Candida albicans: CAALFM_C201220WA
Help
Entry
CAALFM_C201220WA CDS
T00189
Symbol
CaO19.2002
Name
(RefSeq) linker nucleoporin
KO
K14309
nuclear pore complex protein Nup93
Organism
cal
Candida albicans
Pathway
cal03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cal00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
CAALFM_C201220WA (CaO19.2002)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cal03019
]
CAALFM_C201220WA (CaO19.2002)
Messenger RNA biogenesis [BR:
cal03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
CAALFM_C201220WA (CaO19.2002)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nic96
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3638856
NCBI-ProteinID:
XP_719452
UniProt:
A0A1D8PGB0
LinkDB
All DBs
Position
2:204898..207780
Genome browser
AA seq
960 aa
AA seq
DB search
MFGNKPATSGTGFSFGQTNQTAANGTNQTSQQQQQQPAVTIGSTTQSVINPPNGPTTGTT
TNFSLPVSVNTSNSSKLLKELLESANNLPKTNDNIQLGSIHLTLNELERKSQQLRKQSEK
DTNFTKAHYLLAGSGISADDIEDELNAIHIPKTGGRIPSHRAIVGAENIENYLSAKKDEN
ILNTIEQSLSLASKDFDNYIDANISIDWKVRRDELRKAVGLKTNTKFNEETLKNSIIWKS
NSAASNILTPLNTSSSSIRQISREKFENQAKIIYSLNEARLQNKSFPLCLNFNEVNKLQN
DIKAKQIAEIWKILISLTGEKTAKTSQEQKFFNTTKADLNAIIVTNSITYLQQEFFNYID
ELYLKDGDKPQSFAPPTNINKVSYFVHQIVLKNDPDLINKTLLVNGTPIWVLIFYLIRAG
LYLEADELVQRNREQFNKFDKNFPVYVKSYVENTNHVLPSDLNERLHKEFNQQFQFIIND
VDNNVNYDPYKYSVYKTIGKCDLSNKSLPRSVNLSIEDWTWFHLSIINANQPGSESNLIF
ENYTLSDLQNKIIQLGPKNFMSSPNNPLYLKTLILTGLYEMAVQYSYEYVNESDAVHLAI
GLAYYGLLKCSNFNKDNILTVNNNEYEINYGRLVGAYTTTFKISDPKVACEYLIMIALAN
GGESKSALLVCHEALRELILISREFGVLLGELNQTNGTKIPGILERQRKLIKLESLDQFY
QQIIEVAANKCQEEGRIFDALLLYQLCCDYDTVVSLINKLLAEILATTDLNKPIIKSGNY
EVISTGYITKEVDDTIDNNIILLAQHIMKVFNNNSHILGKLSSKVKHTSELLLPIIGIRD
LFIKKDWRQVINDINQLGLIPVGVNDDLIKIRTMSESIQNNDLDDNLIKIIPSLLIMVMT
SISHINYNILTKKYQSYGNEKQELIHWKKIAKNCMIYAGMVQYKMPRETYSLLINLESSL
NT seq
2883 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggaaataaaccagctacatctggaacagggttttcttttggtcagaccaaccaa
actgctgcaaatggaacaaaccagacctcacaacaacaacagcaacaaccagctgtaacc
attggatcaacaacacaatcagtaatcaaccctccaaatggtccaactaccggaacaaca
acaaacttttctcttcctgtatcagtaaacacttcgaatagctctaaattattgaaggag
ttattggaatcagccaacaatttaccgaaaactaatgacaacattcaattgggatccatt
caccttactttgaatgaattagaaagaaaatcacaacaattaaggaaacaatcagaaaaa
gataccaatttcaccaaagcccattacttattggcaggtagtggaatcagtgctgatgat
attgaagatgaattaaatgcaattcatatacctaaaactggtgggagaataccaagccat
cgtgccattgttggtgcagaaaatattgaaaattatttaagtgccaagaaggatgaaaat
attttaaacaccattgaacaatcattatcattggcatcaaaagattttgacaactacatt
gatgccaacatatccattgattggaaagttagaagagatgaattgagaaaagcagttggt
ttgaaaacaaacactaaattcaatgaagaaactttgaaaaattccattatttggaaatca
aattctgctgcttcaaacattttaactccattaaatacttcttcttcttcaatcagacaa
atttcaagagaaaaatttgaaaatcaagccaaaattatttattcattgaatgaagcaaga
ttacaaaataaaagtttccccttgtgtttaaatttcaatgaagttaataaacttcaaaat
gatattaaagctaaacaaattgctgaaatttggaaaattttgatttctttaactggtgaa
aaaaccgctaaaacttctcaagaacaaaaatttttcaatactaccaaagcagatcttaac
gctataattgtcaccaacagtataacttatttgcaacaagaatttttcaattatattgat
gaattatatcttaaagatggtgataaaccacagagttttgccccaccaacaaatattaat
aaagtatcttattttgttcatcaaattgtgttgaaaaatgaccctgatttgatcaacaaa
actttattggtaaatggaactcctatttgggtattgatcttttatcttatacgtgctgga
ttatatttggaagctgacgaattggttcaacgtaatcgtgaacagttcaacaagtttgac
aaaaatttccctgtttacgtaaagagttatgtggaaaacactaatcacgttttaccttca
gatttgaatgaaagattacacaaagaattcaatcaacaattccaattcattattaatgat
gtggataacaatgtgaactacgatccttataaatattccgtttataagactattgggaaa
tgtgatttaagtaacaaatcattacctcgttcagtgaatttaagtattgaagattggaca
tggtttcatttatctattattaatgctaatcaaccgggatctgaatctaatttaattttt
gaaaattacactttatcagatttacaaaataaaattattcaattaggtcctaaaaatttc
atgtcatctccaaataatccattatatctcaagactttaatcttgactggactttacgaa
atggcagtacaatactcttatgagtacgtaaatgaatctgatgcagttcatttggctata
ggtttagcttattatggattattgaaatgttctaatttcaacaaggacaatattttgact
gtcaataacaatgaatatgaaatcaattatggaagattagttggggcatataccaccact
tttaaaataagtgatccaaaagttgcttgtgaatatctcattatgattgccttggccaat
ggaggtgaatctaaaagtgctcttcttgtttgtcatgaagcattacgtgagttgatattg
atttctcgtgaatttggtgtattacttggagaattaaatcaaacaaatggaacaaaaata
ccagggatcttagaaagacaacggaaattgattaaattggaaagtttagatcaattttat
caacaaattattgaagttgctgctaataaatgtcaagaagaaggtagaatctttgatgca
ttgttattatatcaattatgttgtgattatgacacggttgtttctttgattaacaaatta
ttagcagaaatacttgccaccactgatttgaataaacctattattaaatcaggtaattat
gaagttatatctacgggatatatcactaaagaagttgatgacaccattgacaataatatt
attttattggctcaacatattatgaaagttttcaataataatagtcatatacttggaaaa
ttatcatctaaagtgaaacatacatcagagttattacttccaataattggaattagagat
ttatttatcaaaaaagattggcgtcaggttatcaatgacattaatcaattaggacttatt
ccagttggggttaatgatgatcttattaaaattagaacaatgagtgaatcaatacaaaat
aatgatttagatgataatttaattaaaattattccatcattattaattatggtaatgacc
agtatttctcatataaattataatattttaactaaaaaatatcaatcttatggtaatgaa
aaacaagaattgattcattggaaaaaaattgctaaaaattgtatgatttatgctggaatg
gttcaatataaaatgcctagagaaacttatagtctattaattaatttggaatcactgtta
taa
DBGET
integrated database retrieval system