Candidatus Blochmannia vicinus (nom. nud.): M9408_01930
Help
Entry
M9408_01930 CDS
T08509
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel MscM
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
bvx
Candidatus Blochmannia vicinus (nom. nud.)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bvx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bvx02000
]
M9408_01930 (mscM)
Transporters [BR:
bvx02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
M9408_01930 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MscS_porin
MS_channel_2nd
MS_channel_1st
MS_channel_3rd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URJ32773
LinkDB
All DBs
Position
complement(460552..463941)
Genome browser
AA seq
1129 aa
AA seq
DB search
MISFQKKTIFFEYFSSLIFIVGCLYPLILFSYDFSKEHEIKKYLQYAQQQEHFDIHQKSI
IKSLQSTLDFISERNFSNVKIREYQKIIDDFPCTILQLHREYSNICNQSINIYKNLSTHE
LKQKLFQINNQLTDLSKQLKQEQNYISSINESLILLLKQQTTVKNILNNLAQQHILSITN
KNTPIEEAKFMALQAEQVAKQLKVAELELAQLSANNHKELSQLRTVFLKKKYKYVDNEPQ
ILRNKLSYLCQHESKQPIKYSEKILSEQNNTLPKSIIKQIQTNHDLSITLNQQAHYITSI
ISKQQEATSYTLQVRQTFANLLEQAQWLDKSPALGETLRSQVSKLPKMPKFQQLDHDMAQ
LRAKRLQCENQLNKLTLISSQSKQDDGSSLTLLQKHILEKKLIIQRNLISALLDNYDTQI
LELTKLKISYEQLKEALQDIQKATHRHLFWVADVHPITISYPLDIYHDLYRLLTANKFDR
QIMHVLKMTFSNQKTLILIILCFIASIGFHFTAQRHYQEFLNRSSKKIGKVNQDNFLLTL
YNIWYSMLIALPIPILWAIIGHTLNHAWLYPISVEISDEINATTFILWVFIVGVYFAFPK
GLFIIHFGWPKKRVQQVFSHHYIWAVVTVVFLIMMLTIFNNYNDREFSNTLGRLCFILLC
IYLTFITNNLKCSGLPLYLNKYDSSDNIINYSLWNFMICAPIIAAISCILGYLFAAQALL
ARLETSLFIWIMLLIIYHIIRRWTSIQRRRIAFERAKQKRVTQLNLRAYNNESNAYQLQT
NKLVSNDKNNKKILDLDTISTQSLQLIRSIITLIALLLTTLLWSELYSAFSFLENITLWD
VTSTIKGVDNIQPITLNSFIISVLVIVITTKTVRNLPAFLELTFLQHLDLTPGTGYAITT
LTKYILMFLGGIIGCSLIGIEWTKIQWLVAALGVGLGFGLQEIFANFISGLIILFEKPIR
IGDTVTISNLTGNITRINTRATIITDWNHKEIIVPNKEFITKQFINWSLSDTLTRVVLRV
PAPLQTDTKKIVQILLQIVQNSSLALNTPPPEVYLVDLQQGLPIFEIRMHISDIKLRMPL
CHQIHMLIIEYYQNNGLKLPYIPIYSYNNQLFVNNFDSNYPNANYYTTK
NT seq
3390 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatctcttttcaaaagaaaaccatattttttgaatatttttcttcgttaatatttatt
gtaggatgtttatatccactgatactattttcttatgatttttcaaaagaacatgaaatt
aaaaaatatttacaatatgcacaacaacaagaacattttgacattcatcaaaaatccatt
ataaaaagtctacaatctactttagattttatttctgaaagaaacttttctaatgttaaa
attagagaatatcaaaaaataatagacgattttccgtgtacaattcttcaattacacaga
gaatatagcaatatatgtaatcaaagtattaatatctataaaaatctttctactcatgaa
ctgaaacagaaattattccaaattaataatcaattaacagatttgtcaaaacaattgaaa
caagaacaaaattatatatcttcaattaatgaatcattgatactattactaaaacaacag
actacggttaaaaatatattaaataatttagcgcaacaacacatattatctattacaaat
aaaaatactccgatagaagaagccaaatttatggcattacaagcagaacaggtagctaaa
caactaaaagtagccgaactcgaactcgctcaattaagcgccaacaatcataaagaatta
tcccaacttcggacagtatttttgaaaaaaaaatataaatatgtagataatgaaccacag
atattaagaaacaaattaagctatttatgtcaacacgaatcaaaacaacctattaaatat
agcgaaaaaatattatcagaacaaaataatacattaccaaaatccattataaagcagata
caaaccaatcatgatctttcaattactttaaatcaacaagcgcattatataaccagtatc
atatctaaacaacaagaagcaacatcatatacattacaagtacgtcaaacttttgcgaat
ttacttgaacaagcgcagtggttagacaaatctccagctcttggagaaacattacgttct
caagtttctaagttaccaaaaatgcctaaatttcagcaactagatcatgatatggcgcaa
ttaagagccaagcgtcttcaatgtgaaaatcagttaaataaattaacattaatatcatca
caaagcaaacaagacgatggatcatcattaacattactgcaaaaacatattcttgaaaaa
aaactaattatacaacgtaatcttatctctgcattattagacaattatgatacacaaatt
cttgaattaacaaaattaaaaatttcttatgaacagcttaaagaagcattacaagatata
caaaaagctacgcatcgtcatttattttgggtagctgatgtacatccaattactatatct
tacccgttagacatttatcatgatttatacagattattaactgcaaataaatttgatcgt
caaataatgcatgttttaaaaatgactttttctaatcagaaaactttaatactaataata
ttatgttttattgcatcaattggatttcattttactgcacaacgtcattatcaagaattt
ttaaaccgatctagtaaaaaaataggcaaagtaaatcaagataattttttgcttactttg
tataatatatggtactcaatgttaatagcattaccaattccaattttatgggcaattata
ggacatactttaaatcacgcttggttataccctatttctgtagaaattagtgatgaaatt
aatgctacaacctttatattgtgggtatttatagtgggcgtttattttgcgtttccaaaa
ggattgtttattatccattttggctggccaaaaaaaagagttcaacaagttttttcacat
cattatatctgggctgttgtaacagttgtgtttttaataatgatgctaactatatttaat
aactataatgatagagaattttctaatactttgggacggttatgctttattttgctatgt
atttatttaacattcattaccaataatctaaaatgttctggattgcctctatatttaaat
aaatatgattcttccgacaatatcatcaattattctttatggaattttatgatatgcgcg
ccaataatagcagcaatttcttgtattttaggttatttatttgctgctcaagcattatta
gcacgattagaaacatcattatttatttggattatgttgttaatcatataccatattatt
cgtagatggacatccattcagagacgtcgtattgcttttgagcgagctaaacaaaaacga
gttactcaattaaatctaagagcatataataatgaatcaaatgcttatcaattacagact
aataaattagtatctaatgataaaaacaataaaaagattttagatttagatactattagt
acgcagtcattacaattaatacgatctattattactctcatcgccttattattaaccact
ttattatggtctgaattatattcagcattctcttttttagaaaatattacattgtgggat
gttacttctactataaaaggcgtagataatatccaacctataacgttgaattcatttatt
atttctgtcttagtaatcgtcattactacaaaaacagtaagaaatttgccagcgtttcta
gagctcacttttttacaacatttagatcttacgccaggcacaggatatgcaattactacg
ttaactaaatatatattgatgtttcttggagggataataggatgttcattaataggtata
gaatggactaaaatacaatggttagtagcagcattaggtgtaggattaggttttggatta
caagaaatttttgcgaatttcatctctggattaataatactatttgaaaaaccaattcgt
attggcgatactgtaactattagcaatcttactggtaatatcactcgcattaatactcgt
gcaactatcattactgattggaatcataaagaaattattgttccaaacaaagaatttatt
acaaaacaatttattaattggtctttatcggacacattaacacgtgtagtattacgtgta
ccagctccgttacaaacagatactaaaaagatagtacaaatcttactacaaatagtacaa
aattcttctcttgccttaaatactccgcctccagaagtatatttagtagatttacaacaa
ggattacctatatttgagatacgaatgcatatatcagatataaaacttcgcatgccttta
tgtcatcaaatacatatgttaatcatagaatattaccaaaataatgggttaaaactacca
tacatacctatatattcttataacaaccaattatttgtcaacaattttgattctaattat
cctaatgcaaattattacacaacaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
