Phocaeicola vulgatus: BVU_2447
Help
Entry
BVU_2447 CDS
T00546
Name
(GenBank) putative outer membrane protein, probably involved in nutrient binding
Organism
bvu
Phocaeicola vulgatus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
STN
FecR_C
CooC_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR40105
UniProt:
A6L341
LinkDB
All DBs
Position
complement(3144545..3147898)
Genome browser
AA seq
1117 aa
AA seq
DB search
MDKKHNYTNHGKSSKRLWITFLFFCIITTGFMQAANKVFAQATVTASFKNATLSEILWEI
QRQTDFTFVYSTNDVKQIKVQNLNVNNEKIANVLDKCLMNSGLTYSVHNGVIAIKQIEEK
ESAVPQQKTTLTGTVLDETGEPIIGANILVKGTTNGTTTDLDGHFSLDVDRIPATLIISY
IGYGKQEIKATAGKILKVVMAPDNNVMEEVVVTGYGTFKKSAYAGSASTVKADKMKDIPA
VSFKDLLQGNAPGVQFSSSSGQPGASSSLNIRGMGSFNASNSPLYVIDGIPMRSGSINTM
SSDAGLDIMSTINSSDIENITIIKDAAAASLYGSRAANGVVLITTKKGKSGKPQISFKAD
WGSSDFAMDYRPVMGGEERREYIYNGLVAGALRDGNSHDEAIAYANENIDDYAPVPWCGY
VDWDDIMFKKGNHQTYEASISGGTDKFKYYSSISYLKQEGIAINSGLERISGRLNVDYQA
TDKLKLGANMLFATVNQDVYGEGTSYTSPFYSSRNAVVPSDTPYNEDGSWNRDFIRNGDR
NPLLSATYDYQREYVNRAFNTIYGEYEFIKNLKFKSTFSYDYTNTKGKDWSDPRTSNGED
VNGGMSKKFYEYKKMVWANQLSYKFNIANDHHFDALVGYEIDDQYRDYLSGYATNFATAD
KDEISNGMKTESVGGSSTRTRMVSYLTRVNYDYKNKYYLGGSFRTDGSSRLHKDSRWGSF
WSVSAAWRMIEEEFMNPAKGWLTDLKIRASYGVNGTLPSDYFGYMGLSSLTNGYLEQPGI
IQSQIKNTDLKWETNYNLNLGLDFSLFNRINATLEYYTRTTKNLLMDRPISMTTGFGSYL
MNIGEVKNKGVELEISSTNIKTKDFSWNTTFNISHNKNEIVTLDGMQTEIISGTQIRKVG
KSYRTFYMIEFAGINPETGAPQFYTNDLDENGNYIKEITEKYSEANAIVLDKHAEPNVIG
GLSNTLRYKWFDLNFMFSYQFGGYSYDNWAQKTEHGGNDLEANIPTYYRDSWKQPGDITK
YELFIESPDVAMNKSTTTRRLHSSDFIRLKTLTFGITLPQVWTQKIGVNNVRVYASANNL
WTWAAYDYYDPEAVSGGSAIWGTPPLKTVTFGLSVNF
NT seq
3354 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaaaaaacacaactacaccaatcacggtaaaagtagtaaacgtttgtggattacg
ttcctatttttctgtatcattaccacaggttttatgcaggctgccaacaaagtgtttgca
caagccactgtcacagcctcattcaagaatgccacgttgagtgaaattctttgggaaatc
caaagacaaaccgactttacttttgtatacagcaccaatgatgtaaaacaaataaaagtc
caaaacctaaatgtaaataacgaaaaaatagccaatgtgcttgataaatgtcttatgaat
agcggtttgacctattcagttcacaacggcgttattgctatcaagcaaattgaagaaaaa
gagtctgctgttcctcaacagaaaacaacattaaccggtacagtactggatgagacggga
gaacctattattggagcgaatatcttagtcaaaggtactacgaatggaactactacagat
ttggacgggcacttctcattagatgtagaccgtatacctgccactttgattatctcctat
ataggttatggcaagcaggaaattaaagccactgccggaaagatactgaaagtagtcatg
gctcctgataataatgttatggaagaagtggttgttaccggttatggtactttcaagaag
tcggcatacgcagggtctgcttctactgtgaaggctgataaaatgaaagatattccggct
gtttcattcaaagatttactacaaggtaatgcacccggggtacaattcagttcatcgtca
ggtcaaccaggagcttcttcctctttgaatattcgcggtatgggatcttttaatgccagt
aattctccattatacgtaattgacggaattcctatgcgttcaggttctatcaatacgatg
agttcagatgcaggtcttgacattatgtcaactatcaatagctctgatattgaaaacata
acaatcattaaagatgccgctgccgcctctctctacggttcacgtgctgccaatggtgta
gtacttattactactaaaaaaggtaaaagtggaaagccacaaatttcattcaaagcagat
tggggtagttctgatttcgcaatggattatcgtcctgttatggggggagaagaacgccgc
gaatatatttataacggtctagtagccggtgcgttaagagacggaaatagtcacgacgaa
gccatagcatatgctaatgaaaatattgacgattatgctcctgttccttggtgtggatat
gtcgattgggatgatatcatgttcaaaaaaggaaatcaccagacttatgaagcctccatt
tctggtggaacagacaaattcaaatattattcatctatctcttacctaaaacaagaaggt
attgctatcaactccggtttagaacgtatcagcggacgtttaaatgtagattatcaagca
actgataaattaaaattaggggcaaatatgttatttgctaccgttaatcaagatgtatat
ggtgaaggtacctcctacacttctcctttctattcatcacgtaacgctgttgtcccctca
gacacaccatacaatgaagatggaagctggaaccgcgattttatccgcaacggtgatcgt
aatccactattatctgcaacttacgactatcaacgtgaatatgttaatcgtgctttcaac
actatttatggcgaatatgaatttattaaaaacttaaaattcaaatcaacattcagctat
gactacaccaacactaaaggcaaggattggagtgatccccgcacttccaatggtgaggat
gtaaatggcggcatgagcaaaaaattctacgaatacaagaaaatggtatgggcaaaccaa
ctgagttataagtttaatatagccaacgatcaccattttgacgcattggtaggttatgaa
attgatgaccaatatcgtgactatctgtcagggtatgcaactaatttcgctacagcagac
aaagatgaaataagcaatggtatgaaaaccgaatccgttggtggcagctctaccagaacc
cgcatggtatcttatctgacacgtgtaaactatgactataaaaataaatattatctaggt
ggtagtttccgtactgacggtagttcccgtttgcataaagacagccgttggggtagtttc
tggtcagtatctgccgcatggcgtatgattgaagaggaattcatgaatccggccaaaggt
tggctgaccgatttgaaaatacgcgcatcttatggtgtcaatggcacactaccatctgac
tatttcggatatatgggtttgagtagtttaaccaatggttatttggaacaaccgggtatt
atccaatcacaaatcaaaaatacagatttaaaatgggaaaccaattacaaccttaactta
ggtctggatttcagtttgttcaatcgtataaacgcaactttggaatactacactcgtact
actaaaaatttgttgatggatcgtcctatctctatgacaacaggtttcggcagctatctt
atgaatattggtgaagtaaaaaataagggagtggaattggaaatcagttcgaccaatata
aagactaaagatttctcttggaataccactttcaacatctcgcacaacaaaaatgaaatt
gtgacattggatggcatgcaaacagaaattatcagtggtacccaaatacggaaagtagga
aaatcataccgtacattttatatgatagagttcgcagggatcaatcccgaaacaggcgct
ccccaattctataccaatgatttggacgaaaacggcaactatataaaagagattacagaa
aaatatagtgaagccaatgctattgtattagataagcatgcagagcctaatgttatcgga
ggtttatcaaatacattacgctataaatggttcgacttaaacttcatgttctcttaccaa
tttggcggttattcttatgacaattgggcacaaaaaacagagcatggtggtaacgaccta
gaagcaaatataccaacctattatcgcgatagttggaaacaacctggtgatatcacaaaa
tatgaactatttattgaaagtcctgatgtagcgatgaacaaatccactactactcgcagg
ttacacagttctgacttcatccgcctgaaaacattaacttttggaataactctgccccaa
gtatggacacaaaaaataggagttaacaatgtacgtgtatatgcttccgcaaacaacctt
tggacatgggctgcttatgattattatgatcctgaagctgtcagtggtggtagtgccatc
tggggaactcctcctttgaagactgtaacctttggtctaagcgttaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system