KEGG   Calothrix sp. 336/3: IJ00_04730
Entry
IJ00_04730        CDS       T03937                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K09800  translocation and assembly module TamB
Organism
calh  Calothrix sp. 336/3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:calh00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:calh02000]
    IJ00_04730
Transporters [BR:calh02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   IJ00_04730
SSDB
Motif
Pfam: TamB YhdP
Other DBs
NCBI-ProteinID: AKG20703
UniProt: A0A0T7BPA9
LinkDB
Position
1200836..1206529
AA seq 1897 aa
MTNPPNSERQSPTPSQQRLWWLILVRGGLTLSGIIVIGLVGGYLWLQNFIRKDLTPIASK
SLTTTLNRPVKLGNVKEFSLSGVKFAASSIPATPTDPDNATVETVEVTFNPLQFLFTRTL
KLDVNLINPQVYLAQDAEGKWLSTTFTPPKRGGAFTTDLDYLRFQNAKLELVPRKQSTGE
KNQNSSLTPSLPGVKFTQINGTSQLLDKNSLLKFELTGKPESGGNIALRGETRPRLASYN
IQQLRAQDLAATDVARLVKLPLTLQSGLIDGDIALQWQQQETPLMQGSVNLKNVKAQVPK
MPQPFNNAQGKVSFQGKDVRLENVSTSYGKIPLVAKGLINRDSGYDLTARVNAVTVAIAV
ETLKVKLPVPVTGEAKADLTLTGTIQKPLLAGTVTTIKPAKIDKVDFQSVGAKFAYLTTA
GVMNFSQIQGKPSLGGSITGDGRLQLGTKPSLDFNLTGKNLPGDAIATLYNTKSAVKLGT
VAATAKITGSPNQVQTSVDFQAPGAIYPATGQVIVNPDKTVAFRNVKLALAGGTVLAAGT
WNQQRWQAVANANQIPIAPFIQPEQRQNLILDDARFNGNLALAGTSAPFQLSTIRPQNAQ
LRLGGGTVTVASLQWGEENFATELIADGIRLAKLFKNPLPPSLGAPLSGKFQLAGNRENI
SLQTLQGRGDARLAVGGGTINARNIQLAQGNYQAQVEVNQVSLPQLAAVPRQFAGKLNGQ
FTVAGTVDNFKPENIQATGQGRLSLGGGVINAKNIQLSNGNYRAQVQGNNLPLQRFNSPI
PGLLGGNFLVAGSVNSLKPESIKATGNAQVNIAGGTVTAKNIQLANGRYQAVVTAANIAL
NRFSPQLRGLFAGNFQVFGNTKSFSLGNIQGQGEMAFSQGLPGIARPLTAVAAWNGSKLT
VANATAPGLNARGEILVSTRKSVPEITQLNLDVQAQDYNLQELPVQLPQAIALTGSADFD
GKITGKLPKPNILGQVALRNLVVNKLSVESLLRGNIEFVAGKGTILDVAGLRDKIAFNLD
GNNRPRSFQVKWNQALASGITRGENLAAKLENIPLQVLNITVPAKARFAGGKLEGNLTGD
VLVNLQTLAANGKLAIAQPQIGRIKGDRLAANFRYAGDSLDLTDSEFAKGASSYRLVGNF
RQINSNPQIQAKLNVNQGDIQELLNTLQISSFDDLRQDTPTSGKAENLNTIPVGLPNAPL
DRQLARFSEIDALLAIQEQQRLNASLIPELADLSGKFSGEVTFDNTQPNGLAVGFNLLGE
QFIWGRKVKNDANTCENPQRCYRGDRIIAQGKLENNILRLIPLRIETKNRLIAFTGNIGG
QEQTGKLEVVNLPMAIIDSYVKLPVKVGGNLNATAYLAGSIENPQAKGELAVTQGDINGK
KLESADTSFSYNNGRLNFGSQVVVTGSSEPVTITGYVPYQVPTATTSSPDNKINMDIRVK
NEGLAVLNAFTNQIAYESGKGEVFLQVRGTMKEPELNGIASLKDAIFTAQTLTGKLTEVT
GNARFTLNRLIVEKLQGQYGQGSINIAGELPISNPLLPIQTPLTVDMQKLTLNLKGLYQG
GVGGNLKITGAAISPEIGGQLQLDNGKILLAESSSNGSGNAANLNKANKELESEENQAFT
SLKNLEIKLGKNVEIVRPPILSFRATGSLTVNGSLSNPLPEGTISLRSGDVNLFTSQFNL
VRGYKNTATFTETQPRNPELDIRLITRVLDINPRQISTNSISSEINEGIITNIEPVKTVK
IEAIIRGRASQLQENLELKSTPNRSQTEIIALLGGSFVETFGRGDSTLGLVNLAGSALNL
QRTFTQIGSAFGLSEFRLFPTISSDDGETRRGSALDLAAEAGIDVTSNFSVSTSKILTSN
KPAQFGINYRINPEIRLRTSTDFSGDNRALVEFEKRF
NT seq 5694 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactaaccctcccaattctgaacgtcagtctccaactcccagtcaacagcgtctgtgg
tggttaattctagttcgtggtggtctgaccctaagcggaattattgttataggattagtt
ggtggttatttgtggctccagaattttatccgtaaggatttaacccccattgccagcaaa
agtttaaccacgactctcaaccgtcccgtaaaattggggaatgtcaaggaattctcactt
tctggagtgaaatttgcagcttctagcatacccgccacacccacggatccagataatgca
acggtggaaactgtagaagtcaccttcaatcccctacagtttctcttcactcgcaccctg
aaattagatgtgaatctaattaatccccaggtatatcttgctcaggatgcagaggggaaa
tggctaagtactacttttactcccccgaaaaggggtggtgcattcaccacagacttagat
tatttacggtttcagaatgccaagttagagttagtaccgaggaaacagagtacaggggaa
aaaaatcagaattcttcccttaccccttcccttcccggtgtcaaatttacccaaatcaac
ggtacttcccaactcttagacaagaatagtttactgaaatttgaactgacaggtaaacca
gaaagcggtggtaatattgctctgcggggggaaactcgtccgaggttagccagttataat
attcaacaattacgtgcccaggatttagctgccactgatgttgcacggttggtaaaatta
cccctaactctccaatcaggtttaattgatggggatattgccttgcaatggcaacaacag
gaaactcccctgatgcaaggaagtgtgaatctgaagaatgtcaaagcacaggttcccaaa
atgccccaaccttttaataatgcccaagggaaggtgagttttcaagggaaggatgtgcgg
ttagagaatgtcagcacgagttatggcaaaattcccttggtggcgaagggtttaattaat
cgagatagtgggtatgatttaacagcacgggtaaatgcggtcacggtggcgatcgcggtg
gaaactttgaaggtaaaattacctgtacctgtgactggggaagccaaagcagatttaacc
ctgacgggaacgattcaaaaacccctacttgcgggtactgtcaccaccattaaacctgcc
aaaattgataaggtagattttcagtcagtgggagcaaagtttgcctatttgacgactgct
ggggtgatgaatttctcccaaattcaggggaaaccaagtcttgggggaagcattactggt
gatgggagattgcaacttggtacaaaacccagtctcgattttaatttgacagggaaaaac
ctaccgggggatgcgatcgccaccctctacaatactaagtctgcggtcaaattgggcaca
gtggcagccactgccaaaattacgggtagccccaatcaagtgcaaacatctgttgatttc
caagcaccaggtgctatctaccccgcaacgggacaggtgatagttaatcctgataaaact
gtggctttccggaatgttaaacttgccctagctgggggtacagtcttggctgcgggaacc
tggaatcagcaacgttggcaagctgtggcaaatgcgaaccaaattcccatcgctcccttt
attcaaccagaacaacggcaaaatcttatcctggatgatgctcgatttaatggtaatctt
gccctagctggaacctctgcacccttccaactctctaccatccgtccccaaaatgcccaa
ttgcgactagggggtggtactgtcaccgttgccagtttgcagtggggagaggaaaatttt
gctacggaattgatagctgatggtatccgtctggctaaattattcaaaaacccccttccc
ccatccctgggcgctcccctctctgggaaattccaactcgcagggaatcgggagaatatc
agcttacaaactcttcagggtaggggtgatgcgcggttagctgtgggcggggggacaatt
aatgctaggaatattcaactagcccagggcaattatcaagctcaggtagaggtgaatcaa
gtatctctgccacaattagctgccgtaccacgacaatttgctggtaagttaaatgggcaa
tttactgttgcaggcacggtagacaacttcaaaccggagaatatccaagccacggggcaa
gggcgattaagtttaggtgggggggtaattaacgccaagaatattcaactaagtaatggt
aattatcgtgcccaggtgcaagggaataacttacccttacaacggtttaactccccaatt
cccggactcctggggggaaatttcctcgtcgctggttccgtaaattccctgaaaccagag
agtattaaagctacaggtaacgcccaggtgaatattgccgggggtactgtcacagccaag
aatattcaacttgcaaatggtcgttatcaagcagttgtcacggctgcgaatatcgccttg
aaccgcttttcaccccagttacggggtttatttgctgggaattttcaggtattcgggaat
accaagtctttttccctaggaaatatccaagggcaaggagagatggcgttttcccagggt
ttaccaggaattgcccgccccttaacggctgttgcggcttggaatggttccaagttgacg
gtagcaaacgcaacagcacccggtttgaatgctcggggtgaaatactggtgagtactagg
aaatcagtaccagaaattacccagttaaatttagatgtgcaagcccaggattataattta
caggaattacctgtgcagttaccccaggcgatcgccttgacaggaagtgcggattttgac
ggcaagattaccggaaaattaccgaagccgaatatcttggggcaggtggcattacgtaat
ttagttgtgaataagttatccgtggaatccttgctacggggtaatatagaatttgtggcg
ggtaagggtactatcctagatgtggcaggattacgggataaaattgctttcaacctagat
ggaaataatcgtcctcgctccttccaagtgaagtggaatcaagcactagcatcgggaatc
acacggggagagaatttagccgccaagttagaaaatatccccttgcaagtattaaatatt
acagtacctgctaaagcacgattcgcaggtggcaagttagaggggaatttaactggggat
gtactggtaaatttacaaaccttagcagcgaatggcaagttagcgatcgcccaaccccaa
attggtagaattaagggcgatcgtctggcagcaaatttccgttatgcgggagacagctta
gatctgacagacagtgaatttgccaagggtgctagtagttatcgcttggtaggtaacttc
cgacaaattaacagcaatccccaaattcaagcaaaactcaacgtcaaccaaggcgatatc
caggaattattaaataccctacaaatctctagctttgatgatttgcgtcaagataccccc
acatcggggaaagcagagaatttaaatacaattcccgtcggtttacccaatgcacccctt
gacagacaattagctcgcttctcagaaatagacgctctattggcaatccaggagcaacaa
cgattaaatgcttccctcatccccgaattagcagatttatctgggaaatttagcggtgaa
gtaacattcgataacacccaacccaacggtttagcagtcgggtttaatctcttgggagaa
cagtttatctgggggagaaaagttaaaaatgatgccaacacctgtgaaaatccccaacgc
tgttaccgtggcgatcgcatcattgcccaaggtaaattagagaacaatattctccgcctc
attcccctgcgtatcgaaaccaaaaaccgcctgattgccttcactggcaacattggaggg
caggaacaaacgggaaaactggaagttgtcaatttgcccatggcaatcattgatagttac
gtgaagttaccagtgaaagtgggtggcaatctcaacgccactgcataccttgcaggtagt
atcgaaaacccccaagcaaagggagaattagcagttacccaaggtgatattaatggtaaa
aaattggaatccgccgacaccagttttagctacaataatggtcgcctcaattttggcagc
caagtggttgtcacaggtagcagtgaacctgtaactattacaggttatgtaccctaccaa
gtccccacagccaccacctcttccccggataataaaatcaacatggatattcgggtgaaa
aatgagggattagctgtactcaatgcttttacaaatcaaattgcctacgaaagtggtaag
ggagaagtatttctgcaagtcagaggtacaatgaaagaaccagaattgaatggtatcgcc
tccctaaaggatgccatctttacggctcaaacccttaccggaaaacttacagaagttacg
ggtaatgctcgcttcactttgaatagattgattgtagaaaaactccaggggcaatatggg
caaggtagtattaatattgccggagaattaccaattagcaaccccctattacctatccaa
actcccctcaccgttgacatgcaaaagctgacactcaacctgaaaggattatatcagggt
ggggtgggaggtaatttaaaaattacaggtgctgccattagtccagaaattggcggtcaa
ttgcaactagataatggtaagattctcctagctgaatcaagcagcaatggttccggcaat
gccgctaatttgaataaggcaaataaggaattagaatcagaagagaatcaagcatttacc
agcttgaagaatttagaaattaaactcggtaaaaatgtcgaaattgttcgtccccccatt
ctttccttccgagcaacaggttccctaacagttaacggttccctcagtaatcccttacca
gaaggaacaattagtctgcgaagtggagatgttaacctgtttacatcccaatttaattta
gttcgtggctataaaaatacagccacctttactgaaactcaaccccgcaacccagagtta
gatattcgtctgattaccagggttctagatattaacccccgacaaatatcaactaattcg
atttcttcagaaattaacgaaggaattatcaccaatatcgaaccagtcaaaacagtcaaa
attgaagctatcatccgtggaagagctagtcaactccaggaaaatctcgaactcaaaagt
acaccaaatcgcagtcaaacagaaattattgctctgttgggaggtagttttgtagaaacc
tttggacggggcgatagtacattaggactagttaacctggcaggttctgctttaaatcta
caacgcacttttacccaaattggtagtgcttttggtttgagtgaatttcgtcttttcccc
acaattagctcagatgatggagaaactcgacggggttctgctttagatttagctgcggaa
gcggggattgatgtcaccagtaacttctcagtttctacttccaagattctcacatcgaat
aaacctgcccagtttgggattaattatcggataaatccagagattcgtctacgtacatct
actgacttttctggtgataatcgggctttagttgagtttgaaaagaggttttaa

DBGET integrated database retrieval system