Calothrix sp. PCC 7507: Cal7507_1772
Help
Entry
Cal7507_1772 CDS
T02358
Name
(GenBank) outer membrane adhesin like proteiin
Organism
calo
Calothrix sp. PCC 7507
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
FG-GAP_3
Big_9
FG-GAP
BBS2_Mid
Cadherin_5
HemolysinCabind
NPCBM_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY32228
UniProt:
K9PGE0
LinkDB
All DBs
Position
1931531..1938442
Genome browser
AA seq
2303 aa
AA seq
DB search
MWKQTKMTTFNEQTGTANPFDINIILVPYNATPTFADIDSDGDLDLFIGSKDGLVRYYKN
TNNANYPILVEQVGTAFLDVGIDSKPSLADIDGDGDLDLIIGEKFGTLKYYKNIGTATNP
IVSEQTGSDNPFNTIDVGFYSSPTFADLDGDGDLDLVIGGDSGTLKYYKNIGNNLNPVYS
EQIGINNPLNGVNVGLFSTPTFGDIDGDGDLDLLVGKFNGTFSFYRNVGNLITPIFSEQT
GTANPLNGIDVGTTSAPSFADIDGDRDLDIIVGTAFGTVRYFQNNTPSVSFTLAPPSNNP
LNGVVLATDTTPILVDLDSDGDLDIVSGSSNGTLAYFKNTGNAINPSYALQDIANNPFRF
IDVGNNSTPALVDLDGDGDLDLVIGEAYGAVRYYRNTGNITNPLYQEQTGTNNPFNTINL
LYLSSPTFADIDADGDQDVLFGNRDGILRYYKNTGNALNPVYALATGINNPFLGLNTGNS
ESKPTFTDVDGDGDLDLVLGEKFGEIKYFENTGSATNPKYQQVTSNNHPFNAVDVGDSSS
PTLGDINGDGELDLIVGAADGTFKYYQKNTPSTQFNFIQATATDNPFGSIGTNSSWTSPA
IGDIDADGDLDVFLGLDRRYFKNLGNANNPVYDEQTSTSNPFSSISPSPTGNAFVDIDGD
KDLDFVTGAIDGLVRLFENTGNPRNPVYLEQTGTNNPFNGIDVGDTSAPAFADLDSDGDQ
DLVLGSYSLGRVLYYKNVGSAINPQYLEQTGSNNPFNQFSIPGADLVPTFTDLDQDGDQD
LVVGVTTFNNTNKLFYYENTGNAINPVYIERTGTSNPLNLIGGSFTGTKPDFADLDGDGD
EDLILGLRDFDTPKYYYYNRFPTAANEAVSTNQSTIVVGNVLSNDRDLDKDTLTVSQVKY
NNTTIPLEQLTTLGTGQIIVNPTGTFNFDPNGGYNYLAAGVILQENFTYTISDGNGGTAT
AIATIAITGVNDAASISGTTTGFAIEDAAPTNLTFTGTLTVNDVDTGENKFNTTVTSANG
NLGNISITPTGTWTYSVANSAVQSLAAGVIKNETFTVTSFDGTASQNITVSLIGLNDLAT
ISGTNTGSVTGNASLTNLTTSGVLTVSDIDTGDDKLSTTVTSANGNVGSLTISQPGTWTY
NVANTAVQFLRAGETKTDTFTVRSFDGTAIQTVLITINGVSDLATISGTATGAVTEDATS
PNLTTIGTLTVNDPDTGDNKFNTTVTGANGNLGSLAITEAGNWTYNVANSLVQSLGVGQT
KTETFTVNSFDGSATQNITITVNGVNDVASVSGTAIGAVTEDAASPNLTATGILTVSDVD
TGDNKFNTTVTSANGNLGSLTITEAGVWTYDVANSAVQSLGVGQTKTETFTVNSFDGSAS
QNITITVNGVNDAATISGTATGAVTEDASSPNLTTTGTLTVNDVDTGDNKFNTTVTSANG
NLGSLNITQAGAWTYSVANSAVQSLGAGQTKTETFTVNSFDGTASQNITVTVNGVNDAAN
ISGTTSGFVVEDTAPITLTTTGTLTVSDVDTGENRFNTNVISANGNFGSLSITQAGVWTY
SVANSAVQFLELGQAKTETFTVTSLDGTASQNITINIVGVNDNSTISGTVTGGVTEDTTS
PNLTTTGILTINNVNPGNNQFNTTVTSGSGNLGSLSITQAGVWTYSVANSAVQSLGAGQT
KTETFNVSSLDGTASQNITITINGVNDAASIGGTVTSFVVEDAAPVNLTTTGTLTVSDVD
TGESKFNTTVTSANGNLGSLNITEAGVWTYSVANSAVQSLGVGQTKAETFTVQSFDGTSQ
NITLNIVGLNDSSTISGTVTGAVTEDATSPNLTATGTLTVSDVDAGDNKFNTTVTSANGN
LGSLGITQAGVWTYSVANSAVQSLGVGQTKTETFTVNSFDGSASQNITITVNGVNDAATI
SGTATGAVTEDTASPNLTTTGTLTVNDVDTGDNKFNTTVTSANGNLGSLSITQAGAWTYT
VANSAVQSLGAGVTKTETFTVKSFDGSASQNINITVNGVNDAPVAAPDLLNATQGTILTI
PVATLLSNDSDVDQGDVLSITGVNSGAGGTATFSNNNTPTNPADDFITFNPLNPGTGNFQ
YTLSDGKGGSSLGFVNLLIGTRQVGNNSNNTFTGNAGPDFLDGSGGNDTLVGNDGDDTLI
GGTGNDSLSGGNGNDLLTGGAGVDTLTGGVGVDRFIFSALTDSQLGNVDRITDLVIGTDI
IDGPNAISAANLARLGAVSALTANGISAVLTNTTFVANGAATFTFGTQTFLALNNATAGF
QSANDALIEITGFTGSLTNLAII
NT seq
6912 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggaaacaaaccaaaatgacaacatttaacgaacaaaccggtacagccaaccctttt
gatattaatatcattctcgtaccgtataatgccactcccacgtttgctgacattgatagc
gatggcgacctagatttatttattgggtcaaaagacggtctagtcaggtactacaaaaat
acaaacaatgctaactatcccatcttagtggagcaagtcggtacagccttccttgatgta
gggattgacagtaaacctagcttggctgacattgatggtgatggcgacctggatttaatt
attggggaaaaatttggcacgctcaagtactacaaaaacattggtacagccactaacccc
atcgtcagcgagcaaactggcagcgacaacccttttaacactattgatgtaggattttac
agtagccccacctttgctgaccttgatggtgatggtgacctagatttagtcatcggggga
gatagcggtacactcaaatactacaaaaacatcggcaataatctaaatccagtttatagc
gaacaaatcggtataaataatcccctcaatggcgttaatgtaggacttttcagcaccccc
acttttggtgatattgatggcgatggcgatcttgatctgttggtaggaaaatttaatggc
acattcagtttctaccgcaacgtcggtaatttgattacccccatcttcagcgagcaaacc
ggcacagctaaccctttaaatggcattgatgtggggactacctccgcccctagctttgct
gatatagatggcgatcgcgacctggatatcattgtcgggacagctttcggcacagtacgg
tatttccagaataatacgccttcggtcagctttaccttagcacctcctagtaacaacccc
ttgaacggcgttgtcttagcaactgacactaccccgattttagttgatttagatagtgac
ggtgacttagatatagtctctggctcatctaacggtacactggcatactttaaaaataca
ggcaatgccattaaccccagttacgccctgcaagacattgcaaacaatcctttccgtttc
attgatgtgggaaataacagcaccccagctttagttgacttagatggtgatggcgacctg
gatttagtcattggggaagcttacggtgctgtaagatactacagaaatacaggcaatatc
actaaccccctataccaggagcaaaccggcaccaataacccctttaataccattaacctt
ttatatctcagtagccccacctttgctgatattgacgctgatggcgaccaggatgtgctg
tttggcaaccgtgacggtatattgaggtactacaagaacacaggtaatgctcttaaccca
gtttatgctttagcaactggtattaataacccatttctcggattgaacacgggtaatagt
gaaagcaaaccgacatttactgatgttgatggtgatggcgacctggatttagtccttggt
gaaaaatttggtgagatcaaatactttgagaacacaggtagtgctactaaccccaaatat
caacaggtgactagcaacaatcacccctttaatgctgttgatgtgggagatagcagtagc
cccaccttgggcgatattaatggtgacggtgaacttgatctaatagtaggagcagctgac
ggcacgtttaagtattaccagaaaaatacaccatcaacacaattcaactttatccaagct
acagctactgataacccctttgggtctattggtactaattctagctggacttctcctgcc
ataggtgatattgacgctgatggcgaccttgatgttttcctgggattggatagacgatac
ttcaagaacctgggtaatgctaataacccagtttatgatgaacaaaccagtactagtaac
cccttcagtagtatttcaccatcaccaaccgggaacgcctttgttgatattgacggtgat
aaggatttagattttgtgactggtgcaatagacgggctggtgaggttattcgagaatacg
ggtaatccccgtaatccagtttacctggaacaaaccggtacgaacaatcccttcaatggc
attgatgtaggggatacctctgctcccgcctttgctgacttggatagcgatggcgatcag
gatcttgttttgggcagctatagtcttggtcgagttttgtactacaaaaatgtaggtagt
gccattaacccccaatatctagagcaaaccggcagcaataaccccttcaatcagttttcc
atcccaggtgctgatctagtcccaaccttcaccgatctggatcaggatggcgaccaggat
ttagttgtcggcgtaacaacatttaataataccaacaaacttttctattacgaaaacaca
ggtaatgctatcaatcctgtctacatcgaacgcactggtactagtaacccactcaatctc
attggtggttcttttacaggcacaaaacccgactttgctgatttagatggtgatggtgat
gaggatctcatccttggcttaagggactttgacacacctaagtactattactacaatcgc
ttccccacagctgctaatgaagctgttagcaccaatcaaagcactattgttgtgggcaac
gtcctgagtaacgatcgcgatcttgataaagataccctcaccgtcagccaagtcaaatac
aataacaccaccattcccctagagcaacttaccaccttgggaacggggcaaataattgtc
aatcccactggtacgtttaactttgacccgaacgggggctataactatttagccgcagga
gttattctccaagagaattttacttacaccatcagcgatggcaatggtgggacagcaaca
gcgatcgcaactattgccatcactggggtaaatgatgccgccagcatcagtggaactacc
actggttttgccattgaagatgctgcaccgactaacttgacgtttacgggtacgctgact
gtcaatgatgttgataccggggaaaacaaatttaacaccaccgtcaccagtgccaacggc
aacctggggaatatcagcattaccccaactggaacctggacttatagtgtcgctaatagt
gcggtgcaatctttggcagctggagttattaaaaacgaaacctttactgtcacatctttt
gatggcactgctagtcaaaacattaccgtcagcttgattgggttaaatgatttagctacc
atcagtggcacaaacacgggtagcgtcactggcaatgctagtttaactaatttgaccact
tctggtgtgctcacagtcagtgatattgataccggggatgacaagttaagtaccactgtc
accagtgccaacggcaacgtcggcagcctcaccatctctcaacccggaacatggacatat
aatgttgcgaatactgcggtacagtttttacgggcgggagaaactaaaactgataccttt
actgtcagatcctttgatggtactgctattcaaaccgtcttgattactattaatggtgtc
agcgacttagccacaattagcggtactgctactggtgcagtcaccgaagatgctacttca
cctaatttgacaactattgggacactgacagtcaacgatcctgatactggagacaataag
tttaacaccactgtcaccggtgccaatggcaatctcggcagtcttgccatcactgaagca
ggaaactggacttacaatgtcgccaatagtttagtgcaatcccttggtgtgggtcaaact
aaaacggaaacttttactgttaactcctttgatggttctgcaactcagaacattaccatc
acagttaatggtgtcaacgatgtagctagtgtcagtggcacggcaattggtgcagtcaca
gaagatgccgcttcgcctaatctgacagcaactggcatccttactgtcagcgatgtggat
actggagacaacaaatttaacaccactgtcaccagtgctaacggcaacctcggcagtctc
accatcactgaagctggagtctggacttatgatgtcgccaatagtgccgtccagtccctt
ggtgtagggcaaactaaaacggaaaccttcaccgtcaactcctttgatggttctgctagt
cagaacattaccatcacagttaatggtgtcaacgatgctgccacaattagcggtactgct
actggtgccgtcactgaagatgctagctcacccaacctgacaacaaccggcacactaacc
gtcaacgatgttgatactggggacaacaagtttaacactacagtcaccagtgccaatggc
aacctcggcagtctcaacatcacccaagctggagcctggacttacagcgtcgccaacagt
gcggtgcagtcgttgggtgcggggcaaaccaaaacggaaaccttcaccgtcaactccttt
gatggcactgctagccagaacatcaccgttacggttaatggtgttaatgatgccgctaac
atcagtggcacaaccagcggttttgtcgttgaagatactgcacctattaccttaactacc
actggtacactcaccgtcagcgatgttgatactggggaaaacaggtttaacaccaatgtt
atcagtgctaacggcaactttggcagtctcagcatcacccaagctggagtctggacttat
agtgttgctaatagtgccgtccagttcctcgagcttgggcaagccaaaaccgaaaccttc
accgtcacttccttagacggtactgctagtcagaacattaccatcaatattgttggggtg
aatgataactccaccattagtggcacagtcactggtggagttaccgaagatactacctca
ccgaacctgacaacaactggcatactaactattaataatgtcaatcctgggaataatcag
ttcaacaccaccgttaccagtggtagcggcaacctcggtagtctcagcattactcaagcg
ggagtctggacttatagcgttgctaatagtgccgtccagtccttgggtgctggacaaacc
aaaactgaaaccttcaacgtcagttctttagacggcactgcgagtcagaatatcaccatt
acgattaacggtgtcaacgatgcagctagcatcggtggcacagtcaccagttttgtggtt
gaggatgctgcacctgttaacttaactaccactggcacactcactgttagcgatgttgat
actggggaaagcaagtttaacaccactgttactagtgccaatggcaacctaggcagtctt
aacattacggaagcgggagtctggacttatagcgtcgccaacagtgcggtgcagtctctt
ggtgtggggcaaaccaaagccgaaaccttcactgtccaatccttcgatggtacttctcag
aatatcaccctcaacattgtggggttgaacgattcgtctaccattagcggcacagtaaca
ggtgcagtcacagaagatgccacctcacccaacctgacagctactggtacattaaccgtc
agcgatgttgatgctggcgacaacaagtttaataccaccgtcaccagtgccaacggcaac
ttaggcagtctcggcatcactcaagcgggagtgtggacttatagtgtcgccaacagtgca
gtgcagtcccttggtgtggggcaaactaaaactgaaaccttcaccgtcaactcctttgat
ggttctgctagtcagaacattaccatcacagttaatggtgtcaacgatgctgccacaatt
agcggtactgctactggtgccgtcaccgaagatactgcctcacccaatttgacaaccact
gggacactaaccgtcaacgatgttgatactggggacaacaagtttaacactacagtcacc
agtgccaatggcaacctcggcagtcttagcatcacccaagctggagcctggacttatact
gttgccaacagtgcggtgcagtcgttgggtgcaggtgtgaccaaaaccgaaaccttcact
gtcaaatcctttgatggtagtgctagccagaacatcaatatcacggttaatggcgtgaat
gatgctccagtagctgcacccgacttgttaaatgcaactcaggggactatattgacgatt
cctgttgctactctgttgagcaacgacagcgatgtagaccaaggtgatgttttaagcatt
accggagttaacagtggagctggaggcactgccactttcagcaataacaacacgcctact
aaccctgctgatgacttcatcacctttaaccccctaaatcctggcacaggtaacttccag
tacaccctgagtgatggtaagggcggtagcagcttgggctttgtcaacctcttgattggg
actcggcaagtagggaacaatagcaacaacaccttcactggcaatgccgggccagatttc
cttgacggtagcggcggcaatgatacacttgtgggcaatgatggagatgatacgctgatt
ggtggcactggtaacgactcgctgagtggtggtaatggcaatgacctacttaccggaggt
gcaggagttgataccctcactggtggcgtgggtgttgacaggtttatcttctctgctttg
actgactcacagttgggtaacgtagatcgcatcactgatttagtgattggtactgatatc
attgatgggccgaacgccatcagcgccgccaacctcgccagactaggggcggtgagtgcc
ttaactgcaaacggaattagtgcggtactgactaatactacctttgttgccaatggcgca
gctacctttacttttggtactcagactttcctcgcactcaataatgctacagcaggcttc
caatctgctaacgatgcgctgattgagattactgggtttactggtagtttgacgaatttg
gcaatcatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
