Calothrix sp. NIES-2098: NIES2098_46510
Help
Entry
NIES2098_46510 CDS
T08374
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
caln
Calothrix sp. NIES-2098
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NAGPA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY11468
LinkDB
All DBs
Position
complement(5563827..5565872)
Genome browser
AA seq
681 aa
AA seq
DB search
MLKMPNSDRPKYLTAFVNQGHSRVFWTNISPIIATALCLYTTSATNAQQLPTLTRSPNLT
SQMPTVPTSRVLTSGNQISLNGRTLSGAWLQRPGTADRATIYLSDGALRQLIGVDLLNTN
EPVRQPVEWFSPSKTPVVLGAWLQRGYRYLDITNFAQKAGWQIQANGNILVISTPAATVK
EIIQSQQPVGVSEAPPKEARIFVDLDRPTPWQVSQELPVKSPQDPDTPTPKPSKIPNRIW
KVSLDGIADPALIQRYTPLPTAPIPTTPLLNPLKQLLPIPVSPAPTPESEPLIKQVEVVN
NQTVISLSVPFGMAPRISTLANPNRLVIEIRPDALVEKNIAWARGLQWRQQFFNLGKERF
PIVWLEINPRAFGLTLKPMRSNLSSLAGTAPLMQIAPKYSAAAAINGGYFNRNNRLPLGA
IRQDGQWVSGPILNRGAIAWNDSGQFYFDRLTLEETLIASNNLRLPILFLNSAYVQSGIA
RYTPVWGATYTPLTDNEIILTVQKDQVTNQLPGGKAGQTNFPVPQDGYLLTLRGNAVNTA
AQLPIGTALSITSTTVPSNFSRYSNIIGAGPLLVKNRQIVLDAKSEKFSNAFIAEKAIRS
GICTNSTGNLMIAAVHNRASGPGPTLAEHAQLMQLLGCVDALNLDGGSSTSLYLGGQLID
RSPSTAARVHNGIGIFLEQKQ
NT seq
2046 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaaaatgccaaatagcgatcgaccaaaataccttactgcttttgtaaatcagggt
catagccgagttttttggactaatatttcaccaattattgccacagcactgtgtttatat
actaccagtgcaacgaatgcacagcagttacccacgctgaccagatcgccaaatttaacg
tctcagatgccaacagttcccacctctagggtattgacctctggtaatcaaatttcccta
aatgggcgtactttatcaggagcttggttgcagcgtccaggaactgcggatcgagcaaca
atttatcttagtgatggcgcactcaggcagttaataggagtagatttattaaatactaac
gagcctgtcagacaaccagttgagtggttttcaccaagtaaaacgccagtagttctaggc
gcttggctgcaaagaggataccgctatttagatattactaattttgcccaaaaagcaggc
tggcagattcaagctaatggcaatattttggtgatttctacgccagcagcgacagttaaa
gaaattattcaaagtcaacaacctgtgggcgttagcgaagctcctccaaaggaggctcgc
atctttgtagatttagatcgcccaactccttggcaagtatcacaagagttaccagtcaaa
agtcctcaagatcctgacacgccaacacctaaaccctctaaaatccctaatcgaatttgg
aaagttagcttagatggaatagctgaccccgctttgatacaacggtatacgcccctccca
actgcaccgataccaacaacaccactgctaaatccactcaaacaattattaccaatacca
gtatcaccagcgcccactccagaatcagaaccattaattaagcaagtcgaggtagtcaat
aaccaaacagtgattagtttgagcgtcccttttggtatggctcctcggattagtactctc
gctaaccctaatcgcttagttatagagattcgtcctgatgcactggtagagaaaaatatt
gcttgggctagaggattgcaatggcgacagcagtttttcaatttaggtaaagaacgcttt
ccgatcgtttggttagaaattaatccacgcgcctttgggttaacactgaaaccgatgcgc
agtaacctcagttctctagctggtactgctcccttaatgcaaatagcaccaaaatattca
gcagcagcagcaattaatggtggttattttaaccgcaataatcgcttgcctttgggtgca
attcgtcaggatggtcaatgggtgtcagggccgatactcaaccgtggagcgatcgcttgg
aatgattctggacaattttatttcgatcgtctcacattagaagaaactttaattgcttca
aataacctgaggttgccaattctctttctcaacagtgcttatgtacaaagtggtattgct
cgttacaccccagtttggggagcaacttacactcccctaacagataacgaaattatcctc
actgtccaaaaagaccaagttactaatcagttaccaggcggtaaagccggtcaaaccaac
tttcctgtacctcaggatggctatctattaaccttacgcggtaacgctgtgaatacagct
gcacaattgcccattggtactgcactcagcattaccagcactactgtacctagtaacttt
agccgttattccaacatcatcggtgctgggccactattggtaaaaaatcgtcaaattgtc
cttgatgctaaaagcgaaaaattcagcaatgcctttattgccgaaaaagcaatccgtagc
ggcatttgcaccaatagcacagggaatttgatgattgctgccgtacataatcgtgctagc
ggccccggccctactttggcggaacatgctcaactcatgcaacttctaggttgtgtagat
gctctaaatttagacggtggtagttctaccagtctttacctaggaggacaactcattgac
cgttcacccagtactgctgcacgtgtccataacggcattggtatttttctggaacagaag
caataa
DBGET
integrated database retrieval system