Costertonia aggregata: HYG79_15660
Help
Entry
HYG79_15660 CDS
T06693
Name
(GenBank) choice-of-anchor D domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
cagg
Costertonia aggregata
Pathway
cagg02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cagg00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
HYG79_15660
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
Ig_CFAP65_4th
DUF1573
ASH
Cep192_D4
Por_Secre_tail
Cep192_D3
NIDO
BACON_2
TMEM131_like_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLG46726
UniProt:
A0A7H9ATH6
LinkDB
All DBs
Position
complement(3400873..3406962)
Genome browser
AA seq
2029 aa
AA seq
DB search
MLKSYRIFTFILLFVFCGIQTAQAQKMEKLPGPIVVCPANYEDQHSRIAMSQMAAKKSSF
SRTKKSATAELLVTFGPEAQSRPEVVAAFQFALDIWAEEIVSTVPIRIFAEFADLGPGVL
ASAGPTSIFRDFEGAPEPGVFYPAALANALAGVDLDPEEEFDLVVNLGNGIPWYFGTDGN
TPAGLFDFVTVALHEAGHGLGFIDGGDVDNNGVGSLGFAGGVPIIFDIFVVDGDGNSVLD
LPNPSQELGDFYTSGDVFVNGTNAVAALGGVLPELFAPNPFQGGSSIAHWDEATFPAGDP
NSLMSPQVGASESNFNIGDITRAHFSDMGWQIAGAAPIAASPSSISDEINVDEISISELT
VTNVSDQSVVVTPSVAPGSLIELFDPATITLDVSESAILQVQFNTTGITKGIYTDEIILT
TEGFDRTVTIPVTLRVLDGTEAPMIGISPESFDETIDQFQVITRDLSIQNSGDDDLNYTI
TINNSDGISPVGFENRVTLTNNFIATEGFKTGNYGTNGAPKGLSSLITSHDGIFNSIVTN
LFSGDFEEYALGNIDDQFGWFISAATEADDWVVTNTNPFEGNQHISSVSDGLGGNRLAFT
PVITPGNEPFMVSSTRVNIQGSGTTWEVIPQSPAAGSVVTRVRFNADRSIDILDGGSSAF
IPITAVTPEGYFDLRIIVDKDDAAMQVFFDDELVFSGTAFASEIEQVVFLTPMEAVGSTM
DIDNVEIIDGDENAFFLTVSPTAGIVPFGTTETATVKFDARSLVPGVYNATINVASNDET
NPNIEIPVTLTVQVPPTIGVTPDALSAAVDVRIDDPAIAERSFQITNTGESELNFTTGVG
TTVFSPPSTNSANLIANMDMRKYGQGNTERFDKNRLKSIESKPNKKLKLLSAKNIELEKN
ARVFSDSIFYDTGINFPDDFIGFGDGTALAFAVKFDAESDFTLNAVRNAYQTEDLDEVSI
ILEVIRGGETPDLGQLLTSQVITQTSADGIFLEEILNEPQEFNAGESFWVVHKYPEGIDF
SQGTFDTTSVRPDTYYASSDNGASYDNLDNFAFLTRALSGGDEGDYITLEPSSGTVAPGQ
SVEVSVSFDGSSLANGIFETDILVNSNDPVTPTAAVATSFEVSGQVSGIEVSDELLTFND
VFIGNENNRTFTISSTGLALLNIESITSDNPDFSVDLSSTVIPGGEEQEITVTFAPSTVG
SINGIISIVSDAPDTDTIEVIVNGIGVDPPTAILDPSEVFEVVDTGKTVTTEITLRNDGS
SPLVYSFPELTMAAALANPSAVISNNAELIEFSGFETKEKGIKDTRSGAKVLNSMGKDDE
FGYTWIDSDEEGGPVYFPFDISTIGFELTEFVGADGTAELALPFPIEFYDSTYESLFVNA
NGFVSFQPPTSPFTFFNGQIPVDDGINNIIAGFWADLEPQEEGGSVHIAAFADAVVVQWT
NAPIFFGNPEETVTFKIIILDDGTIDVFYDDVNAASFTDQGTVGIENADATDGAQVAFNT
PYIKDGLALRFIRPEIPLTNFISDISSLSGVIPAGGSRNLTVTLDATDLSPDVYYDELNV
SSNAPDKSTGTSLIELTVLDAPTVTNFTLINAETNEEVGPLEEGTIIDLANFASNSFSIL
ASVGEVPVSSVIYDFNGTEGFKTENIAPFTLAGDLNGNFNSVVFPLGNNTVTATPYPERG
GNGEAGKSLTINFEVIDTRVREITSFTLINADTDEEIGPLLEGDVIDLADFPSNSFSILA
SIGEAPVKSVVFDFNDTEGFKTENIAPYTLNGDLNGDFRSVSFPLGNNTVKATPFSESNG
EGEVGNALTINFEVVDTRASEITSLTLINAETNEEVGPLLEGDIIDLADFASNNFSILAS
VGDLPVRSVIFDFNGTQGFKTESIVPFTLAGDRNGNFNSVSFPLGNNTVTATPFSERSGN
GEAGTSLTINFEVVNSVENTSNSILNNGKVYPNPVENITQFTLEGTSNQTLKGTLHNMMG
QLVKESFDFKVDEFGSAPLDMTTLPKGVYILNLRDVTGKTVSQVRIIKE
NT seq
6090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaagttatcgcattttcacttttatcttgctttttgttttctgcggaattcaa
acggcacaggctcagaaaatggaaaaactgcctggtcctatcgtagtttgccccgcaaat
tatgaagatcagcattccagaatagccatgtcacaaatggcggcgaaaaagtcttctttt
tcacgtaccaaaaaatctgctacggctgaacttttggttacttttggtcccgaggcacag
tctaggcccgaggttgtggccgcattccagtttgccttggacatttgggcagaggaaatt
gtttcaaccgtacctatccggatttttgcagagtttgcagacttaggccccggggttctt
gcctcggcaggacccacctctatttttagggattttgaaggtgctccagaacctggtgta
ttctacccggctgctttggcaaacgccttggcaggggttgacttggatcccgaagaagaa
tttgatttagtggtaaatcttggaaacggcattccatggtattttggaacagatgggaac
actccggccggattatttgactttgtcactgtcgcattacatgaagctggccatgggtta
ggttttattgatggtggagatgttgataacaatggtgtaggttcgcttggctttgctggt
ggtgtacctatcatttttgatattttcgtagttgatggcgatggcaattcagtacttgat
ctgcccaacccatcacaagaattgggagacttctacaccagtggagatgtctttgtcaat
ggcacaaatgccgtagcggcacttggcggtgttctccccgaactatttgcaccaaatcct
tttcaaggaggctccagtattgcgcattgggacgaagcaacttttccagcaggtgacccc
aattcattaatgagcccacaagtgggagcttcagaatccaatttcaatattggtgatatt
actagagcacattttagcgacatgggatggcaaatcgcaggagctgcgccaattgcggcc
tcgccatcttcaatatccgatgaaattaacgtagatgaaatttcaattagcgaattgacc
gttacgaatgtatccgatcaatccgtggtagttacgcctagcgtagcgcctggttccttg
atagagctattcgaccctgccacaataacgttggatgtatctgaatctgccatactacaa
gtacagttcaatacaacaggtattacaaaaggcatttataccgacgaaatcatactgact
actgaagggtttgatagaacagtgaccataccggtaacactaagggttttagatggtaca
gaagcgcctatgatcggtatctcaccagaatcctttgatgaaacgatagatcaatttcaa
gtcatcactagagatttgagcatccaaaactcgggcgacgatgacttaaactataccatt
accattaacaatagcgatggtatctctccggtcggctttgaaaacagggtgacccttaca
aataattttatcgctactgaaggtttcaaaaccggaaattatgggactaatggagcacca
aaaggattgtcttctttgataacttcgcatgacggtatatttaattcaatcgttacgaac
cttttttcaggtgattttgaagagtatgcccttggtaatatcgatgatcagtttggatgg
ttcatatcggcagctaccgaagctgatgattgggtcgttaccaataccaatccttttgag
ggaaatcagcacattagtagtgtttctgatggtttaggcggtaatcgtttagcctttaca
cctgtaatcacgcccggcaacgaaccttttatggtctcctctaccagagtaaacattcaa
ggtagtggtactacgtgggaggttatcccgcaatcccccgctgcaggatcggtggtgacc
cgggtgcgtttcaatgcagaccgcagtatagatattttagatggtggatcatcggccttc
atacctattactgccgtaactcccgaaggttactttgatctacggattatagttgataag
gacgatgcggcaatgcaagtcttctttgacgacgaattggttttctctgggaccgctttt
gcctctgaaatagaacaagtggtatttttaaccccgatggaagcagtcggttctactatg
gacatagataatgttgaaattatagacggtgacgaaaatgcttttttccttactgtttcg
cccacagcaggcattgttccctttggaactactgaaaccgcaacggtaaagtttgacgca
agaagtctagttcccggtgtctacaatgctacgattaatgtagcaagtaatgatgaaaca
aatccgaatatagagatacctgttactctcacagttcaagtaccaccaacaataggtgta
actccagatgcgttaagcgctgctgttgacgtgagaatcgacgaccccgcgatagccgaa
cgttcgttccaaatcacaaacaccggtgaaagcgaattgaatttcacaaccggtgtcggt
acaacagtattttccccgccttctacaaatagcgccaacttgattgccaatatggacatg
cgtaaatatgggcagggcaatactgaaagatttgataaaaacaggcttaagtcaattgaa
agtaaaccaaacaaaaaactcaagctattatctgcaaaaaatattgagctagagaaaaat
gcaagggtattttcagattctatcttttacgatacaggtatcaattttccagatgatttt
ataggttttggggatggtaccgctttggcatttgcggtcaaatttgatgcggaaagtgat
ttcactcttaacgctgtcagaaatgcataccagactgaagaccttgatgaagtatcgatt
attctcgaagtcatcagaggaggagaaacacctgatttgggccaactcttgacctcgcag
gtcataacccagaccagtgccgatggtatctttttagaagaaattcttaatgaacctcaa
gaattcaatgctggcgaatcattttgggtagtccacaaatatccggaggggattgatttt
tcccaagggacttttgacacgacttcggtaaggcccgatacatattatgcaagttcggat
aacggtgcaagctatgacaaccttgacaactttgcctttttgaccagagcattaagtggc
ggggacgaaggggattatatcacgttggagccgtcttccggtactgttgcacccggtcaa
agtgttgaagtttccgtaagttttgatggaagctcattagcgaacggaatttttgaaaca
gatatcttggtgaatagcaatgaccctgttacaccaactgccgcggttgcgacttctttt
gaggtttcaggacaagtttcaggtattgaggtatcagatgaattattgacgtttaatgac
gttttcattggaaatgaaaataatcgaacttttacgattagcagcactggccttgcatta
ttgaacattgaaagcataacttctgataacccggattttagtgttgacctttcttcaacg
gtaatacccggtggagaagagcaagaaattacggtaacgttcgcaccttcaacagttgga
agtatcaacgggattatttccatcgtcagcgatgcacctgatacagatactattgaggtt
atcgtaaacggtataggggtcgacccaccaactgctattttagacccttcagaagtgttt
gaagttgtagatacgggtaaaacggtaactacagaaataacgttgcgaaatgacgggagt
tctcctttggtatattcctttccagaattgacaatggcagctgccttggcaaaccctagt
gccgtaataagcaacaatgcagagctaatcgagttttctggatttgaaactaaggaaaag
ggaattaaggatactcgctcaggtgcgaaagtactcaatagtatgggcaaggatgatgag
tttgggtacacgtggatcgatagcgatgaagaaggtggacctgtttatttcccattcgac
ataagtactataggctttgagcttaccgagtttgttggtgccgatggcacggcagagctt
gctttaccgtttcccatcgagttttatgacagtacttatgagagcctttttgtaaatgcc
aatgggttcgtatcgtttcaaccaccaaccagtccatttactttctttaatgggcaaata
cctgtagatgatggtataaacaatatcattgcaggtttctgggcagatttagaaccgcaa
gaagaaggtggatcagtgcatattgcagcttttgccgatgctgtggtggttcagtggacg
aatgctccgatattctttggtaatcctgaagaaacggtaacattcaagattattattctg
gatgatggaacaatagatgttttttacgatgatgtcaacgcagcgtcgtttacagaccaa
ggcacagttggtattgaaaatgccgatgccactgatggggctcaggtagctttcaacaca
ccctacataaaagatgggttggctttacgtttcattagacctgaaattccacttacgaat
ttcataagtgatatttcatcgttgtcaggagtaattccggcaggtggctcccgcaatttg
accgttacgttagatgccactgatttatctcccgatgtgtattatgacgaacttaatgtt
tctagcaatgcaccggataagagtactggaacatcacttattgaattaaccgtattggat
gcgcccactgtgaccaatttcacccttataaatgcagaaaccaatgaagaagtaggtccg
ctagaggaaggtacaataattgatttagccaattttgcatccaatagctttagtatttta
gctagtgtaggagaagttccggtaagcagcgtcatttatgattttaatggtactgagggt
ttcaaaacagaaaacatagcgccctttaccttggcaggtgatttgaacggcaatttcaat
tctgttgtcttcccattaggtaacaacacagtgacagcgaccccttatccggaacgtggc
ggtaatggggaagccggaaaatccttgacaataaactttgaggtaatcgatacaagagta
agagaaataaccagtttcaccctcataaatgctgataccgatgaagagataggcccatta
ttggaaggcgatgtgattgacttagccgatttcccatcaaatagttttagtattttggcg
agtataggtgaagccccggttaaaagtgttgtttttgatttcaacgataccgaaggtttc
aaaacggaaaatatcgcaccttatactttaaacggtgatttgaatggtgattttaggtca
gtatcgtttccattgggcaacaataccgtgaaagcaactccgttttcagaatccaatggt
gaaggagaagtcggtaacgctttaacgataaactttgaggtcgtagatactcgagcgagt
gaaattactagtctcacacttataaacgcagaaaccaacgaagaggtaggtccattgttg
gaaggtgatataatcgatctagcagactttgcttcaaacaattttagcattttagcaagt
gtaggggaccttcctgttagaagtgtcatctttgattttaatggtacgcaaggttttaaa
acggaaagcatcgtaccttttacattagcaggagatagaaatggtaacttcaactcagtt
agttttccattaggaaacaatacggtaaccgcgactcctttttcggaacgctcaggaaat
ggggaggctgggacttcgcttaccatcaactttgaggttgtaaatagtgtggaaaataca
tcaaattctattttaaacaatggaaaagtatatccaaaccctgttgaaaacataacacag
tttactttagaaggtacttctaaccaaactttaaaaggtacgctacataatatgatgggg
cagctggtaaaagagtcctttgattttaaagtagatgaatttggcagtgctcccctagat
atgacgactttgcccaaaggcgtgtatatattgaatcttagggatgtaacaggtaaaact
gtatcacaagtcaggataatcaaagagtga
DBGET
integrated database retrieval system
