Clostridium acetobutylicum DSM 1731: SMB_G2979
Help
Entry
SMB_G2979 CDS
T01548
Name
(GenBank) integrin-like repeat-containing cell wall-associated hydrolase
Organism
cae
Clostridium acetobutylicum DSM 1731
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP
FG-GAP_3
NLPC_P60
Peptidase_C92
DUF1175
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEI32619
LinkDB
All DBs
Position
3076049..3077560
Genome browser
AA seq
503 aa
AA seq
DB search
MKKLFTNLLLLCSIVFLGALLNGHNVQASDSFTYPSAYGWWSVDNGYDVNNVNSRMVSGD
FNGDGKADVATFYDYGNGASRIHVFTSNGSSFDYASAYGWWNTPSGYDPKRITAVVAGDF
NGDHKDDIAVIYNYGNSETRIHVFISTGSSFSYTDCNGWWNATGYDAGRITGAVAGDFNG
DGKSDIATMYDYGGGETRIHVFTSTGSSFTYTGANGWWNSTGYDSNRVKGRVVAGDFNGD
GKTDIAAMYDYGGSESRIHVFLSTGDSFKYTGANGWWSTTGYDANKVTGRLVAGDFNGDG
KADIAAMYDYGNAETRIHVLTSNGDSFTYTGANGWWNTTGYDANRVTGRVVAGDFNGDHK
ADIAAFYDYGSSASRIHVFTSNADSPESSKGAELVAYAESFLGVPYVWGGADPSGFDCSG
LVQYCYEHFGVDLPRTTYDQVNCGTTVTDDLQPGDLLFFGSATSPTHVAIYAGNSKMVEA
PHTGANVRLVDIRSYFIAKRIFN
NT seq
1512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacttttcacaaatttactattattgtgctcaatagttttccttggagcactt
ttaaatggacataacgtgcaagctagtgattcatttacatatcctagtgcatatggttgg
tggtcagtagacaatggctatgacgttaataatgttaacagtagaatggttagtggcgat
tttaatggcgatggtaaagccgatgttgctaccttctatgactacggtaatggtgcttct
agaattcatgtattcacatcaaatggaagttcctttgactatgctagtgcgtatggttgg
tggaatactccaagcggttatgaccctaagagaattacagctgttgtagctggtgatttt
aacggtgatcacaaggatgatattgcggttatatataattacggtaattctgaaacaaga
attcatgtattcatttctactggaagttcctttagttatactgattgtaacggttggtgg
aatgctactggttatgatgctggaagaattacaggagctgtagctggtgactttaatggt
gatggtaaatcggatattgctactatgtacgattatggcggaggtgaaactagaattcac
gtattcacttcaactggaagttcatttacctatactggtgcaaatggctggtggaactct
actggttatgattccaacagagttaaaggaagagttgtagctggtgattttaatggtgac
ggtaaaactgatattgctgctatgtatgattacggtggtagtgaaagtcgcatccatgta
tttctttctactggagattcctttaagtacactggggcaaatggttggtggagcactact
ggatacgatgctaacaaagttactggaaggcttgtagctggtgactttaatggtgatggc
aaagctgatattgctgctatgtacgattatggcaacgcagaaactagaatccatgtatta
acctctaacggcgactcttttacctacactggagcaaacggttggtggaataccactggt
tatgatgctaacagagttactggaagggttgtagctggtgactttaatggtgatcacaaa
gctgacatcgccgctttctatgattatgggagttctgcttctagaattcacgtttttact
tcaaacgctgattctcccgaatcttcaaaaggagcagagctagtagcctatgctgaaagc
ttcttaggcgtaccttatgtatggggtggtgcagatcctagtggatttgactgttccggt
ttagttcaatactgctacgaacactttggagtagatcttccacgtactacctacgatcag
gttaactgtggtactactgtaacagatgatcttcagccaggagatttattattctttggc
tctgcaacaagtccaactcacgtggctatttatgccggaaatagtaaaatggttgaagca
cctcatacaggcgcaaatgtaagacttgtcgatattaggtcctactttatagcaaagaga
atatttaactaa
DBGET
integrated database retrieval system