Candida albicans: CAALFM_C406410WA
Help
Entry
CAALFM_C406410WA CDS
T00189
Symbol
CaO19.2893
Name
(RefSeq) mRNA splicing protein
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
cal
Candida albicans
Pathway
cal03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cal00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cal03019
]
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
03041 Spliceosome [BR:
cal03041
]
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
Messenger RNA biogenesis [BR:
cal03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
Spliceosome [BR:
cal03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
Complex C
CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_M
HAT_PRP39_N
HAT_PRP39_C
Mad3_BUB1_I
NRDE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3642796
NCBI-ProteinID:
XP_715549
UniProt:
A0A1D8PMK6
LinkDB
All DBs
Position
4:1420866..1423403
Genome browser
AA seq
845 aa
AA seq
DB search
MTLDLDKLIADEDISYEESISKDPTNISTWISYYNFKSNATSTTSLYNKLFILYRSVKSN
PTSIELWQLLIDLVLLEQSQIQSDTIIEIFETALINLSTNHEIWIQFFKYLLLTSSDGDD
GEYHINKVTYIRRMFNNCLKSIPLVDHILIWPLYLQFADTIGGITAVKIYLKYKQFLPLS
ILQGKENVNKQRNYGMNLHEIIDKLRKFGDVENVMKFYYEIITNPNDYAKLPQPIVYYLF
QYIDLLIRIKKSFDDDYFETLLTKSLYQYPDHLGKLYIKATKYFKSRGNIEKTRYYYNQG
IKKCCTIKDFTMIYDSYLQFEENQVTEITEKVDPESDLGSLYLDDFEKLIDDRKILLNDM
KLRQNINDLDTWFERFEIIETQTPDDLNLLIQTLTQALKSINPLKVVTTNNSKLSGIWLK
YVDIYSSRGDFQTADLIFSKSVLSQYIDPDELAELYINWSEMILGSDKFPETKAIEILDD
ILYREYSDINYTDNSKPVQQRIIKSIKLWNFYIDLLESFIESDNQLKEIEKVTNAYQHLI
KLKIATPRIMINFAQFLESWNQYEQCFNVLHQALKIFQNDNQIKFEIWNVYLIKAIKHIQ
LTERIRDLFEQSINEIAAYLVKPILLLYYQYELDQGYTYNAIKILIKSLTEKFTPAQKDH
KLSTTNPQQRKEINLSKFEIYKLIMIELGEIQDIEQFNKIGTMAMNDEYLSNYQLFDLGS
RFIKFEISTVTATAAATTNGNITTTSDSQWGRIRELFKFLCQSTLLDESWKMWESFEMEY
GDELSFKDMLRFKRIVLNSIANDKAIRESANPMGFLKSMSITTTPNTKTESDEKIANPDI
IDIDM
NT seq
2538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattggatttagataaactaatagctgacgaagatatatcttacgaagaatcaata
tctaaagatccaactaatatttcaacctggatatcatattataattttaaatccaatgcc
acttccaccaccagtctatataataaattattcattttatatcgtagtgttaaatcaaac
cctacatcaattgaattatggcaattattaattgatcttgtgttattggaacaatcacaa
atacaatcagatactattattgaaatatttgaaacggcattgattaatctactgacaaac
catgaaatttggattcaatttttcaaatatctattattgaccagtagtgatggtgacgat
ggcgagtatcatataaataaggtgacgtatataaggagaatgtttaataattgtttgaaa
agcattccgttagtcgatcatatattgatttggccattatatttacaatttgccgacaca
ataggtggtattactgcggttaagatatatttaaaatataaacaatttttaccattgtca
atattacaggggaaagagaatgttaataaacaaagaaattatgggatgaatttacatgaa
attatagataagttacgaaaatttggtgatgttgagaatgtaatgaaattctattatgaa
attatcactaatcccaatgattatgccaaattaccccaaccaattgtttattatttattc
caatatattgatttgttaattagaataaagaaatcatttgatgatgactattttgaaact
ttgttgacaaaatcattatatcaatatccagatcatttagggaaattatatatcaaggca
actaaatatttcaaatctcgtgggaacattgaaaaaactcgttactattacaatcaaggg
attaaaaaatgttgtactatcaaagattttactatgatatatgattcatatttacaattt
gaagaaaatcaagtgacagaaataacagaaaaagttgatcctgaatcagatttgggatct
ttatatttagatgattttgaaaaattgattgatgatcggaaaattttacttaatgatatg
aaattacgacaaaatatcaatgatttagatacttggtttgaaagatttgaaattattgaa
acccaaactccggatgatttaaatttattaattcaaacattaacacaagcattaaaatca
attaatccattgaaagtggttacaacaaacaactccaaattaagcgggatatggttaaaa
tatgttgacatttattctagtcgaggagattttcaaactgccgatttaattttttcaaaa
tcggtattatcacaatatattgatcctgatgaattggcagaattatatatcaattggagt
gaaatgattttaggaagtgataaattccctgaaaccaaagctattgaaattcttgatgat
atattatatcgagaatattctgatattaattacaccgacaatagtaaaccagtacaacaa
agaatcatcaaatctattaaattatggaatttttatattgatttattagaatcatttatt
gaatctgataatcaattgaaagaaattgaaaaagttactaatgcttatcaacatttaata
aaattgaaaattgccacaccacgaatcatgataaatttcgctcaatttttagaatcttgg
aatcaatatgaacaatgtttcaatgtattacatcaagcattaaagattttccaaaatgat
aatcaaattaaatttgaaatttggaatgtttatctcattaaagccattaaacatatacaa
ttaaccgaaagaattcgtgatttatttgaacaaagtataaatgaaatcgccgcatattta
gtaaaaccaatattattattatattatcaatatgaattagatcaaggatatacttataat
gccatcaagatattaattaaatcattaactgaaaaattcacaccagcacaaaaggatcat
aaattatcaacaacaaatccacaacaaagaaaagaaatcaatttactgaaatttgaaata
tataaattgataatgattgaattaggagaaattcaagatattgaacaatttaataaaata
gggacaatggccatgaatgatgaatatttatcaaattatcaattattcgatttaggtagt
cgatttataaaattcgaaatatcaacagtcaccgccaccgccgccgccaccaccaatggt
aatatcaccacaactagtgatagtcaatggggtaggattagagaattatttaaattttta
tgtcaatctacattattagatgaaagttggaaaatgtgggaatcatttgaaatggaatat
ggtgatgaattgagttttaaagatatgttacgatttaaacgtatagtattgaattcaata
gctaatgataaagccattagagaatcagctaatccaatggggttccttaaaagtatgtcc
ataactaccacccccaataccaaaactgaatctgacgagaaaattgcaaatccagacata
attgatatagatatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system