Costertonia aggregata: HYG79_06030
Help
Entry
HYG79_06030 CDS
T06693
Name
(GenBank) BspA family leucine-rich repeat surface protein
Organism
cagg
Costertonia aggregata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF285
Cadherin
Cadherin_4
PKD
Cadherin_CELSR2_9th
GH115_C
PKD_4
MoaF_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLG44929
UniProt:
A0A7H9AN97
LinkDB
All DBs
Position
1315066..1316358
Genome browser
AA seq
430 aa
AA seq
DB search
MKTILQTLILLTILITFGCSKDDDTPKNTTPENNTPQNNAPEINAQSFTVAENIADNMPI
GTVQATDPEGDTLTYSITQNDNNLFEISNTGVLSLEDLQTLDFETTQSHTITVSVSDGST
SAEATITINVTDIDDTSFITTWETTTTNETVTIPTRSGQYTYNYTIDWGDNTIQTNRTDD
ATHTYTTPGLHTIKINGDFPTIFLRNNIDSGGQLRSVEQWGNIQWQTMREAFKWVRTLTI
NATDAPDLSQVSDMARMFESALVSSNQNLTGILIGSLNHWDVSNVTDMEAMFLDLRFNED
ISAWNVSNVTDMSGMFIGSSFNQNIGSWNVSNVTDMLEMFKNSSFNQNIGSWDVGNVTDM
SSMFQDSPFNQDISAWDVSDVEFMSDMFSGSSFNQDISIWDVANVIGCSDFALNSSLTVS
NTPNFTNCTP
NT seq
1293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactatattacaaacactgatcttactcacgattttaatcacttttggctgtagt
aaagatgacgatacaccaaaaaatactacacccgaaaacaacacaccccaaaacaacgca
ccagaaataaacgcgcaaagctttaccgtcgcagaaaacattgccgataatatgcccatt
ggtacggtgcaggctacagacccagaaggcgatacgttaacctacagcattacccaaaac
gataacaacctttttgagattagcaatacaggtgttttaagcttagaggatttacagacc
ttagattttgagactacccaaagccataccattacagttagcgtaagcgatggcagtaca
agtgcagaagccactattaccataaatgttactgatatagatgacacctcctttatcacc
acctgggaaaccaccacgaccaacgaaacggtaaccatacccacacgtagtggccagtac
acttataattacaccatagattggggagataacaccatacagaccaaccgaacagatgac
gccacacatacctacacgacgcctggtttacacacaataaaaataaatggtgattttccg
actattttcttacgaaataatattgattccggagggcaattacgaagtgtagaacaatgg
ggcaatatacaatggcaaacgatgcgggaagcatttaaatgggtgagaacattaactata
aatgccactgatgccccagacttgtcccaggtaagcgatatggccaggatgtttgagtct
gctcttgtatcaagtaaccagaaccttacgggtattcttattggtagtctcaatcattgg
gatgtaagtaacgtaaccgatatggaagccatgtttttagatttaaggtttaacgaggat
ataagtgcttggaacgtaagtaacgtaactgatatgtcgggtatgtttattgggtcttcg
tttaaccaaaatataggtagttggaatgttagcaatgttacggatatgctagagatgttt
aaaaactcatcctttaaccaaaatatcggtagttgggatgtgggtaatgtaaccgatatg
agtagtatgtttcaagattccccttttaaccaagatattagcgcttgggatgtcagcgat
gtggaatttatgagtgacatgttctctggctcatcttttaaccaagacattagtatttgg
gacgtggctaatgtaattggttgctcagattttgctcttaactcatcacttacagtgagt
aacaccccaaattttaccaattgtacgccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
