Chelonoidis abingdonii (Abingdon island giant tortoise): 116823630
Help
Entry
116823630 CDS
T07367
Symbol
NOTCH2
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2
KO
K20994
Notch 2
Organism
cabi
Chelonoidis abingdonii (Abingdon island giant tortoise)
Pathway
cabi04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cabi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
116823630 (NOTCH2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
NOD
EGF_2
Notch
NODP
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
JAG1-like_EGF2
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116823630
NCBI-ProteinID:
XP_032634210
Ensembl:
ENSCABG00000009788
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2433 aa
AA seq
DB search
MREPGRELGALLLLLLLLLLSRGEPTAALQCLDAFKPCINEGKCISYRNGTGYCKCPEGF
LGDYCQYKNPCESHTCQNGGTCETTSVVGKATCKCALGFTGEDCRYSESHICFVSHPCLN
GGTCQLLLQDTYECVCPPGYAGKDCQWIDACMSQPCANGSTCITSGSGFSCTCLAGYTGP
KCEIDLNECATPGQCQNGGTCHNLPGSYQCQCKPGFRGHRCENTYVPCSPSPCMNGGTCH
QTSDFTFECNCLPGFEGSTCEQNIDDCPNHNCQNDGVCVDGVNTYNCHCLPQWTGQFCTE
DVDECQLQPNACQNGGTCTNHNGGHSCVCVNGWSGEDCSKNIDDCFNTACAVGSTCIDRV
ASFTCICPEGKTGLLCHLDDACVSNPCLMGALCDTNPLNGHYICTCPQGYKGADCTDDVD
ECAMANSNPCEHAGKCVNTEGSFHCECLKGYTGPRCEMDINECVSEPCQNDATCLDKIGG
FTCLCMPGFKGMHCELEINECQSNPCVNNGECLDKVNRFQCVCPPGFTGAVCQIDIDDCS
STPCLNGAKCVDYPNGYECQCATGFTGTLCEENINNCDPDPCHHGECQDGIDSYTCVCNS
GYMGAICSEQVDECQSNPCLNEGRCIDLVNGYQCNCLLGTSGVNCENNLDDCASNPCIYG
VCLDGINRYDCVCKPGVTGPRCNIDIDECISSPCHNGGTCVNEMNGFRCLCPEGFHQPSC
HSQADECLSSPCIHGNCTNDVSGYMCLCDPGWVGTDCEVEENACLSNPCQNGGICDSLVD
GYRCSCRKGFKGVNCQLVLSACSPDPCENSGICQESPDLEGYICQCAAGWEGQRCTVDID
ECMSKPCKNHAVCHNTQGSYLCECRPGFTGGDCESNIDDCLSSPCQNGASCVDGVNSFLC
TCLPGFQGDKCQTDINECLSEPCKNGGTCTDYVNSYTCKCQAGFEGTHCENNIDECTESS
CFNGATCVDGINSFSCQCPVGFTGAFCLMEINECNSYPCLNKGTCVDRLGTYQCICPLGY
TGKDCQTLMDLCSKSPCKNKGTCVQRRTQSQCICPPGWTGTYCDVPNVSCQVAASQRGVP
VDQLCQHSGICLDVGNSHRCQCGMGYTGSYCEEQLDECTSNPCQNGATCSDYLRGYQCEC
VPGYQGVNCEYEVDECQFQPCQNGGTCIDLVNHFMCSCPPGTRGRLCEENIDDCASDLGG
PHCFNGGQCIDQIGGYTCHCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSPHGSLDCIQLVNDYTCIC
RSAFTGRHCETLTDVCPQQPCQNGGSCVVASHMPVGFICQCPPGYSGFKCEFGSHSVCGQ
VKCKKGEQCIQTSSGPQCYCPKLSAGTACQTGTGCASAPCQNGGSCHPRTQPPYYYCQCP
DQSEGSQCEHSVRPSQQPLGCPGQHCAERAKNGYCDRDCNMHACQWDGGDCSLTGEDPWA
NCSSSLHCWQHFNGECDELCNTPECLFDNFECQQNSKLCKYDKYCADHYADGRCDQGCNS
EECGWDGLDCAGDKAEKLAEGTLIIVVLMPPEELLSDARSFLRTLGSLLHTNLRIKLDSQ
GNPMVFPYYGETPASRSRRSLSGNRKPRELEQEVIGTKVFLEIDNRQCSEDSDQCFKSTE
AAAALLAAQAMQDMLPYPFVSVQSEPWLPKKTQLLYLLAVAAVIILFILLLGVLVAKRKR
KHGSLWLPEGFVLRRDPSNHKRREPVGEDAVGLKNLSVQATEGNLTDCSLSEHWTSSGGP
LPKRAKAEDQALLSDGGEQVDQRQWTQQHLEAADICGTPSLALTPPQEDQEVDGLDVNVR
GPDGCTPLMLASLRVGSSEISDEDEEMEDSSANVITDLIYQGANLQAQTDRTGEMALHLA
ARYSRADAAKRLLDAGADANARDNMGRSPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDVRMNDG
TTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLVLLKNGANRD
MQDNKEETPLFLAAREGSFEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVAQDRMHHDIVHLLNE
YNLTHSPPGHPGTMLSSALSPVICGPNRSFLNLKHASLSKKPRKPSAKGLVPTNLSKDAK
RKGKKSVSESKGQFSESSVTLSPVDSLESPHAFVSEPISSPVMPSPGVLPSSPHTQHTAT
SVQAAHTMSFSNLHELQPLGCGSSTVLPSVSQLLSQHRITPPNCGLDRLRPVNISAEWMS
RMEMNESQYNEMFGMVPQVVHSHPSMPQQSGMIQTDVKHGGVSRVSLPPIMTFQLVPKGG
INQQAMPQQAQANCAQNIAGPLSSMYQVPDLAQLPSASFPMVVIPQQDGQVAQTNLPAYH
QFQSSVGKYPTPPSQHSYSSSATERTPSHTRHLPGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASD
WSDVATSPSLGSNQRGPAAHMSEQQRSNMQVYA
NT seq
7302 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgggagcctggccgggagctcggggcgctcctgctgctgctgctgctgctgctgttg
agccgcggggagccgacggcggctttacagtgcctagatgcttttaagccttgtatcaat
gagggaaaatgcatctcctatcgcaatggcacaggatattgcaagtgtccagagggtttt
cttggagactactgtcagtacaaaaacccttgtgaaagccatacctgtcagaatggagga
acatgtgaaaccacatctgtggtcggaaaagccacttgtaaatgtgctttaggattcaca
ggcgaggactgcagatactctgaatcacacatctgctttgtatctcacccctgtttaaat
ggagggacctgccaactgcttcttcaggacacatatgagtgtgtctgtccaccaggttac
gcaggaaaggactgccagtggattgatgcttgtatgtctcagccatgtgccaatggaagt
acatgtatcacatctggaagtgggttctcctgcacctgcctagcaggctatactggccca
aagtgcgagattgatctaaatgaatgtgccacaccaggacaatgccaaaacggtggaact
tgtcacaatttgcccggttcttaccaatgccagtgcaagccaggctttagaggacaccgc
tgtgagaacacatatgtgccttgttcaccatcaccatgtatgaatggagggacatgtcat
caaaccagtgactttacctttgagtgcaactgtttgccaggctttgaaggaagcacctgc
gagcagaatattgatgactgcccaaatcataattgccagaacgatggggtgtgtgtggat
ggtgtgaacacttacaactgccactgcctcccacagtggacaggtcagttttgtactgag
gatgtagatgaatgtcagctccagcccaacgcctgtcagaatggagggacctgcaccaac
cacaatggaggccacagctgtgtgtgtgtcaatggctggagcggggaggactgcagtaag
aacattgatgactgtttcaatactgcctgtgctgtcgggtctacttgcattgatcgtgtg
gcctcatttacatgtatctgtccagaaggaaagacaggtctcctgtgccacttggatgat
gcatgtgttagtaacccatgcctgatgggagctctgtgtgataccaaccctctgaatgga
cactatatctgcacctgtcctcaaggctataaaggagcagactgtactgatgatgtggat
gagtgtgctatggcaaacagcaacccatgtgagcatgctgggaaatgtgtgaatacagaa
ggctccttccactgtgaatgtctgaaggggtacacagggcctcgctgtgaaatggacatt
aatgaatgtgtttctgaaccatgtcagaatgatgccacttgcctggataaaattggaggg
ttcacatgtctctgcatgccagggtttaaaggtatgcactgtgaactggagattaacgaa
tgccagagtaatccctgtgtgaacaatggagaatgtctggataaagtcaatcgcttccag
tgtgtctgcccacctggtttcactggagctgtgtgccagatcgacattgatgattgctcc
agcacaccttgtctaaatggagccaagtgtgttgattatccaaatggctatgaatgccag
tgtgccacaggctttactggcactttgtgtgaagagaatatcaacaactgtgaccctgac
ccttgccaccatggtgaatgccaggatggaattgattcgtacacctgtgtctgcaattct
gggtacatgggtgccatatgcagtgagcaggtagatgaatgccagagtaacccctgcctc
aatgaaggacgctgcattgacttggtgaatggttatcagtgcaactgtctcctgggcacg
tcaggagtgaactgtgagaataacttggatgactgtgcaagtaacccctgcatttatgga
gtttgtctcgatggcattaaccgctacgattgtgtctgcaagcctggagttacaggtcca
aggtgtaatattgatattgacgaatgcatctccagtccctgtcataatggtggaacatgt
gtaaatgaaatgaatggatttcggtgtctgtgtcctgaaggcttccatcaacccagctgt
cactcgcaagctgatgaatgtcttagtagcccttgtatacatggaaactgcacaaatgat
gtcagtggatacatgtgtctctgtgaccctggttgggttggaacagactgtgaagtggaa
gagaacgcatgcttgtcaaacccgtgccagaatggaggaatttgtgacagtctggtggat
ggatacagatgttcctgcaggaaaggattcaaaggcgtgaactgccagctcgtgctgtct
gcctgctctcctgatccatgtgagaactctggaatctgccaagaatctcctgacttggag
ggctacatctgccagtgtgctgctggctgggaaggccagagatgtacagtggatatagat
gagtgtatgtcaaagccttgcaagaatcatgctgtgtgccataacactcaaggcagttac
ttgtgtgaatgccgcccaggcttcactggaggagactgtgaaagcaacattgatgactgc
ctttcaagtccctgccagaatggagcttcatgtgtggatggggtgaactctttcttatgc
acttgtctgcctgggttccagggagataagtgtcagactgatataaacgaatgtctgagt
gaaccatgcaagaatggaggcacctgtacggactatgtcaacagctacacctgcaagtgt
caggcagggtttgaggggacccactgtgagaacaacattgatgagtgtaccgagagttct
tgtttcaatggagccacttgtgtggatgggatcaactccttttcctgccagtgcccagtg
gggttcactggggccttctgcctgatggaaattaatgaatgcaattcctatccttgtttg
aacaaagggacttgtgtggatagactggggacctaccagtgcatctgtcccttgggttac
actgggaaagactgccaaacactcatggatctgtgcagcaagtctccctgtaagaacaaa
ggcacatgtgtccagaggagaacccagtctcaatgcatctgtccacctggttggactggc
acctattgcgatgtgcccaacgtctcctgtcaggtggctgcttcgcagaggggagtcccc
gtggaccaattgtgtcaacattctggcatttgccttgatgtgggaaacagtcatcgctgc
caatgtggcatgggttacactggcagctactgtgaagagcaattggacgaatgcacctcc
aatccatgccagaacggtgccacctgcagtgactatctcaggggatatcagtgtgagtgt
gtgccagggtaccaaggagtcaactgtgaatacgaagtggatgagtgccagttccagccc
tgccagaatggaggaacctgcattgatcttgtcaatcatttcatgtgctcctgtccacca
ggaactcgaggccgtctttgtgaggagaacattgatgactgtgcttcagatctgggagga
ccccattgctttaatggaggacagtgcattgaccaaattgggggttacacctgccactgt
ctcccaggctttgcaggcgagcgctgtgaaggggatattaatgagtgcctttccaaccct
tgtagccctcatggtagcctagactgcattcagctagtcaatgattatacatgcatctgt
cgcagtgccttcactggtcgtcactgtgagacgctaacagatgtgtgtccccagcagcct
tgtcagaatggcggtagttgtgttgttgccagtcatatgcctgttgggttcatctgccag
tgtcctccaggttattctgggtttaaatgtgagtttggcagccacagtgtctgtgggcaa
gtgaaatgcaagaaaggggagcagtgcatccagacatcttctgggccccaatgttactgc
ccaaagctctcagctggcacggcatgccagactggtacaggctgtgccagtgcaccgtgc
cagaatggtggaagctgccatcccaggactcagccaccttactactactgccagtgtcct
gatcaatctgaaggtagccagtgtgaacactcagtgcgccccagccaacagccgctgggc
tgtccaggccaacactgtgcagaaagagcaaaaaatggctactgcgacagggactgtaac
atgcacgcctgccagtgggatggaggtgactgttccttgacaggagaggatccctgggcc
aactgctcttcctcgctgcactgctggcagcacttcaatggcgagtgcgacgagctctgt
aacacacccgagtgcctcttcgacaacttcgagtgccagcaaaatagcaagctatgcaag
tatgataagtactgtgcagatcattatgcggatgggcgctgtgaccagggctgtaacagt
gaggaatgtggctgggatggcctggactgtgctggtgacaaagctgagaaactggcagaa
gggacccttattattgtggtactgatgccccccgaggagctgctcagtgatgcccgcagt
ttcctgcggactttaggatcccttcttcataccaacctgagaataaaactggactcacag
ggaaaccccatggtgttcccatactacggggagacgccggcatcacggagtcggcgatca
ctctcaggcaatcgcaagcccagagaacttgaacaggaggtcattggcacgaaggtgttc
ctggaaattgacaaccgccaatgtagtgaagattcagaccagtgctttaaaagcacagaa
gctgctgcagctctcttagcagctcaggccatgcaggacatgctgccctacccctttgtg
tctgtccaaagtgaaccttggctaccaaagaagacccagttgctttacctgcttgctgtg
gcagctgtgatcatccttttcatcctgttgttgggtgtgcttgtggcaaagagaaagcgc
aaacatggctccctctggcttccagagggctttgttctacgccgggaccccagtaaccac
aagcgcagagagccagttggggaagatgcagttggactgaagaatctgtcagttcaagct
acagagggtaatttgactgactgcagtctcagtgagcactggaccagcagtggaggacct
ctgcctaagagagcaaaggctgaagaccaagctttgctgtcagatggaggggagcaggta
gatcagcgccagtggacacagcaacacctagaggcagctgacatctgtgggaccccatct
ctagcccttacaccaccgcaggaggatcaggaagtggatgggctggatgtcaatgtcaga
gggccagatgggtgtaccccactcatgttggcatctctccgtgtgggcagctctgagatt
agtgacgaagatgaagaaatggaagattcttcagcaaatgtaataacagatttaatttat
caaggtgccaacctgcaggcccaaacggaccgtactggggagatggcactgcacttagca
gcccgctattcaagagcagatgcggcaaaacgcttactagatgctggtgctgatgctaat
gcacgagacaacatgggccggtctccccttcatgcagccgtggcagctgatgcacagggt
gtcttccagatcctgatccgtaacagagtgacggacctggatgtgcgaatgaatgatggc
acaaccccactaattctggctgcccgattggctgtggaaggaatggtggccgagctgatc
aactgccaggctgatgtcaatgctgtggatgatcatggtaaatctgcccttcactgggcc
gctgctgttaacaatgtggaggcaacattagtgctgctgaaaaacggagccaacagagac
atgcaggacaacaaggaggagacaccgctgttcctggcagcgcgggaagggagttttgaa
gcagctaaaatcctgttggaccattttgccaatcgagacatcacagaccacatggatcgc
ctccctcgagatgtggcacaggaccgaatgcaccatgacatcgtgcaccttctgaatgag
tacaacctgacccatagccctcctgggcaccctggcaccatgctaagctcagccctctcg
ccagtgatctgtggcccaaataggtccttcctcaatttgaaacatgcttccttaagcaag
aagccacgaaaaccaagtgccaagggcctggtgcccacaaatctctccaaggatgcaaag
aggaaggggaagaaatctgtgagtgaaagcaagggacagttttctgagagctcagtgacc
ctctcaccagttgattccttggaatccccacatgcttttgtatctgaaccaatatcgtct
ccagtgatgccatcaccaggggttttaccttcgtccccgcacacacagcacactgccaca
tcagtacaggctgcgcacaccatgtccttctccaacctccatgagctgcagcccctggga
tgtggatccagcactgtgcttccttctgtcagccagctgctttcacagcacagaatcacc
cctccaaactgtgggctcgatcggctcaggccagttaacatttctgctgaatggatgagt
cgtatggaaatgaatgaatctcagtataatgagatgtttggcatggtcccccaggtagtg
cattctcaccccagcatgcctcagcagagtggcatgattcaaaccgatgtgaagcatggt
ggagtctccagagtgtcactgccacctattatgactttccagcttgttcccaaaggtggc
ataaaccagcaggcaatgcctcagcaggcacaggcaaattgtgctcaaaatatagctggt
cctcttagttccatgtaccaggtaccagatctagctcagttgccaagtgcctcctttccc
atggtagtgatccctcagcaggatggacaagtagctcagacaaacctcccagcctatcac
cagtttcagagctcagtgggaaagtaccccactccgccatctcagcacagctactcctcc
tctgccacagagaggactcccagccataccaggcacttgccaggggagcacccatatctg
actccatcacctgagtcacctgatcaatggtcaagctcgtccccacactctgcctcagat
tggtctgatgtggccaccagccccagcctcggcagcaaccagcgagggcctgcagcacat
atgtcagagcagcagcggagcaacatgcaggtttatgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
