Bacteroides zoogleoformans: C4H11_12960
Help
Entry
C4H11_12960 CDS
T05371
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
bzg
Bacteroides zoogleoformans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
CILP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVM54128
UniProt:
A0ABM6TBI1
LinkDB
All DBs
Position
complement(3083737..3086835)
Genome browser
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MLSLLAMSIGIAWSQTTLRGVVTSSEENQPVVGASVLVKGTTVGTITDVDGRFRINNVPS
SAKTLLVSFVGMITKEVPIRSGSMDIVLDPDTKALDEVLVVAYGTTKRSAFTGSASVVGE
DQLKTPAASFDKSLAGQIAGVQVVSASGQPGSGTSFRVRGSGSLKASNEPLYVIDGVAVA
SYDKNSLSEIAYNNDSGTNILATLNPNDIENVTVLKDAAAAALYGSRAANGVVLITTKSG
KQGKAKVTLNTQYSWASLGKAYKMASSAEYYKMLFDSYHSEGNNVEESNARVQGTLTHNP
YNTANPLDANGKLVSGAKIVVDTDWQDEVFKTAATQDYTVNVSGSNDKTDYFFSVGYTNQ
DGIAPASDYKRYTGKANINSQATDWLKAGLNATFSHSIQNTTVAGSAGASPLYNSLRFPN
AVPVYIVDTDGNPVLDPNTKELQFNYSNPVSRDFNPLSIPHMDIHRSKFYRVLVSAYADF
TLYKGLNFKTTFSPDYVSTDEHRYWNKEHGNGPAYNGRLDKYHHVDLNYTSTNTLTYSNT
FNNLHSMNVLAGMEYWQSTFETLYAGGRDLLGSMQELAAAGGSFSPSSNTTKETLISYFG
RVEYAFADRYNLSASFRSDGSSVFGSDTKWGTFWSLGASWRMNQENFLKDKAWIDNLKFR
LSYGTSGNKNGLARYAALGLWEASSDYKYGNSVGVGHTQLVNALLSWEKQGMFNVGIDFG
FWNRVYGSLDYFYKTSDGLLYDYPLAYTNGFTSITMNAAKTANSGFELSLGADILKSPVR
WSANLNASIIKDEIKDLHGDNDVTMTEYQKIWSIGGSQYEFYMPTWAGVDPQNGNALWYT
IDANGNRTTTNVYSNATKERQGRSTPDVYGGLTNTFGYKNFDLSIQLTYVIGGKIYDGLY
ANMMHDGSAVQNIHQDALNAWKTAGEHTNVPRFAVNNSTGSSSLSSRYLYDATNIRVKNI
TLSYTLPKNLGVFSKVVSNAKVWTSVDNLGAWFADSNYKGYSDIDIFGVQGYALYPSIPN
PKTLSIGANITF
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatcattgcttgctatgagcatagggatagcgtggtcacaaaccactttgagaggt
gtcgtgacttcttctgaggagaatcagcctgtagtgggtgcttctgttctcgttaaagga
actacggttggtactattacggatgtagatggtcgtttcagaatcaacaatgttccttcc
tcggcaaaaacgttgctcgtttcgtttgtgggtatgatcacaaaagaagtgccaatacgg
tctggctctatggatattgtgctcgatcccgatacgaaagcgttggacgaagtgttggtt
gtggcctatggtaccaccaagcgttcggcttttacaggttcggcttcagtagtgggtgaa
gatcagctgaaaactccggccgcttcgttcgataagtcgcttgccggacagatagcaggc
gtgcaagtagtttcggcttcgggtcagccgggttcgggtacctctttccgtgtacgcggt
tcgggttctctgaaggcttcgaacgaaccgttgtatgtgattgacggtgtggcagtggct
tcttacgataaaaactctttaagcgagattgcttacaacaacgattcgggtaccaacatc
ttggcaaccctcaaccctaatgacattgagaatgtgactgtgctgaaagatgcggcagct
gcagcgctttatggctcgcgtgctgccaacggcgtggtgcttatcaccaccaagagcggt
aagcagggcaaggctaaagttacattgaacacgcaatactcgtgggcatcgctgggcaag
gcttataaaatggcgagctcggccgaatattacaaaatgttgtttgacagctatcacagc
gaagggaacaacgtagaagaatcgaatgcccgtgttcagggaactttgacacacaatcct
tacaacacggccaatccgctcgatgccaatggtaaattggtaagcggtgcaaagattgtg
gtagataccgattggcaggatgaagtgtttaaaactgccgccactcaagattatacggta
aacgtaagtggttcgaacgataagaccgattactttttctctgtgggttataccaatcag
gatggtattgctcctgccagcgattacaaacgttatacaggtaaggccaacatcaattcg
caggctaccgattggttgaaagcaggtttgaacgcaactttctctcactctatccagaat
actaccgtagccggttcggccggtgccagccctctgtacaactcgttgaggttccccaat
gcggtacctgtttacattgtcgacactgatggtaatccggtgttggatccaaacacgaag
gagttgcaatttaattattccaatcccgtgtcacgcgattttaaccccctgagtattcca
cacatggatattcaccgcagtaaattctaccgcgtgctcgtttcggcttacgccgacttt
acgctctacaagggattgaatttcaagaccactttttcgcccgactacgtatcgaccgac
gagcatcgttattggaataaggaacatggtaacggtccggcatacaacggtcgtttggat
aaatatcaccatgtagatttgaactatacttctaccaacacgctgacttacagcaacaca
ttcaacaatttgcacagcatgaatgtacttgccggcatggagtattggcagagcacgttt
gaaacattatacgcgggcggtcgcgatttgcttggctccatgcaagagttggctgctgcc
ggcggttcattctcacccagttctaacactaccaaagaaacattgatttcttacttcggc
cgtgtggaatatgcttttgccgacagatataatttgtctgccagctttcgctctgacggt
tcgtccgtatttggttccgataccaagtggggtacgttctggagcttgggcgcaagctgg
agaatgaatcaggaaaactttttgaaagacaaagcgtggatagataacctgaagttccgt
ttgagctacggtacatcaggtaataaaaatggcttagcccgctatgctgcattaggactt
tgggaggcaagttccgattataagtatggaaactctgttggtgtgggacatacgcaattg
gtgaatgcgctgctaagctgggaaaagcaaggcatgtttaatgtgggtatcgacttcggt
ttctggaatcgtgtgtacggctcgctcgattatttctataaaacttccgatggtttgctc
tacgactatccgttggcctataccaatggtttcacttcgatcaccatgaatgcggccaag
acagccaactcgggtttcgagctttcgttgggcgcagatatattgaaaagccccgttcgt
tggagcgccaacctgaatgcttcaataatcaaagatgagatcaaagatctgcacggtgat
aacgacgtgacgatgaccgaatatcaaaagatatggtcgataggcggcagccagtacgaa
ttttacatgcctacttgggccggtgtagatcctcagaacggtaatgctctatggtatact
atcgatgctaacggcaatcgcaccaccaccaatgtgtatagcaatgccaccaaagaaaga
caaggacgttctacgcctgatgtgtacggcggtctgaccaatacgttcggctataagaac
ttcgatttgtctatccagctgacttatgttatcggcggtaagatttacgatggtctgtat
gctaacatgatgcacgatggatcggcggttcagaatattcaccaagacgctttaaacgca
tggaagacagccggtgaacatacaaatgtcccacgtttcgctgtcaataacagtaccggc
tcaagcagcttgtcaagccgttatttgtacgatgctaccaacattcgtgtaaagaatatc
acgttgtcttacaccttaccgaagaatctgggcgttttttcaaaagttgtttccaatgcc
aaagtttggacttcggtagataacttgggcgcttggtttgccgacagcaattataaggga
tacagtgatatagacattttcggagtgcagggatacgctctttatccgtctattcctaat
cctaaaacacttagcataggagctaacattacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system