Borreliella yangtzensis: QIA34_01045
Help
Entry
QIA34_01045 CDS
T09301
Name
(GenBank) endonuclease MutS2
KO
K07456
DNA mismatch repair protein MutS2
Organism
byn
Borreliella yangtzensis
Pathway
byn03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
byn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
QIA34_01045
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
byn03400
]
QIA34_01045
DNA repair and recombination proteins [BR:
byn03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
QIA34_01045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
Smr
MSSS
AAA_21
Formyl_trans_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKC74010
LinkDB
All DBs
Position
complement(94231..96567)
Genome browser
AA seq
778 aa
AA seq
DB search
MQDKYLKNIDFYEILSLVSEYVSNPDTVNLLNKQKILKTRESLEKMFSFVSLIRMLFESC
KGYPNSFINSLEYSISLLSKENSRASIEDLRDIVKFLDEVLKINLFLHKNSDIKHLNTQI
LFDLLFLSPELKNLLSELKKYVDFDALELKNGVVKEYDSVEFEIKNLNRRIEKQIKKIIN
LNIEYLASNFVYYKSNKYTLALKSNFKGKIKGNIISVSSSGETFYIEPNDVVNDNNKLNY
LNLEKERIILKILQNLSDKVRTNIVLLDNLYNNFLYYDSLKVRAIYGIKTKGIFPKISNV
LNIFDAYHPLLKAPKAITFTSFENRVVIITGPNAGGKTVTLKTVGLLSAMFQFGIPIVVG
ESSTFKIFDNIFIDIGDEQSIYNSLSTFSSHMSNISYILKHTTKNSLVIFDEFCSGTDID
QGQALAISILEYLIDINSYVLISTHYNALKYFAYTHEGVVNASMCMNLETMQPNYNLIFS
IPGESYAFNVASKVLIDSSIVIRANEIYLSQKTEVNKILERLIEKEKDLLLTKESMDKKL
IQIELQEKEIKNIYQNLLLKEKNIEIKLLNEQNEFLKNSRKVLENLVREIKEGNIDVSKN
KAFISDLEKNVDLKLNKVNSLNNKRNIVRDFKIGDRVRIVNSNAKGRIVGMSKKKIIVNV
GTFNVSVSSSEISLEKVIEHKKEGGKNFSFSIDYNKEILLSFTVDIRGMRVVDALDFLNK
KIDNIILNDINKFEIIHGKGEGHLMREVHKLLKELKFVKKYYFAHPSDGGAGKTIVEI
NT seq
2337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagataaatatttaaaaaatattgatttttatgaaattttatctttagtatctgaa
tatgtttctaatccagatactgttaatttactaaataaacaaaagatattaaaaacaaga
gaaagtttagagaaaatgttttcctttgtaagtctaattagaatgctttttgagagttgt
aaaggatatccaaattcttttataaatagcttggaatattccatttcattattatcaaaa
gaaaattcaagagcttctattgaagatttaagagatattgtaaagtttttagatgaagtt
ttgaaaataaatttatttttgcataaaaatagtgatatcaaacatcttaatactcaaatt
ttatttgatttattatttttaagtcccgagttaaaaaatttgcttagtgaattgaaaaaa
tatgtagattttgatgctcttgaattgaaaaatggtgttgtaaaagaatatgattcggtt
gaatttgaaattaaaaatttaaatagacgaattgaaaagcaaataaaaaaaataattaat
ttaaatatagaatatttggcttctaattttgtttattataaatcgaataaatataccctt
gctcttaagtctaattttaaaggtaaaattaaggggaatattatttctgtttcgtcatcg
ggtgaaacgttttatattgaaccaaatgatgttgtaaatgataataataagttaaattat
ttaaatttagaaaaagaaagaataattttaaaaattttgcagaatctttctgataaagtt
cgtactaatattgtccttttagataatctttataataattttttatattatgattctcta
aaagtacgagcgatttatggaatcaaaaccaaaggaatattccccaagatttcaaatgta
ttaaatatttttgatgcataccatcctttgttaaaggctccaaaggcaataacttttacg
tcttttgaaaatcgtgttgtaattattactggacctaatgctggtggaaaaacggtaact
ttaaagacagttgggctacttagcgcaatgttccaatttgggattcctattgttgttggt
gagtctagcacttttaaaatttttgataacatttttattgacattggcgatgagcagtca
atttataattctctttcaactttttcaagtcatatgagtaatatttcctatatcttaaaa
catactacaaaaaatagtcttgtaatatttgatgaattttgctcaggaacagatattgat
caagggcaggcgcttgctatttcaattcttgaatatttaattgatattaattcttatgtt
ttaatatcaactcattataatgctcttaaatatttcgcatatactcatgaaggcgttgtt
aatgcttctatgtgtatgaatttagagacaatgcaacccaattataatttgattttttcc
attcctggtgaaagttatgcgtttaatgttgctagtaaagttttgattgacagtagtata
gtaattcgtgctaatgaaatttatttatcccaaaaaacagaagttaataaaattttagaa
agattaatagagaaagagaaagatttacttttaactaaagaaagcatggataaaaaatta
atccaaatagagttgcaagaaaaagaaataaaaaatatttatcaaaatcttttattaaaa
gaaaaaaatattgaaataaagcttttaaatgagcagaatgaatttttaaaaaattcaaga
aaagttttggaaaatttagttagggaaataaaagagggtaatattgatgtttcaaaaaat
aaagcttttatatcagatttggaaaaaaatgtagatctcaagttaaataaagtgaattct
cttaacaataagagaaatatagtaagagattttaaaataggagacagggttagaatagtt
aattctaatgcgaaaggaagaatagttgggatgtctaaaaagaagattattgttaatgta
ggtacatttaatgttagcgtttctagctcagagatatctttggagaaagttatagagcat
aaaaaagaaggtggtaaaaattttagcttttcaattgattataataaggaaatcttgtta
agttttaccgttgatattaggggtatgagggttgttgatgctctagactttttgaataag
aaaatagataatattatattaaatgacattaataaattcgagatcattcatggaaaaggg
gaggggcatcttatgagggaagttcacaaattgttaaaagagttaaagtttgttaaaaaa
tattattttgctcatcctagtgatgggggggctggaaaaactatagttgagatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
