Clostridium autoethanogenum: CAETHG_1070
Help
Entry
CAETHG_1070 CDS
T02883
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
cah
Clostridium autoethanogenum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_8
PAS_3
PAS_4
PAS_13
DUF5806
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGY75295
LinkDB
All DBs
Position
1156440..1158524
Genome browser
AA seq
694 aa
AA seq
DB search
MPKLVIVPIARDLLIENIKDIVIIVDSSNKIIDINPAGIKLIMSFKNKKFNIKQGMNFIG
IKFNDLLKFVPDIKHVTTVSDTSNEYTITFNFNNKTFYYRVYKSSIFDTDKSEIGRLFTF
HNITKMQEYTNNLKQLNDELLISYRIIGTAMEGILMTDASGNIIKVNDSFQRVSGYKKDD
LIGKNPRILKSGRHDKTFYLNMWHSLSTNGYWEGEIWNKKKNGKIYPKWMSITSLKGSDG
AVENYISISTDISKIKKTEDKLHSLAYYDLLTGIPNRTLFYERLERSLIRANDNKKAVAL
LFMDLDGFKVINDSLGHAAGDLLLKEVAARIKSSIRKSDTVSRLGGDEFTVILENVDSHE
YVQAVSEVIIDKILLPYSILDREITLGVSIGIALAPYDESTVEGLMRKADAAMYDAKESG
KGKYSFSSKEIEKRNQEILEMQIRLNAALHNKEFILYLQPQTAFDGNEFKIVGAEALIRW
ETADGKIFTPDKFIPVSENNRMIIPIGNWILEEIFKIDRILKSSGINIKLSINVSSKQFE
NNNLVSKIKEIFKENSPQNIDLVIEITESFLMQNTEKAIQNLQKIKELGIGISIDDFGTG
FSSLSYLTRLPADYLKIDKSFIDDIANINHKNITPSIISMAKTLNLKTVAEGVETQEQIN
RLIDEGCDELQGYYFSKPLIISDFIKYIKQYNKI
NT seq
2085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaagttagtaatagtgccaattgccagagatcttttaatagaaaatattaaggac
attgttattatagtagattcttctaacaaaataatagatatcaatccagcaggcatcaag
cttataatgtctttcaaaaataaaaaatttaatattaaacaaggtatgaatttcatagga
ataaaatttaatgatctattaaaatttgtaccagatataaaacatgttactacagtaagc
gatacaagcaatgaatatacaattacttttaacttcaacaataaaactttttactataga
gtatataaatcttctatctttgatacagataaatctgaaattggcagattatttaccttt
cacaatataactaaaatgcaggaatacactaataaccttaaacaactaaatgatgaatta
ttaatttcatatagaataatcggcactgcaatggaaggtatattgatgacagatgcttct
ggaaacattattaaagtaaatgattcttttcagagagtatctgggtataaaaaagatgat
ttaattggaaaaaatcctagaatactaaaatccgggcgtcatgacaaaaccttctactta
aatatgtggcacagtttaagtactaatggttattgggaaggtgaaatctggaataaaaag
aaaaacggcaagatataccctaaatggatgtcaataacctctttaaaaggatcagacgga
gcagtagaaaattatatttctatatctacagacatcagtaaaataaaaaagacagaagat
aaacttcacagtcttgcctattatgatttattaacaggaataccaaatagaactctcttc
tatgaaagacttgaaagatcacttataagggctaatgataacaaaaaagcagtagcttta
ctttttatggatttagatggttttaaagttataaatgattctttaggtcatgcagctgga
gatttgcttctcaaagaagttgcagctcgcattaaatctagtatccgtaaatctgacact
gtatcaaggttaggaggggatgagtttactgtaatacttgaaaatgtagacagccatgaa
tatgtacaagctgtatcagaagttattattgataaaatactgcttccttatagtatactt
gatcgggaaataactttaggggtaagtataggaatagcattagcaccctatgatgaatct
actgttgaaggattaatgagaaaagcagatgctgcaatgtacgatgcgaaggaatctgga
aaaggaaaatattctttttcttcaaaagaaattgagaagagaaaccaggaaattctcgaa
atgcaaataaggctcaatgcagcgcttcataacaaggaatttatattatatcttcagccg
caaactgcatttgatggaaatgaatttaaaatagttggcgctgaagcccttattaggtgg
gaaacagcagatggaaaaatatttacacctgataaattcatacctgtatctgaaaacaat
agaatgataatacctattggtaattggatattagaagaaatttttaaaattgatagaata
ctaaaaagcagtggtattaatattaaattatccattaatgtttcctcaaagcaatttgaa
aataacaatttagtttcaaaaattaaagaaattttcaaagagaatagtcctcaaaatatt
gatttagtaattgaaataacagagagttttttgatgcaaaatactgagaaagcaatacaa
aacttgcagaaaataaaggaattaggaatcggtatttcaatagatgatttcggcacaggg
ttttcttctctaagttatttaactcgtttgcctgccgactatttaaaaattgataaatcc
ttcatagacgatattgcaaatataaatcacaagaacattaccccaagtattatttctatg
gcaaaaactcttaatttaaaaaccgttgcagaaggagtagaaactcaagaacaaattaac
agattgatagatgaaggttgtgatgaactgcaagggtattattttagtaagccccttatt
atcagtgattttatcaaatatataaagcaatataataaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
