFFQGTQGND
IFALMKYDWYFGGANSATLKDAFYNSWTPQNPNAEAPKLNSKNSSGINSLPSTFYVEDGS
YFRCKNLQIGYSFNKKLLQKFHIESFRIYAGVQNLFTITKYPLYDPEVSSNVLFDRGVDG
FWQAQESPHEATMNSRVYNLGVNLTF
NT seq
3321 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaagagaaaggccatattattggtcggggctttgctttgccttaatttgaat
atcttctcacagaatataccattgaaaatgaataaagtatcggtgaaaaaagctatgact
gagctaaaagaaaaaagtggatattcatttgtgtatatagctggggatttagatacgaaa
aagattgttgatatagacgctgagcaactgcaagaagttattgagcaaatcttggaagga
caaaatgtttcttatgagataaaagataaaaatatcattattcggaagaaggaagtagaa
cagtccatgttgaacgagaaaaaattacaagatatttcagggcttgtgatggatgttatg
ggagaacctatcgtaggagttaatgtgatggaaaaggggactactaatggtactattact
gatatggatggtaagtttttacttaaagctcctgcgaatgcaactcttattattagtttt
atcggttataagactcttgctgttaatttggaaggggaaaagaatgtgaatataactctg
aaagaggatttggaacaattagatgaagtggtggtggttggttatggaactcaaaaaaaa
tctagtttgacagcatccgtggcgacagtgcctgcaaaagaactgagtaaacagatgggg
cattctgttgcagctgctttgcaggggagggctccaggagtagaaatattgcaaaagggg
ggagaagctggggcagatatcaagatacttgttcggggagcaggtacatttggtgctact
gaacctttatatgttattgatggtgcattttctaataatgggctaaattcgttgaatcct
tcagatattgaatcaatagaaatcctgaaggatggttcggcggctgccatttatggctct
cgcgctgcaaatggggttgtgctgataactaccaagcatggtcaaaaaggtaaagcaaaa
gttgaaatttctgcaaactattctttgcagactccttctaaatatcttgattttctagat
gcaaatgagcatcgcgaatatactaagcaaattgttgcaaattcaacaaaccagactcaa
gctccagaaaatattcatcctactaatcctgatattaatactgactggcaagatgcatat
ctaagaaatgctcctatgtataatttgaatgcttcaatttctggtggtggtgaatattca
acttttaatacaagtttggggtattttgatcagcaaggtattatggaattttctggtttt
aagaaatataatgcacgtgtcaatggaacgtttaagaaaggacgtttgactgttagtgaa
actctttctgctgcttttacaaataaggagcctcaagtaaggatggtgatggggattcct
actgttccaatgactgatgtagagggaaggtatgtatctgcaggtaaagattattatgta
aatgaaggaaaagttactaatccgtttgcatcttattccaatactgttcgaagaaataaa
acagttaatgttactggtagtttgaatataggactgaatttatataaaggattggattat
aagctactacttggaggtgactatatatcaacaaataatatatctcggtccattgctttt
gactccaattgggatgagaatggtaatgcagatcctgattatagcagaacgattaattca
ctatctgaaagtcgtggacagcgatttagttatacaattgataacattttgacttataag
aatatgtttgctggtcatactattgacgcaatggtaggtacaagttggatgagagaatac
tatagaactatggggattggttctggttctacagatttgggtggtcctaatattactatt
tttaatgggaaaggagatataacaagtgaagaatacaattcagctttactctcctttttt
gctcgcttgaactatgactataaggagcgttatcttgtttctgcaagtattcgtagtgat
aaatcttccaaatttgctaaaggaaatagggtcggttactttccttcggtttcagtgggt
tggaatatacatgaagagaatttttttaatatagaatggataagtaaaatgaagattaga
gctagttatggtgaattaggagctaattttatagattcatattctttcctttctacggct
tatggtccaataccttctgtattcggtgaaaatcagattggtcaaagtagtgtgatgaat
ggttatgtaaccaaatttgctcaggaaaatttgacttgggaaaaatcaatatctaaaaac
gtagcattggaaatggcttttctgaataataaaatttcttttacagctgaatatttttgg
aaagataataatgacttacttgctccattacttccattagcatcgtcagggcaaaccatt
atgactaatgggggggatttgccagtctttaattctgcatctgttgaaaataaaggtttt
gaatttacggtaggttatcgtaataattggaaggattggagtttggatgttactgccaat
atttcggcattaagaaataaagtaaagagtttgggtgagggagtacaacccattaaggca
gaggtgatgatgagtggttcttttaatgaccgtcctactattactaaaccgggcttgcct
attggtaccttttggggatatgtggtggaaggttttgataatgatggtaattttattttt
caggataataatggtagtgtgaatggtgtattgacaggaaaaccggatgggaagattgat
gagaatgataaaacggatattggtaatcctcatccggattttacttatggtttaaatata
aatgtaggttataagaattgggatttgactgcttttttccaaggaacgcaaggtaacgat
atttttgctttaatgaaatatgattggtattttggaggagctaatagtgctaccctaaag
gatgctttctataattcatggactccgcaaaatcctaatgcagaagctcctaaactgaat
agtaaaaacagttctggcataaactcgcttccaagtacattctatgtggaggatggttct
tatttcagatgcaagaatctacaaatcggttattcctttaataagaaattattgcaaaaa
ttccatatagaatcatttagaatatatgcgggggtacaaaatttattcactatcacaaaa
tatcccttgtatgatcccgaagttagttcaaacgtgttgtttgacagaggtgtggatggt
ttctggcaagcacaggaaagtcctcatgaagcaacaatgaattctagagtatataatctt
ggtgtcaatttaactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
