Borrelia venezuelensis: bvRMA01_000512
Help
Entry
bvRMA01_000512 CDS
T08848
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bvw
Borrelia venezuelensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
ApoLp-III
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA12176
LinkDB
All DBs
Position
520010..526699
Genome browser
AA seq
2229 aa
AA seq
DB search
MIDFVTVLVNLLLVFVILFIYRQYDRRSRALDKIKKFIDIAKDNLEDFIDEKTKEINNLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIDEVQRKIKDKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKELDDMALKVQDNIQ
RLQVDGKIVDKLSKTLKNFNTQIDSIDSRLSTVFEKFDKTNKENLETIKIESWDKFDNTI
KDFSVRMDNLDRELISYQESLVMIEEKKREILDKGNEKLENEFKEFVFKIESSIDNYNKS
MEDSFGIYETKYKSIENSLDLIVEQAKTKINDKEDFILTRLNEELQIKFDEVFMYVDERS
HQMRDKLEGKLVLIDNEISSLSSVFKDNTYSRLNSLEETIRQEMRQYEEQLADILEQFRV
QIESSVGDIYKEYDSKINQFDKDIRDRIESSLKDANSRIESVQGGVRTLLDDLEKDSNKI
YVEFKDKVKGDIDSFSENVFSRMNDVGSELELKLSNISTDIQDRIAKLDSSLYSELKEMN
EKFVNDYSCLDGSINLKYETLLEALNLKSGELETQLKDKYKNIADKFERDIDDLTIKCDE
NFSKISEKSDYDYQNFEITSTKLKESISSLNDLLVQDFETLKGDFKSKLSKMSADINDEV
FNLKSHYGEDISEFIKQMEADKLQYEHWQREVGLNLEDIKSHLNKTNEEFLNLIENQRTK
GKELSENIFNELSEHIQKKAMDMHTNWKDELIILNKSLLDIKISSEELLLSASSKIDSFE
KDVNERLEYVTSKTEDFENSVLDKYKELRDMSYNNSEETLSGIKEFIDNQAEIIHDKIIM
MLNGLNEDFSNKEELIKGNIEELDYRLKDFKVGCEDVLNNLRSDLDGFIESRMQKVSEIK
IDNQKQIDNFLNRISEDILSKRDMLNSEIDNKLNDWQGKLSEISVNIENVLSSGKIDINS
IDSEMTLKIKDLKSTFEGLESYYLEKIDEFRNQGNVYADELLKNIMSHFDTDTKDLEESL
SKKFATVLERSEEFVKEVDSLLKDKRTDIASFQASIDITIDSLNSRFNDVNREINEKYSK
VISDSRGYSETLANKLENEIGYEIENVNRRLTDKIDILSKNMDENLENFKSSFDVSKYQV
ENFEIKIKDIIEKEELRLGELLREIERQYRVRRDEAIDYKKAIDSDIVQLREQFIGVINE
LKNNIEDKSEFLNDLYKERFKIIENNFEERYSTFFIESEGAISKIRDEIYKILTDNDEHL
RAKISEMDLNFEIIDGRSKEILELEEDLRKRIQENSNNIHHQFDVIKSGLEKEIKDHFDM
YMMKATAAIDEEIEKYEHGINEKISALKSIENNFEMIEKNLKDKISEYHNKLDETLDVRY
AEIESKYDERHLLVEKKINDKTNSVEELIANKYAELEGKYDEKHLLVEKKINDKANSVEE
LIANKYAELEGKYDEKHLLVEKKINDKTNSVEELIASKYAEIESKYSNMHLDMESRFNAC
ISDLGIELARSSEKMDKEIEEQLKNLGELKLSLSNIEGDVLKLKEDSYHNVSSHLKLLEE
DFFKDLKERSDNLKNSLENFVASSDQRIENLERHIIKNLEDKEILMKNFRVEIEQELMLN
KESFYSEFNKEFDVRKRDTESKIFVMETNVTNRIDEFIKLVDNRQNNVDSWFLKVKDDMI
NWQENAYKELEERAGITKRNLDEIKSDVFAIESGLEVIKDGVNQRAKEIFDRLQSDIKDF
ENRSYLNLKNISEEVQSKVLNIEDFMDFKIKSINDKIDSHIEELATQVEIKFLSQQKDIE
DKIIEANDKLEYEFNSMASRLDEEKQNIVSKFLNDTGGFESQVQLMQDDVLKLTEKVNAY
RIDIEKTIRENYDSFSSSIREEYTVFENEVKNSLNYSEEEIQALRDSLKVQVNSIESEFK
DKYDLMIKGIDDHVSQLKLKVLNYDGELNHFIDEVKNNLIVYKADLREELDSRYAVMSAK
LENFKRLEVELERNNELMKEVYYFKNNLEELRETLASEINLIQGYKGDFEGITREIGDIK
SKSLDIIEVFNDLKVHQMDIEGIKKDLTQFLEFYTSFKERYKKFTESYDEMQIYKTKLKE
IKEAQSNILDNYDRISNKDSILKSTLESVDKNFDLINEIESKMHVLFKESSGFQQSLGEL
KGIMSELLVNKDLSQEVLNNVQTLKEMLGEIESKLEHTRNIREKVAKSETRLENLNIAAE
ERIKTLGILVKTESKYKDNVGLNNETVRDSVIKLMRQGWSALEISRATKLSIGEVELILE
LGIISKSDD
NT seq
6690 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgtaaccgttttggttaatcttttattggttttcgtgattttatttatt
tataggcagtatgatagacgttcaagggctttagataagattaaaaaatttattgatatt
gctaaggataaccttgaagattttattgatgagaagacaaaagaaatcaataatcttgct
gttgatatggaagcgtatcaacgttctagtatagagatcataaaaaaaatagatgaagtt
cagcgaaagattaaagataaaagtaatgattttgcagaagttgaaaaaaagattgcttat
catgattctatgcttaaagagctagatgacatggcccttaaagtgcaagataatatacaa
cgacttcaagtggatggaaaaatagtagataaactttcaaaaactttaaaaaattttaat
actcagattgattctatcgattctaggttgagtacagtttttgaaaaattcgataagaca
aataaggaaaatcttgagactatcaagattgagagttgggataagtttgataacactatt
aaagattttagtgtgagaatggataatctggatagagagcttatatcttatcaagaatca
ttggtaatgattgaagagaaaaaaagagaaattttagataagggtaatgaaaagcttgag
aatgaatttaaggagtttgtgtttaaaattgaatctagcatagataattataataaatca
atggaagattcttttggtatatatgaaactaaatataaatcaatagaaaattctcttgat
cttattgtagagcaagctaagactaaaattaatgataaggaagattttattttaactaga
ctgaatgaggagctacagataaaatttgatgaagtttttatgtacgtcgatgagcgttct
catcagatgagagataaactcgaaggcaaattggtattaatagacaatgaaatttcttct
ctgagttctgtttttaaagataatacttattctaggctgaattctcttgaagagactata
agacaagagatgagacagtatgaagagcaattagcagatattttggaacaatttagggtt
caaattgaatctagtgttggtgatatttataaagaatatgatagtaagataaatcaattt
gataaagacataagagataggatagagagtagtttaaaagatgctaattctaggatagag
agtgtccagggtggagttaggactttgcttgatgatcttgaaaaggattctaataagata
tatgttgaatttaaggacaaagttaaaggggatattgatagttttagtgaaaatgtattt
tcaagaatgaatgatgttggaagtgagttggaattgaaactttcaaatatcagtacagat
attcaagatagaattgccaagttggatagtagcttatattcagagcttaaagaaatgaat
gaaaaatttgttaatgattattcgtgtttagatggtagcattaacttaaagtatgaaact
ctcttagaagctctgaatttaaaaagtggtgaattagaaacccaactgaaggacaagtat
aaaaatattgcagataaatttgagcgtgacattgatgatcttaccattaaatgtgatgaa
aattttagtaaaatttctgaaaaatcagattatgattatcaaaattttgagattactagt
acaaagctaaaagaaagtataagttctttaaatgatttgttagtacaagactttgagact
ttaaaaggagattttaaatccaagttgagtaagatgagtgctgatattaatgatgaagtg
tttaatttaaaaagtcattatggagaggatataagtgaatttattaagcagatggaagct
gacaaattgcaatatgaacattggcaaagggaagtaggtttgaatttagaggatattaag
tctcatttaaataaaactaatgaagaatttttaaatttgattgaaaaccaaaggactaag
ggaaaggaacttagtgaaaatattttcaatgaactctcagaacatattcaaaaaaaagca
atggatatgcatactaattggaaagatgagcttattattttaaataaatctttacttgat
attaagatttcaagtgaagaattacttttatcagcttcttcaaagatcgattcttttgaa
aaagatgttaatgagagacttgaatatgtcacatcaaagacggaggactttgaaaattca
gtattagataagtataaagaattaagagatatgtcatataataacagtgaagagacttta
tcagggattaaggaatttattgataatcaagccgaaataattcatgacaaaattattatg
atgcttaatggacttaatgaggacttttctaataaagaagagttaattaaaggcaatata
gaagaacttgattatagacttaaagatttcaaagttggatgtgaagatgttttaaataat
cttagatcggatcttgatggatttattgaatctaggatgcaaaaagtttctgaaattaag
atagataatcagaagcagatagataattttttaaatagaatatcagaagacatcttaagt
aaaagagatatgcttaatagtgaaatagataataaacttaatgattggcaaggtaagtta
agtgaaatatcagtgaatattgagaatgtgttatcttcaggaaagattgatataaactca
attgattctgagatgactttaaagattaaggatcttaagagtacttttgaagggcttgag
agttattatcttgaaaaaatagatgagtttagaaatcaaggaaatgtatatgcagatgaa
cttctgaaaaacattatgagtcattttgatacggatactaaggaccttgaggaaagtttg
tctaagaaatttgctacagtcttagaaaggtcagaagagtttgttaaggaagttgatagt
ttgcttaaggataaaaggacagatattgcttcatttcaggcaagtattgatattactatt
gattctcttaattcaagatttaatgatgtgaatagagaaattaatgaaaaatatagtaag
gtaatatctgattctagaggatattcagaaacccttgcaaataaattagagaatgagata
ggatatgagattgaaaatgtaaatagaaggttaacagacaaaatagatattcttagcaag
aatatggatgaaaatttagaaaattttaagtcatcttttgatgtatcaaagtatcaggtt
gaaaattttgaaattaaaattaaggatataatagaaaaagaagagctaagacttggtgaa
ttactcagagaaattgagcgacagtatagagttagacgggacgaggcaattgattacaag
aaggccatagatagtgatattgttcagttaagagaacagtttataggagtaattaatgaa
cttaagaataatattgaggataaatctgagtttttaaatgatctttataaagaaagattc
aagattattgaaaataattttgaagagagatattcaacattttttattgagagcgaaggg
gctatttcaaagattagagatgaaatatataagatacttacagataatgatgaacatttg
agagcaaaaatttctgagatggatcttaattttgagataatcgatggaaggtcaaaagaa
attttagagcttgaagaagatttaagaaagagaatacaagaaaatagtaataacatacat
catcaatttgatgtcattaagtctggtcttgagaaggaaataaaagatcactttgatatg
tatatgatgaaagccactgctgcaattgatgaagagattgaaaaatatgagcatgggatt
aatgaaaagatatctgctcttaagtcaattgaaaataattttgagatgatagagaaaaat
ttaaaggataaaattagcgaatatcataataaattagacgagactcttgatgtgagatat
gctgagattgaaagtaaatatgatgagaggcatttgcttgtagagaagaagataaatgac
aagactaattcagttgaagagctgattgcaaataaatacgctgagcttgaaggtaagtat
gatgagaagcatttgcttgtagagaagaagataaatgataaggctaattcagttgaagag
ctgattgcaaataaatatgctgagcttgaaggtaaatatgatgagaagcatttgcttgta
gagaagaagataaatgacaagactaattcagttgaagagctgattgcaagtaaatatgct
gagattgaaagtaaatattctaatatgcaccttgatatggaaagtagattcaatgcatgt
atttctgatttaggtatagaacttgctcgttcaagtgaaaagatggataaagagattgaa
gaacaattaaaaaatcttggtgaacttaagttaagtttgagtaatattgaaggagatgta
ttaaaacttaaagaggattcttatcacaatgtgtcatcccatctcaaacttcttgaagag
gatttttttaaagatttgaaagaaagaagtgataatttaaaaaattctttagaaaatttt
gtggcatcctcagatcaaagaattgaaaatttagagagacatataattaagaacttggaa
gataaagaaatccttatgaagaattttagagttgaaattgaacaggaacttatgcttaat
aaagaaagtttttactcagaatttaataaagagtttgatgttagaaaaagagatacagag
agtaaaatatttgtaatggaaactaatgttactaatcgaatagatgagtttattaaactt
gtagataatcgtcaaaataatgttgattcttggtttttaaaagttaaagatgatatgata
aattggcaagaaaatgcttacaaagagcttgaagaaagagcgggcattacaaaaaggaat
ttagatgaaattaaaagtgatgtttttgctattgagagtggcttggaagttattaaagat
ggtgttaatcagagagcaaaagaaatttttgatcgtttgcaatcagatattaaggacttt
gaaaatagatcttatcttaacttgaaaaatatttcagaagaggttcagagtaaagtttta
aatattgaagatttcatggattttaagattaaatctataaatgataagatagactcacat
attgaagagcttgcaacacaagtggaaattaaatttttaagtcagcaaaaagatattgaa
gataaaattattgaagctaatgacaagttagaatatgaattcaattcaatggcttctagg
cttgatgaggaaaaacaaaacattgtaagtaaatttttaaatgatacaggcggttttgaa
tctcaagttcaattgatgcaagatgatgttttaaagcttactgagaaagtgaatgcatat
agaattgatattgagaaaacaattagagaaaattatgattctttttccagttctataaga
gaggaatatactgtgtttgagaatgaagttaagaatagtttgaattattcagaagaagag
atacaggctttaagggatagcttgaaggttcaagttaatagcatagaatctgaatttaag
gataaatatgatctaatgattaaaggtattgatgatcatgtgtcccaacttaagttgaaa
gtattaaactatgatggtgagcttaatcattttatagatgaggttaagaataatttaatt
gtatacaaggctgatttgagagaagaacttgatagtcgttatgctgtcatgagtgctaag
cttgaaaattttaagagacttgaagttgagttagagagaaataatgagctgatgaaagaa
gtttattatttcaagaataacttagaagagttacgggaaactttagcaagtgaaataaat
cttattcaaggatataaaggtgattttgaaggtattactagagaaattggagacattaaa
tctaaatcattagatattattgaggtatttaatgatttaaaggtccatcaaatggatatt
gagggaattaaaaaagatcttactcaattccttgaattttatacttcttttaaggagagg
tataagaaatttacagaatcttatgatgaaatgcagatttacaaaactaaacttaaggag
ataaaagaagcacaaagtaatattcttgataattatgataggattagtaataaagatagc
atattaaagtctacattagaatctgttgataaaaattttgatttgataaatgaaatagag
agtaagatgcatgtattatttaaagagagttctgggtttcagcagagtcttggtgagttg
aaaggcattatgtcagaattattggtaaataaagatttatcacaggaagtgctaaataat
gttcaaacgctcaaagaaatgctaggtgagattgagagcaagttggaacatactagaaat
ataagagaaaaggttgcaaaatctgagactcggttagagaatttaaatattgctgcggaa
gagagaatcaaaacccttgggattcttgtaaaaacagaatctaagtacaaagataatgtt
ggtcttaataacgaaacagttagagattctgtcattaaacttatgagacaaggttggagt
gccttggaaatttctagggctactaaattatctattggagaggttgagcttatcttagaa
cttggaattattagtaaaagtgatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system