Calothrix sp. NIES-2098: NIES2098_01830
Help
Entry
NIES2098_01830 CDS
T08374
Name
(GenBank) major facilitator transporter
Organism
caln
Calothrix sp. NIES-2098
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY07072
LinkDB
All DBs
Position
231574..232872
Genome browser
AA seq
432 aa
AA seq
DB search
MSLASFLARRSLHYGWLVAGLTFLALLVAAGIRSAPGVLIVPLEQEFGWSRATISLAISL
NLVLYGLIGPFAAAVMERIGIRRTMVFALAFIALGVGLTTFMSASWQLVLLWGIIVGSGS
GVIALVLGAVVVNRWFVERRGLVLGILTASTATGQLVFLPILASVVERLGWRTATLALAG
IALVVTPAIALFMRDRPAEVGLRPFGDYSETVEVIPPKVNSITSTLSKIWQGFKSRDFWL
LCSSFFICGASTNGLIGTHLIPACIDHGIPEVKAAGLLAIMGIFDFIGTTISGWLSDRWN
NRYLLCWYYGLRGISLIFLPFSFHFSFYGLSIFAIFYGLDWIATVPPTVRLVANVFGKEN
VGVMFGWIVAGHQLGAATAAFGAGALRTWQGSYLQAFIFSGVLCLIAAVLVLRIGQSPTK
NNSQLSSATINP
NT seq
1299 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccctagcctcgtttttagcacgtcgttcgcttcactatggctggcttgtcgcaggt
ttaacattcttagcgttattagtagcagccggaattcgttctgcaccaggagttctgatt
gtacccttagagcaggagtttggctggagcagagctactatctccttggcaatttccctg
aatttagtactgtatggactgattggcccgtttgcggctgcggttatggaacgcatcggt
attcgccggacgatggtatttgcgctggcttttatcgctcttggtgttggtttaaccact
ttcatgtcagcttcctggcagttagtcttgctttggggaatcattgtcggtagtggtagc
ggagtcatcgccttagtattaggtgcggttgttgtcaatcgttggtttgtggaacggcgg
ggtttggttctgggaattctgacggccagcacagctaccggacaactagtgtttctgccg
atattggcgtcggtcgtggaaaggttgggatggcgaacagctaccttagctttagctggt
attgcacttgtagttactcccgcgatcgccttattcatgcgcgatcgccctgcggaagtt
ggcttgcggccttttggcgattacagcgaaactgtggaagtaataccgccaaaagtcaat
tccatcacttcaacactcagtaaaatttggcagggcttcaaatctcgtgacttttggttg
ttatgtagcagtttttttatctgtggtgccagcactaacggactcattggtactcatcta
attcccgcttgtatcgatcatggtatccctgaagttaaggctgcgggactgttggcgatt
atgggaatttttgattttatcggcacaactatttccggttggttgtccgatcgctggaac
aatcgctacttgctttgctggtactacggtctgcggggtatatccctaatttttctaccc
ttcagttttcacttctcattctacggactttcaatctttgcaatcttctacggactcgac
tggattgccacagtaccgcccacagttcgtcttgtagctaacgtcttcggcaaagagaat
gtcggcgtcatgttcggctggattgtcgccggacatcaactcggcgcagctacagccgcc
ttcggagccggagcgctgagaacctggcagggtagttaccttcaggcgtttattttttcg
ggtgttctgtgtctgatagccgcagtcttagtgctacgaattggtcaaagccctactaag
aataattctcagctttcttcagccaccattaatccctag
DBGET
integrated database retrieval system
