Clostridium aceticum: CACET_c38220
Help
Entry
CACET_c38220 CDS
T03971
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
cace
Clostridium aceticum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
DUF1565
Pectate_lyase_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKL97250
UniProt:
A0A0G3WH79
LinkDB
All DBs
Position
complement(4055286..4057418)
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MNNEKGSSNNNKKLACQPSSSLYITEKKAPNSYAVRRAGQGELKASFLNLNKNVNSCPYP
PGAKVQVSEVDVIVEGCPPLRLKAPKGPAGPAGPEGPAGPEGPAGPAGPEGPEGPEGPEG
PEGPEGPEGPEGPAGPEGPPGAGITDYGYIYNTCEQVVLEEANVTFDSNGIIVGEIGHIV
GNEEIFINTPGDYEVSFYISGGNANQFSLFLNGLLVEGTTYGSQDGRQINTGYAIVSVIE
PSVLTLRNHTSDSPVILQSLAGIQTNVTASLYLERLSLQTAASASTALELISLLNDPTIT
TINLEANIFDLSMEPPINRTTAVRLMGMAPGAEINFAANQDISFITIGGNITLLDHRIYN
SNEKLFYTTIDAAITAASPGDTVLVFPGTYNQASFLLIDKPLTLRGFSANDTVVTFPNTL
DNTSSLRIMADNVTVDNIHFIGPTSATEGLNALISIPTKTPIGIDMPVELFDHITISCCI
MEGGRRNAFITGQNLSILGNQFIHTGNSHSLNIIALDGRTMISGNTFTGGTTSLRAILVE
GSSNTTFSGDIIVQDNNATSFTGFTLFNTNSNVIIFFGQPTPIGFQDATILVQRNYIDHQ
GRSGSSIIFFVPGPNDFSEIHSIRIRENVIINLNVNRLAVYMDYFPPGGTSIPANEQIKV
SENVFDVALPWGSATDTVDPNYPVGFDIDAPGGVNLDKFELVLNTVLNLP
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatgaaaaaggcagttcaaataacaacaaaaaacttgcttgtcaaccaagttct
tcgttgtatataacagaaaaaaaagcacctaactcatatgctgtacggagagctggacag
ggagaattaaaagcttcttttttaaatttaaacaaaaatgtaaattcttgcccctatccg
ccaggcgcaaaagtacaagttagtgaggtggatgttattgtagagggttgtccaccttta
cggttaaaagcaccaaaaggtccagcaggtccagcaggtccagagggtccagcaggtcca
gagggtccagcaggtccagcaggtccagagggtccggagggtccagagggtccggagggt
ccagagggtccagagggtccagagggtccagagggtccagcaggtccagagggtccaccg
ggtgctggtatcactgattatggttatatctataacacttgtgagcaggtagtgcttgaa
gaagcaaatgttacatttgattcaaacggtataattgttggagaaataggtcatatagtt
gggaatgaggaaatttttattaatacacctggtgactatgaagtaagtttctatatatcg
ggaggaaatgctaatcagttttcattatttttgaatgggcttttggttgagggaaccact
tatgggtcacaggatggaagacaaataaatactggatatgctattgtatctgttatagaa
cccagtgttcttaccttaagaaatcatacttctgattctcctgtaatattacagtcattg
gcgggaatacaaacaaatgttactgcttctctttatcttgaaagattaagtcttcaaaca
gcagcttcagcttctacagcattagaattgatttctttactaaatgatcctaccatcacg
actattaatttagaggcaaatatatttgatttaagtatggagcctccaataaatagaaca
accgctgtaaggcttatgggaatggctcctggtgctgaaattaactttgctgcaaatcag
gatattagctttattactattgggggaaacatcactttattggatcaccgaatttataat
tccaacgaaaaattattttatacaacgatagatgcagctatcacagcagcatcacctgga
gacactgtacttgtttttcctggaacatataaccaagcttcatttcttttgatagataaa
ccgctgaccctacgaggattttcagcaaacgatactgtggtcacatttccaaatacgcta
gataatacctctagcctacgaattatggcagataatgttaccgtagataatattcacttt
attggacctacatctgctaccgaagggcttaatgctctcatatctataccaacgaaaacc
cctattggtatagatatgcccgtggagctttttgatcatattacaattagttgttgtatt
atggaaggtggaagaaggaatgcctttattacgggtcaaaacctttctattttaggaaat
cagtttattcatactggtaatagtcattctttaaatattattgctttagatggaagaacc
atgatatcagggaatactttcactggagggacgactagtctgagggctattctagtggag
ggaagctctaatactactttttcaggagatattattgttcaagataataacgccactagc
tttacaggcttcacactatttaatacaaattcaaacgttattatcttttttggtcaaccg
actcctattggttttcaggatgccactattttagtgcagagaaactatattgaccatcaa
ggtcgctccggcagttccattatcttttttgtgccagggcctaacgatttcagtgaaatt
cactccattagaattagggaaaatgtaattattaatcttaatgtcaatcgtctggcagta
tatatggattattttccaccaggtggaacttctataccagcaaatgaacaaataaaggtt
tctgaaaatgtatttgatgttgcacttccttggggctctgcaacagatactgttgatcct
aattatcctgttggattcgatattgatgcacctggtggtgttaacttagataagtttgag
ttggttctcaatacagtgttaaatctaccttag
DBGET
integrated database retrieval system
