Calothrix sp. 336/3: IJ00_12965
Help
Entry
IJ00_12965 CDS
T03937
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
calh
Calothrix sp. 336/3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
Hpt
PAS_9
PAS
PDE8A_N
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_4
PAS_8
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKG24619
UniProt:
A0A0T7BZU3
LinkDB
All DBs
Position
3072628..3074937
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MNSFLNNLLCLRSVEYLIFDTDFQIKTISPGMKEFVYHQGDIQVGKDVRHGFPELVGMED
IIMDICQKKLDKWELNAVARFREDNSTNYIQICLTRNIKNNNFFDEVILIVEDVTEKIQL
EKSLVQGVNEAHLLLSTIAASKEYIDQIISSMADALVVTNLTGKIQTANAASQKLLEYTE
AELIGQKFANIIPDFKIVYNQEVETYCLSKSGIKIPISLSCSFVKTDIKTFQGYIYIIRD
IRERKQAELAKQEFIAMMNHEIRTPIASVTGITNLLLNTTLTEEQRDFINTINNSNQHLL
RIINDILDFYKIESGKLELEIHPFSLKSCLDDCIKLLENSAKSKNLSLILTFADDIDITI
FSDIVRVKQILVNLLSNAIKFTDVGSIEISVQIRPGNDKGKEPQELIFAVKDTGIGIPSD
RLHRLFQSFSQVNPSTTREYGGTGLGLAICKQLCERMGGAIWVDSEEGVGTTFYFTIAAP
IIQKKIETQKVKPETKATDEVIDAQMAKTHPLRILLADDNLVNQRIICLTLQRMGYKADL
ASNGVEVLDALRSQSYDVILMDVRMPKMDGLEATQKIRQELASSDRPWIIALTANAMFND
RETCLAAGMNDYLAKPIRIPELVAALKNVPLTTKEENHPNPSYRPDCVDMNTLDELLQIA
KFNSSGNPESFVIEVIDTYLEDGTSLLANMHKARNKKDYQSLENMAHKLYSSSATLGAHQ
LASVCKQLEKNAKKEPAENISGLVYQLETEYQQVEQALSHFKKKYMQKH
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcatttctcaataatcttttatgtttgcggagtgtcgaatatttaatctttgac
actgattttcagattaagacaatttctcctgggatgaaggaatttgtctatcatcagggt
gatatacaagttggcaaagatgtgagacatggatttcccgaattagtgggaatggaagat
attatcatggacatctgccaaaagaaacttgataagtgggaattaaatgcagttgccaga
tttagagaagataattctactaactatattcaaatttgcttgactcgcaatattaaaaac
aataatttctttgacgaagttattctcattgtcgaagatgtaactgagaaaatacagtta
gaaaaatccttggtacagggtgtcaatgaagctcatcttttattaagcacaattgctgct
tctaaagaatatattgaccagattatatcttccatggcagatgcccttgttgtgacaaat
ttaactggcaaaattcagacagcaaatgcagcttctcaaaaactactggaatatacagaa
gcagaattaattggtcaaaaatttgctaatattatccctgattttaagattgtatataat
caagaagttgagacttattgcttaagcaaaagtgggataaagattcccatttccctatct
tgctcctttgttaaaacagatattaaaacatttcaaggatacatctatatcatacgtgat
attcgggaacgcaaacaagcagaattggcaaagcaagaatttattgccatgatgaaccat
gaaattcgtacacctattgcctcagttacaggtatcacaaatcttttgctcaataccaca
ctgacagaggaacaaagagattttataaatactattaataatagcaatcaacatttactg
cgaatcattaatgatattcttgatttttacaagatagaatcaggaaagctagagttagaa
attcatccttttagtttaaaaagttgcctggatgattgtataaaactgttagaaaattct
gcaaaatcgaaaaacttgagtctgattttaacatttgcagatgatattgatattacaatt
tttagtgatattgtcagagttaaacaaattttggttaacttattaagtaatgcaattaaa
tttactgatgttggcagtatagaaatttctgtgcagattcgtccaggtaatgataagggt
aaagagcctcaggagcttatttttgcagttaaagatactggtattggaattcccagcgat
cgcctgcatcgtcttttccaaagctttagtcaagtcaatcctagtactacccgtgaatat
ggtggtactggtttaggtttagctatttgtaaacagctgtgcgaacgtatgggaggtgca
atttgggtagatagtgaggagggtgtgggtactacattttactttacaattgctgcccct
atcatccaaaagaaaatagagactcaaaaagtcaagcctgagactaaagccactgatgaa
gtcatagatgctcagatggctaagacacatcctttacggattctcctagctgatgataat
ttagtcaatcaaagaattatttgcttgacattgcagcgtatgggatataaagcagattta
gcgagtaatggtgttgaggtgttagatgcattacgttctcaaagctacgatgtcattctc
atggatgtacggatgccaaaaatggatggtttggaagctactcaaaagattcgtcaagaa
ttagcatctagcgatcgcccttggattattgccttaactgctaatgcgatgttcaatgat
cgtgagacttgtttggctgcggggatgaatgattatcttgctaaacctatccggattcct
gaattggtagcagctctcaaaaatgttcctctaactaccaaagaagaaaaccatcccaat
ccatcctatcgcccagactgtgtggatatgaatactttagacgaattgttacagatagca
aaatttaatagtagcggaaatccagaaagctttgtgattgaagttattgatacctatctg
gaagatggtacaagtctgctagccaacatgcacaaagctagaaataaaaaagattatcaa
agtctggaaaatatggcacataaattatactctagtagtgcgaccttaggcgctcatcaa
ttagcaagtgtctgtaagcagctagagaaaaatgccaaaaaagaacccgcagaaaatata
tctggcttagtttatcagttggaaacagaatatcagcaagtagaacaagctttgtcccat
ttcaagaaaaagtatatgcaaaagcattag
DBGET
integrated database retrieval system