KEGG   Caloramator sp. E03: FDN13_09865
Entry
FDN13_09865       CDS       T05994                                 
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
cale  Caloramator sp. E03
SSDB
Motif
Pfam: HTH_18 HTH_AraC GGDEF_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCX33986
UniProt: A0A5B7TH69
LinkDB
Position
2008076..2010415
AA seq 779 aa
MKSLYLKLKKIVKFKSIFQRLIFSFLSVISIIMMIYTTVLYYEYKIYILEQSEDTSKKIL
NQAEYYIGYTLNWAKSYVYQLYLDEDIYNLMFNNKILSLTGENKIKQAALRLPFVQSIYV
YNYNTNTIYTSISNSSKYDEFYDKEIIDIIKNSNETMSTRFIPRKININIGKQKYYKDVL
SVLLTNIKSTDKKVPYGAIVLNVDANSVQAYFKDMSQKGYNLFAIDKNGVVIFDSNPELF
LKNISSKDYIQKILNSKKESGSFLCKIDGIPYIVTYKTSHNLELKMINIVPYEALMGIIY
KMMHFMINIFIILFLLGLILSFFYSEKIYLPIAKILKTLKNYYAEDDEFDLKEQDTTDIE
YMSKAVDEIIRRYETSGKLSEADANFIKRQLIINLLLNIKTGTEDIKNKLIELGSNLNFD
NTYVILFKIDKYKELIKQNDLQYPISDLEGKLRLVVDDIFSRCFKNEIVIINDNELCVIV
DFEEDNHNASMDKIIKAIKSVQEILYKNNISVSASIGKVSHGIEDISMSYSTAQHYINYR
FKYGLKSILYNEKITADITAEYKYNEDMEQAIFKCIRSGNIDETEKELDKIFSHFMSFSY
SDMIIAITQLVINIIRVINNMLRMNKESVYINIGDFMNNMSSYETIDDIKSYIMGLTEYI
SQKMKDKKSNKKNDVVEKVKNYIYLNYENPLLSLEVIAEKMKLSSSYLRVLFKEIEGKSL
STFINEVRFENARKLLETTNLSVIEIAEKVGFTNSNYFYTAFKKFYGISPNQYRNSIGD
NT seq 2340 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatctttatatttaaaattaaaaaaaatagtaaaatttaagagcatttttcaaagg
ttaattttttcatttttatcggtaatatcaataataatgatgatatatacaactgtttta
tattatgaatataaaatatatatattggaacaatctgaagatacttcaaagaaaattcta
aatcaagctgaatattatataggatatactttaaattgggcaaaatcttatgtgtatcag
ctatatttggatgaagatatatataatcttatgtttaataataagatattatcattaaca
ggggaaaataaaataaaacaagctgcattaaggcttccttttgtgcaatctatatatgtt
tacaattacaatactaatacaatatatacttctatcagtaattcatcaaagtatgatgag
ttctatgataaagagataattgatatcataaaaaatagtaatgaaacgatgagtacgaga
tttattcccaggaaaattaatataaatataggtaagcagaaatattataaagatgttttg
tcggttcttttaacaaatataaagtctacagataagaaagtaccttatggagcaatagta
ttaaacgttgatgctaattctgtacaagcatattttaaagatatgtctcaaaaaggttat
aatctttttgcaatagataaaaatggagttgttatttttgattcaaatccagaattattt
ttaaagaatatttcatccaaggactatatacaaaaaatattaaattcaaaaaaagaaagt
ggaagctttctttgtaaaattgatggtataccttatatagtaacttataaaacaagtcac
aatttagaattgaagatgataaatatagtaccttatgaagcgttaatgggtattatttat
aagatgatgcattttatgataaatatttttattattctatttcttttaggactaattctt
tctttcttctattctgaaaagatatatttacctattgcaaagatattaaaaactttaaaa
aattattatgcagaggatgatgaattcgatttaaaagaacaagacacaacagatatagaa
tatatgtcaaaagcagttgatgaaattattagaagatatgaaacatcgggaaaactatca
gaagcagatgcaaattttattaaaagacaattaataataaatttattattaaatataaag
acaggaacagaagatataaaaaataaactgatagaacttggttcaaatcttaattttgat
aatacttatgttatactttttaaaattgataaatataaagaattaataaaacaaaatgat
ttacaatatccaatatccgatttagaaggaaaacttcgtttagttgttgatgatatattt
tcaagatgctttaaaaatgaaattgtaattataaatgataatgagctatgtgtcattgtt
gattttgaagaagataatcataatgcatctatggataaaattataaaagctattaaaagc
gtacaagaaatattgtataagaataacatttcagtatcggcttcaattggtaaggtttct
catggtatagaagatatatctatgtcttatagtacagcacagcattatattaattacagg
tttaaatatggtttaaagtctattctatataatgaaaaaataactgctgatattactgct
gagtataaatataatgaagacatggaacaggcaatatttaaatgtattagatcgggaaat
attgatgaaacagaaaaagagctggataagatatttagccattttatgtcattttcctat
agtgatatgataattgctataactcaacttgtaattaatattatcagagttattaataat
atgttaagaatgaataaagaaagcgtatatataaatattggtgactttatgaataatatg
agcagttatgaaactattgatgacataaaaagttatataatgggattaacggaatatata
tctcaaaaaatgaaagataaaaagagcaataaaaagaatgatgttgtggaaaaagtaaaa
aattatatatatttaaattatgaaaatccgttattatctcttgaagttattgcggaaaaa
atgaaattatcatcaagttatttaagggtactctttaaagaaattgaaggcaagtcttta
tctacatttattaatgaagtgagatttgaaaatgctagaaaacttcttgaaacaacaaac
ctttctgttattgaaatagcagaaaaagtaggttttacaaactctaattacttttataca
gcatttaagaagttttatggtatttcgcctaatcaatatagaaatagtataggagattaa

DBGET integrated database retrieval system