Campylobacter iguaniorum: CIG1485E_0427
Help
Entry
CIG1485E_0427 CDS
T03252
Name
(GenBank) PAS sensor-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
caj
Campylobacter iguaniorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
EAL
PAS_9
PAS_3
PAS
PAS_8
PAS_11
PAS_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AII14293
UniProt:
A0A076F9E2
LinkDB
All DBs
Position
410929..415041
Genome browser
AA seq
1370 aa
AA seq
DB search
MKVDKIRDSFSSGLLKRAYLISIISIFAIVFLLFFVFSSKVEKLEDELKANNLYYMTNVI
NQINYVYHDLSVISQEDLLAYKFEEIVAKNGAVMSIYLINDKLDILASINHSGNKLDKFQ
IEHHKKEFESKDTFISKFYYYNDDISFYIYIPTTNNKAFIVEMDAKELVKNMLAYSKRKN
GFLIDSDGFMLPGDKGYSVYDDFDLDILWKTTKHSIAITTKNDRFCFYHIYFNEALNLGI
VSRKSVFEFFSTDLALITCLFLILALVCFIVLDLFLFFKYRIIAQVDGLQKLLNGLKIGE
IPAKVINYDQKFSNISNNILNLYLNQVIAKNDLRDYKGQYSLIFQKSNINILFVDAKNGN
IIDASQAAIDFYGYEKTELIAMNIFDLQITNQYDESYNKISSVYGCDSIVCNHRLSNGDI
RIVRISSTIITTNFNSFYFMIVWDITDEQKKIDNINSEKVFLELSPILIVSFELDDIWKV
VQISNNVQSILGYKLEDILLTKFSFKTLIHDDDISAILRDVTHRAKLVGTSYESDTEFDR
LCRVKMANGKFEWFKIFIKIFKTETSTTATIFMFKNTEQKVMEDIYKERINKYQNLLLST
SSMPWDYDCKTQILTFSHSLALLLGYDGLNELGVVTYPNLSKVIHKNDLIKLDNAYESYV
NGLSDNFFVELRFIKKDGEPIWIQIKGRAISKDINGVPVQLCGMLEDISKKIESRSQIKL
IANIFSYAREGIVITALDGTIIDINDSFTHITGYAKEDVVGRTPSILKSNRHDGAFYKKM
WDDIQDIGFWHGEIWNRRKNGEIYPEILTISSVRGEDDEPLHYIAIFSDMTRSKDNEEKL
RKIAHYDTLTKVPNRFLALEYLKDFMDNADKTQRKFALAYIDLDGFKIANDIYGHHCGDA
VLVKMTNFIKDALRPNDILARFGGDEFVIIINDVENQAEFTSLLDSIIIAASNEIVVGSN
KIALSASMGVTIYPQTTNLSINDLLKQADWAMYHAKLAGKNRYYIFDTQKDMLFDYYNDL
LISSDKFEDNEFIPMYQPIIDVGLGAITSFELLVRWKHPVKGIMLPLDFLNILRNKKWFN
EFSIWVIKNAINAINSLPNSDIKFSVNVPFYQLMNDEFYAKFEELYVDMAPFSRLVIEIT
DTPLAQYPDIKPGIFDRYKKFGIDFVFDDFDANTAVVNILRDIPASRYKISKSYATTLLT
DVKNIEIIKNILCLCNAFGKIAILKGIENNYIYKIATDLGFKRIQGNFISKPVLSQDIKA
VMEDIVVQKVNEPKEDRSSYYEFLVFQMVCITKITISIDNNNSLLFDYTEYIKKYKEYLD
KIVAVPKCCEDVKNIIDRLHNEELDKPIKDSLLAELESKRLCILNSIDGD
NT seq
4113 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagttgataagatccgcgattcgttttcttctggtcttttaaaaagagcctaccta
atctctataatatctatatttgctatagtttttttactcttttttgtattttcaagcaag
gtagaaaagctagaagatgagctaaaagcaaataatttatactatatgacaaatgtcata
aatcagataaattacgtatatcatgatctatcagttatttctcaagaggatttgttggct
tataaatttgaagagatagtagctaaaaacggtgctgtgatgtctatatatctcataaat
gataagcttgatattttggcttccataaaccattctggaaacaaactagataaattccaa
atcgaacatcataaaaaagaatttgagagcaaagacacttttatatctaaattttattat
tacaatgatgatataagcttttatatttatatccctactacaaataataaagcatttata
gtcgaaatggatgccaaagaacttgtcaaaaatatgcttgcatactcgaagcgaaaaaac
ggatttttgatagatagcgatggatttatgcttcctggagataagggctatagcgtatat
gacgactttgatttggatattttatggaaaacaacaaaacatagcatagccataaccaca
aaaaatgatcgcttttgcttttatcatatatattttaatgaagctttaaatttaggaatt
gtttctagaaagtcggtttttgagttttttagcactgatttagcgttgataacttgcttg
tttttgattttggctttggtgtgttttatagttttggatctatttttgtttttcaaatac
aggattatcgctcaagtcgatgggcttcaaaagctactaaatgggctaaaaataggagaa
atcccagcaaaggtcatcaactacgaccaaaaattttcaaatataagcaataatatttta
aatttatatctaaatcaagttatagcgaaaaatgatctaagagattataaaggtcaatac
tctttaatcttccaaaaaagcaatatcaatatactttttgtcgatgcaaaaaatggaaat
attatagatgccagccaagcagccattgacttttatggatatgaaaaaacagaacttata
gctatgaatatctttgacttgcaaatcacaaatcaatatgatgaatcgtacaataaaatt
tcatcagtttatggatgtgatagcattgtttgcaatcatagattgtcaaatggagatatt
agaatagttagaatttctagcactatcattactacaaattttaacagtttttactttatg
atcgtttgggatataacagatgagcaaaagaaaatagacaatatcaatagcgaaaaagta
tttttggagttaagtccgattttgatagtgtcatttgagctagatgatatctggaaagta
gtgcagatctcaaacaacgtccaaagcatacttggatacaaacttgaagatattttgctt
actaaatttagctttaaaaccttaatacatgatgatgatatatctgctatattaagagat
gttacgcatagggctaagcttgtggggacttcttatgagagcgatactgagtttgatagg
ttgtgccgtgttaagatggcaaatggtaaatttgagtggtttaagatatttatcaaaata
tttaaaaccgagacttctacgacagctactatttttatgtttaaaaatacagagcaaaag
gtcatggaagacatctataaagaaagaatcaacaaataccaaaatctacttctaagtaca
tcttcaatgccttgggattatgactgcaagactcaaattttgacattttcacatagtctt
gctttgcttcttggatatgatggtttaaatgagcttggagttgttacttatccaaattta
tcaaaagttatacacaaaaatgatttgataaaactagataatgcctatgaaagttatgta
aatggactgagtgataacttttttgtggagcttagatttatcaaaaaagacggagagcca
atctggatacagataaaaggaagagcgatatctaaagacataaatggtgtacctgtgcag
ctttgtggtatgttagaagatatcagcaaaaaaattgaatcaagatctcagataaaactc
atcgcaaatatcttttcatacgcaagagaaggtatagttataaccgctttggatggaaca
attatagatataaatgattcatttactcatataactggatatgccaaagaagatgtcgta
ggcagaaccccaagcatactaaaatcaaataggcacgatggtgctttttataaaaaaatg
tgggatgatatccaagatattggtttttggcatggtgaaatttggaatagaagaaaaaat
ggagagatatatccagaaatactaactataagttctgtaagaggcgaagatgacgagcca
ttgcactatatagcgatattttcagatatgactagaagcaaagacaatgaagaaaaacta
agaaaaatagcccattacgatacgcttacaaaggtgccaaatagatttttggcattagaa
tatttaaaagattttatggataacgcagacaaaactcagcgtaaatttgctttagcttac
atagatcttgatggatttaaaatagcaaacgatatttacggtcatcactgtggcgatgcc
gtgcttgtcaagatgacaaatttcattaaagatgcattaagacctaatgatatattggct
agatttggtggagatgagtttgtcatcatcataaatgacgtggaaaaccaagcagaattt
actagcctactagattctattataattgctgctagcaatgaaatagtagtaggcagcaat
aaaatcgcactgagtgctagcatgggcgtgaccatttatcctcaaacaacaaatcttagt
ataaatgacttattaaagcaagcagattgggctatgtaccatgctaaacttgctggtaaa
aatcgttattatatatttgacacacaaaaagatatgttgtttgattattacaacgatctt
ttgatatctagtgataaatttgaagataatgagtttattcctatgtatcagcctataata
gatgtggggcttggagctattactagttttgagctgctagtcagatggaaacatccagtc
aaaggcattatgcttccgcttgactttttaaatattcttagaaataaaaagtggtttaat
gagtttagtatatgggttattaaaaatgcaataaatgctataaattctcttccaaactca
gatatcaaatttagcgtcaatgtgccgttttatcagctgatgaatgatgaattttatgct
aaatttgaagagctttatgtagacatggcgcctttttctagattagtcatcgagattact
gatacaccattagctcagtatccagatattaagccaggcatctttgataggtataaaaaa
tttggtattgattttgtatttgatgattttgatgcaaacacagcagttgtgaatatttta
agagatattccagcttctagatataagataagtaagtcttatgcgaccacgcttttaaca
gatgtaaaaaatatagaaataatcaaaaatatactatgcttgtgtaatgcctttggcaaa
atagccatactaaaaggtatagaaaataattatatctataagatagcaacagatcttgga
tttaagcgaattcaaggcaactttatatctaagccagtcctcagccaagacataaaagca
gttatggaagatatagttgtgcaaaaagttaatgagccaaaagaggatagatcaagctac
tatgaatttctagtatttcagatggtttgcataacaaaaattactatttctatagataac
aataactctttattatttgattatacggaatatataaaaaaatataaggaatatttggat
aaaatagttgctgttccaaaatgttgtgaagatgtaaaaaatatcattgatagattgcat
aatgaagaacttgataagccaataaaagatagtttattagcagagctagaaagcaaaagg
ctttgcattttaaatagtatagatggagattag
DBGET
integrated database retrieval system