KEGG   Candida albicans: CAALFM_C406410WA
Entry
CAALFM_C406410WA  CDS       T00189                                 
Symbol
CaO19.2893
Name
(RefSeq) mRNA splicing protein
  KO
K12867  pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
cal  Candida albicans
Pathway
cal03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cal00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:cal03019]
    CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
   03041 Spliceosome [BR:cal03041]
    CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
Messenger RNA biogenesis [BR:cal03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
Spliceosome [BR:cal03041]
 Complex B
  Other components
   Prp19-related factors
    CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
 Complex C
    CAALFM_C406410WA (CaO19.2893)
SSDB
Motif
Pfam: HAT_Syf1_CNRKL1_C HAT_Syf1_CNRKL1_N HAT_Syf1_M HAT_PRP39_N HAT_PRP39_C Mad3_BUB1_I NRDE-2
Other DBs
NCBI-GeneID: 3642796
NCBI-ProteinID: XP_715549
UniProt: A0A1D8PMK6
LinkDB
Position
4:1420866..1423403
AA seq 845 aa
MTLDLDKLIADEDISYEESISKDPTNISTWISYYNFKSNATSTTSLYNKLFILYRSVKSN
PTSIELWQLLIDLVLLEQSQIQSDTIIEIFETALINLSTNHEIWIQFFKYLLLTSSDGDD
GEYHINKVTYIRRMFNNCLKSIPLVDHILIWPLYLQFADTIGGITAVKIYLKYKQFLPLS
ILQGKENVNKQRNYGMNLHEIIDKLRKFGDVENVMKFYYEIITNPNDYAKLPQPIVYYLF
QYIDLLIRIKKSFDDDYFETLLTKSLYQYPDHLGKLYIKATKYFKSRGNIEKTRYYYNQG
IKKCCTIKDFTMIYDSYLQFEENQVTEITEKVDPESDLGSLYLDDFEKLIDDRKILLNDM
KLRQNINDLDTWFERFEIIETQTPDDLNLLIQTLTQALKSINPLKVVTTNNSKLSGIWLK
YVDIYSSRGDFQTADLIFSKSVLSQYIDPDELAELYINWSEMILGSDKFPETKAIEILDD
ILYREYSDINYTDNSKPVQQRIIKSIKLWNFYIDLLESFIESDNQLKEIEKVTNAYQHLI
KLKIATPRIMINFAQFLESWNQYEQCFNVLHQALKIFQNDNQIKFEIWNVYLIKAIKHIQ
LTERIRDLFEQSINEIAAYLVKPILLLYYQYELDQGYTYNAIKILIKSLTEKFTPAQKDH
KLSTTNPQQRKEINLSKFEIYKLIMIELGEIQDIEQFNKIGTMAMNDEYLSNYQLFDLGS
RFIKFEISTVTATAAATTNGNITTTSDSQWGRIRELFKFLCQSTLLDESWKMWESFEMEY
GDELSFKDMLRFKRIVLNSIANDKAIRESANPMGFLKSMSITTTPNTKTESDEKIANPDI
IDIDM
NT seq 2538 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacattggatttagataaactaatagctgacgaagatatatcttacgaagaatcaata
tctaaagatccaactaatatttcaacctggatatcatattataattttaaatccaatgcc
acttccaccaccagtctatataataaattattcattttatatcgtagtgttaaatcaaac
cctacatcaattgaattatggcaattattaattgatcttgtgttattggaacaatcacaa
atacaatcagatactattattgaaatatttgaaacggcattgattaatctactgacaaac
catgaaatttggattcaatttttcaaatatctattattgaccagtagtgatggtgacgat
ggcgagtatcatataaataaggtgacgtatataaggagaatgtttaataattgtttgaaa
agcattccgttagtcgatcatatattgatttggccattatatttacaatttgccgacaca
ataggtggtattactgcggttaagatatatttaaaatataaacaatttttaccattgtca
atattacaggggaaagagaatgttaataaacaaagaaattatgggatgaatttacatgaa
attatagataagttacgaaaatttggtgatgttgagaatgtaatgaaattctattatgaa
attatcactaatcccaatgattatgccaaattaccccaaccaattgtttattatttattc
caatatattgatttgttaattagaataaagaaatcatttgatgatgactattttgaaact
ttgttgacaaaatcattatatcaatatccagatcatttagggaaattatatatcaaggca
actaaatatttcaaatctcgtgggaacattgaaaaaactcgttactattacaatcaaggg
attaaaaaatgttgtactatcaaagattttactatgatatatgattcatatttacaattt
gaagaaaatcaagtgacagaaataacagaaaaagttgatcctgaatcagatttgggatct
ttatatttagatgattttgaaaaattgattgatgatcggaaaattttacttaatgatatg
aaattacgacaaaatatcaatgatttagatacttggtttgaaagatttgaaattattgaa
acccaaactccggatgatttaaatttattaattcaaacattaacacaagcattaaaatca
attaatccattgaaagtggttacaacaaacaactccaaattaagcgggatatggttaaaa
tatgttgacatttattctagtcgaggagattttcaaactgccgatttaattttttcaaaa
tcggtattatcacaatatattgatcctgatgaattggcagaattatatatcaattggagt
gaaatgattttaggaagtgataaattccctgaaaccaaagctattgaaattcttgatgat
atattatatcgagaatattctgatattaattacaccgacaatagtaaaccagtacaacaa
agaatcatcaaatctattaaattatggaatttttatattgatttattagaatcatttatt
gaatctgataatcaattgaaagaaattgaaaaagttactaatgcttatcaacatttaata
aaattgaaaattgccacaccacgaatcatgataaatttcgctcaatttttagaatcttgg
aatcaatatgaacaatgtttcaatgtattacatcaagcattaaagattttccaaaatgat
aatcaaattaaatttgaaatttggaatgtttatctcattaaagccattaaacatatacaa
ttaaccgaaagaattcgtgatttatttgaacaaagtataaatgaaatcgccgcatattta
gtaaaaccaatattattattatattatcaatatgaattagatcaaggatatacttataat
gccatcaagatattaattaaatcattaactgaaaaattcacaccagcacaaaaggatcat
aaattatcaacaacaaatccacaacaaagaaaagaaatcaatttactgaaatttgaaata
tataaattgataatgattgaattaggagaaattcaagatattgaacaatttaataaaata
gggacaatggccatgaatgatgaatatttatcaaattatcaattattcgatttaggtagt
cgatttataaaattcgaaatatcaacagtcaccgccaccgccgccgccaccaccaatggt
aatatcaccacaactagtgatagtcaatggggtaggattagagaattatttaaattttta
tgtcaatctacattattagatgaaagttggaaaatgtgggaatcatttgaaatggaatat
ggtgatgaattgagttttaaagatatgttacgatttaaacgtatagtattgaattcaata
gctaatgataaagccattagagaatcagctaatccaatggggttccttaaaagtatgtcc
ataactaccacccccaataccaaaactgaatctgacgagaaaattgcaaatccagacata
attgatatagatatgtaa

DBGET integrated database retrieval system