Gottschalkia acidurici: Curi_c27640
Help
Entry
Curi_c27640 CDS
T02255
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
cad
Gottschalkia acidurici
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS79757
UniProt:
K0B3M8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2906245..2908323)
Genome browser
AA seq
692 aa
AA seq
DB search
MNRDIGNSDSNIDESSSVKSYLDVTTLQDIQDIIGPTGPTGPTGPTGATGPTGPTGATGA
NGATGPTGSRGNTGATGTTGITGPTGAIGPTGANGITGPTGATGSTGATGPTGSRGNTGS
TGTTGATGSTGAIGPTGANGMTGPTGATGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGS
TGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGATGPTGSTGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGA
DGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGP
TGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGP
TGETGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGA
DGATGETGPTGATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGATGA
TGSDGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGATGATGANGSTGSTGATGA
TGADGATGPTGPAGGLSAYGGKYNNTASSLTFVLPGTQQVPFNNNQSLLNVTAGTNQLTI
NATGIYEIEYIVYGSITVSTGISTAVRINGTNIASTIVSATLSIGATAVFTNSTIVSLST
GNVIDLAITAGLATVFNFASGVNAVLTVKRLS
NT seq
2079 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagagatatcggaaattccgattcaaatatagacgagtctagtagtgtaaaatca
tatctagacgttacaactcttcaagatattcaagatattataggaccaacaggcccgacc
ggtccaaccgggccaacgggagccaccggtccaacaggcccaacaggagccacaggggct
aatggagccaccggtccaacaggatcacgtggaaatacgggagcaacaggaacaactgga
attactggtccaacaggagctataggtccaacaggagctaatggaataaccggtccaaca
ggagctacaggatcgactggagcgacaggcccaacgggatcacgtggaaataccggatca
acaggaacaacaggagctaccggatcaacaggagctataggtccaacaggagctaatgga
atgaccggtccaacaggagctacaggaataaccggggccactggaccgacgggatcacgt
gggaatactggttcaacaggggctacaggaataactggcccaacaggatcaacaggatca
acaggagctatgggatcaaccggaccaacaggagccacaggagttataggagccaccggt
ccaacaggaaatataggagccaccggtccaacaggaagcacaggagcaaccggatcgata
gggaatactggcccaacaggagctgatggagtaatcggcccaacaggagcaacgggagca
gatggagtaaccggtccaacaggaccacgtggaaatactggtgcagatggagcaactggt
gctaccggcgcaatcggatcaaccggcccgacaggagctaatggaaacactggtccaacg
ggagctacaggagccacaggggatactggtccgacaggttctaatggaccaataggtcca
accggcccaacaggagcagatggtccaaccggcccaacaggagcagatggaataacaggg
ccaactggatcaactggatcaactggagctgacggagcagctggagaaactggagcaacc
ggagccacaggtccaaccggggcagatggagcgacaggagcgacaggagcagatggtcca
acaggagaaacaggcccagtgggagcgacaggagctaccggagcagatggagcaacagga
gaaacagggccaactggagctacaggatcaacaggatcagacggaataccagggccaaca
ggagtcacaggagccacaggagaaataggcccagtgggagcgacaggagctaccggagca
gatggagcaacaggagaaacaggcccaactggggcaactggaccaaccgggtcagatggg
gcaaccggcccgacaggagcgacaggagcaactggggaagcaggagtagcaggagcaacc
ggagcgacaggagcagatggggccactggatcaacagggtctacaggagccacaggagcc
acaggatcagatggagcaacaggtccaacaggagctacaggagcagtgggagcgactggt
ccaacaggatcaatcggagctacaggggcagatggagccactggatcaacagggcctaca
ggagccacaggagccacaggagcaaatggatcaacaggatcaaccggagcaaccggagcg
accggagcagatggagcaacaggtccaacaggaccagctggtggactgagtgcttatggt
ggaaaatataataatactgcatcttcacttaccttcgtacttccgggtacccaacaagtt
ccatttaataataatcaatctctcttaaatgtaactgctggaacaaatcaattgactata
aatgcaactggtatttatgagattgagtatatcgtatatggttctatcactgtaagtaca
ggtatatcaacagctgttagaataaacggtacaaatatagcgtcaactatagtaagcgct
acactaagtataggggcaactgcagtctttacaaactctactatagtatcactttctaca
ggaaatgtaatagatcttgctataactgctggccttgctacagttttcaactttgcatct
ggtgtaaatgctgttttaacagtaaaaagattaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system