Clostridium acetobutylicum ATCC 824: CA_C3086
Help
Entry
CA_C3086 CDS
T00056
Name
(GenBank) Protein containing cell adhesion domain
Organism
cac
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Ig_Eae
Big-like
Ig_NUP210_5th
Ig_NUP210_16th
Pepdidase_M14_N
Mycolysin_N
NVEALA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAK81026
UniProt:
Q97EM4
LinkDB
All DBs
Position
3237827..3239323
Genome browser
AA seq
498 aa
AA seq
DB search
MNKRIKVFFLVFLIVILGCFTNVFATNNSDAIEIGTSNLNGTAVNSAKVGNQLFHPEVGW
ARYDDTNPKMLFKGSFNDYPSNVYYNGSTKYGIGTALIKFYGSKFRILMSYNPDRSNSNF
VTVDGTKIGQFDQIKGSLIPQALGFQENNLTEGVHVVQIDLGNNSTLDAFDIDDSGYLIQ
LDKNLTLNKTSETLTVGQTDTLSQVVVPDNAPDKSLTWTSSDPSIANVDTFGKVTAVKAG
SAIITATTNDGSNLTSSCAVNVKDSNTTISLNKTTDNLTVGANDTLTATITPTDAVDKNV
TWTSSDPSIATVDASGKITAVKPGTVTVTATTDNGKTASCNVTVENNTVNLTIFMQDSTT
RQYTITKDEFTKFTNWYNLRANGGTFSDSYTFNLPVDASSSVIRRTVYFTTIESFEIISD
DVPVEERNNTLTLLMKNSTIRKYSLTASEVNNFNNWYDLRSNNQTLQSYYIFNVPADDFS
PARKDYILFNNITDSQVQ
NT seq
1497 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaagaataaaagtcttctttttagtctttttaattgtaattttaggttgcttc
acaaatgttttcgctactaataatagtgacgctattgaaataggtacctctaatctaaat
ggtactgctgtaaatagcgctaaagttggaaatcaactatttcatccagaagtaggttgg
gcaagatatgacgatactaatccaaaaatgttatttaaaggatcatttaatgattaccca
tctaatgtatattacaatggttcaacaaaatatggtattggaactgcactaattaaattt
tacggttctaaatttagaattttaatgagttataatccagatagaagtaattctaacttt
gtaactgttgatggtacaaaaataggtcaatttgatcaaataaaaggctctctaatacct
caagctttaggatttcaagaaaataatttaactgaaggtgttcatgttgtacaaattgat
ttaggaaataattctacactggatgcattcgatatagatgattctggttatctaattcaa
ctagacaaaaatttaaccttaaataaaacatcagaaacattaaccgttggacaaactgat
actttatcacaagtagtagttccagataacgctcctgataaatcactaacttggacctca
agtgatccttcaattgccaatgttgatacttttggtaaagttacagctgtaaaagccggc
tcagctattattactgccactactaatgatggtagcaatttaacctcttcttgtgcggtt
aatgtaaaagattccaacactacaatatcactaaacaaaactactgataatttaactgtg
ggtgctaatgatactttaactgctactattacacctactgatgcagtagataaaaatgta
acctggacttcaagtgatccttcaattgctactgttgatgcttctggtaaaattacagct
gtaaaacctggaactgttactgttactgctactactgataatggtaaaacagcttcctgc
aatgttaccgtagaaaataatactgttaatttaactatatttatgcaggactcaactaca
agacagtatactataacaaaagatgaattcactaaattcacaaattggtacaatcttagg
gcaaatggcggtactttctctgactcttacacatttaacttaccagtagatgcctcctca
tctgttataagacgtactgtatactttactaccatagaatcttttgaaattatttccgac
gatgttcctgtagaagaaagaaacaatactttaactttactaatgaaaaattcaactata
agaaaatattctttaactgcaagtgaagttaataactttaacaattggtatgatcttaga
tcaaataaccaaactcttcaatcttactatatattcaatgttcctgcagatgatttttca
cctgctagaaaagattatattttatttaataatataacagattctcaagttcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system