Clostridium acetobutylicum ATCC 824: CA_C3274
Help
Entry
CA_C3274 CDS
T00056
Name
(GenBank) Possible surface protein, responsible for cell interaction; contains cell adhesion domain and ChW-repeats
KO
K13730
internalin A
Organism
cac
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cac00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
CA_C3274
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ChW
LRR_4
Big_2
LRR_8
LRR_14
Big-like
LRR_EndoS
Ig_Eae
Ig_NUP210_5th
LRR_9
HL_N-beta
Invasin_D4
LRR_R13L1-DRL21
Ig_NUP210_16th
LRR_LRWD1
aBig_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAK81208
UniProt:
Q97E42
LinkDB
All DBs
Position
3424074..3426698
Genome browser
AA seq
874 aa
AA seq
DB search
MNRFKIKYLLATLACFVSFSAFTCTSSVKADTTDTTPHVTYDAHVENIGWQDPWSKDGAE
IGTDGKGLRVEALKIKLLNAPAGAKISYQAHVQNVGWQDWVSDGTEAGTDGKGLRVEALK
IKLENMPGYSIQYQAHVQNIGWQDWVSDGAEAGTDGKGLRVEALRIKIVKNNDTPASSIS
LSKSTDSLKVGDTDTLSATLSNNANSKNITWTSSDSSIVSVDNNGKITALKEGTANVTAS
SDGKTASCAVTVAKAATTDTAPSLSYSAHVQNIGWQTPVTDGMEVGTDGKGLRVEAFKLN
LLNAPAGAKITYQAHVQNIGWQDWVSNGAEAGTDGKGLRVEALRIKLENMPGYSIEYQAH
VQNIGWQNWVNDGEEAGTDGQGLRVEALRIRIVKSVPVDSISLNKQTDTIAVGNSDTLSA
AVAPTNSTFVWTSSDSSIASVDASGKVTGIKAGTATITASSLDGKKTASCSVTVADKTVV
TFKDPVLEQAVRKEINKTTGQLYNTDVNKITSLGIIKDTVINSLDGIEQLSNLKQLWLNY
GNVTDLTPISKLSNLKILSLNGDTDIDISPIGNLTNLNQLDIGESKISNINVLNKLNNLN
YLILDKNTSIKDFSPLGSLTNLTLLQASYCNFSDLTPLAKMKNLSRVSLNYNNITSIEPL
KSSTNLVDLVLSGNKISDITPVANLTNLESISLSYNQVNNISSLAKLTKLKSLMLDHTGI
SDISSLSGLTNLNYLGVQDNNIEDITSLKNLTNLANLKISQNKISNVDAIGNLTNLTLLD
MNNNQISNINAIKNSTKLISLSMHHNKVSDISALSKLTNLESLNLGNNPINDVTPLKDLS
HLYEVDLTTSQANIDYLNSVLRLGHAYNNKNQDN
NT seq
2625 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacagatttaaaattaagtatttattagctacactagcgtgttttgtatctttctct
gcttttacttgtacatcttctgttaaagcagacactactgatactactccacacgtaacc
tacgatgctcatgtcgaaaacattgggtggcaggacccttggtctaaagatggtgctgaa
atcggtactgacggcaaaggtcttcgtgttgaagctctcaaaataaagcttttaaatgca
ccagctggtgctaaaataagctatcaggctcatgttcaaaatgttggctggcaagattgg
gtatctgatggcactgaagctggtaccgacggtaaaggtcttcgtgttgaagctcttaaa
ataaaactcgaaaacatgcctggctactcaattcaataccaagctcatgttcaaaacata
ggttggcaagattgggtatctgacggtgctgaagctggtactgacggcaaaggtcttcgt
gttgaggctcttagaattaaaatcgttaagaataatgataccccagcgtcttcaattagc
cttagtaagtctacagacagcttaaaggttggagatactgatacattatctgctactctt
tctaataatgcaaacagtaaaaacataacttggacttcttctgattccagcattgtttct
gttgacaataacggtaaaataaccgccttaaaggaaggtactgccaatgtaactgcttcc
tctgacggaaaaacagcttcctgtgcagtaactgttgcaaaagctgcaactactgacact
gcaccttctttatcttactctgctcatgttcaaaatataggctggcaaactccagtaact
gacggtatggaggttggaactgatggtaagggtcttcgtgttgaagcctttaaactaaac
ctattaaatgcaccagccggtgctaaaataacttatcaggctcatgttcaaaatattggc
tggcaggactgggttagtaacggcgctgaagctggtactgacggcaaaggtcttcgtgtt
gaagctcttagaataaagcttgaaaacatgcctggttattcaatagagtatcaagctcat
gttcaaaatattggttggcaaaattgggttaatgatggtgaagaagctggtactgatgga
caaggtcttagagttgaagctcttagaattagaattgttaaatccgtacctgtagattct
atttccttaaacaagcagacagatactatagctgtaggaaactctgatacattatctgct
gctgtagctccaactaacagcacttttgtttggacttcttctgacagcagtattgcatca
gtcgatgcctcaggtaaagttactggtattaaagctggaacagccactattactgcttca
tctcttgatggtaaaaaaacagcttcttgttctgtaactgtagctgataaaactgtagtc
acttttaaagatccagttttggagcaagctgtaagaaaagaaataaacaaaactacagga
caactatataatactgatgttaataagataacttccttagggattataaaagatacagtt
ataaattctttagatggaattgagcagctttcaaaccttaaacaactgtggttaaactat
ggaaatgtaactgaccttacccctattagtaagctaagcaatctaaaaatattatcttta
aatggtgatactgatattgatattagtcctattggtaatctaactaacctaaaccaatta
gatataggcgaaagtaaaattagtaatattaacgttctaaataaactaaacaacttaaat
tatttaattctagataagaatacttcaattaaagattttagccctttgggtagtttaact
aatctaacactgttgcaggcaagttattgtaatttttccgatcttactcctctagctaaa
atgaagaatttaagtagagtaagtttaaattacaataacattacaagtattgaaccttta
aagtcttcaacaaacttagtggatttagttttgagcggaaataaaattagtgatattact
ccagtagctaatttaactaatttagagtctatttcattaagctataatcaagttaacaat
atttcctctttagctaaattaactaaactaaaatctcttatgcttgatcatactggcatt
agtgatattagctccttatcaggtttaactaatttaaattaccttggagttcaagacaac
aatatagaagatattactagtcttaagaatttaactaatttagctaatttaaaaatatcc
caaaacaaaataagtaatgttgatgctataggtaatctaaccaatcttactcttcttgat
atgaataacaatcaaattagtaatattaatgctattaaaaattcaactaaacttatttcg
ttatctatgcatcacaataaagtaagtgatatcagtgctttatctaaattaactaatttg
gaatctcttaatttaggtaataatcctattaacgatgttactcctctaaaggatttatca
catttatacgaagtagatttaacaacaagtcaagcaaatatagattatttaaattctgtt
ttgcgtcttggtcatgcatacaataacaaaaatcaagataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
