Calothrix sp. PCC 7507: Cal7507_4162
Help
Entry
Cal7507_4162 CDS
T02358
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
calo
Calothrix sp. PCC 7507
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
calo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
calo02000
]
Cal7507_4162
Transporters [BR:
calo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cal7507_4162
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY34541
UniProt:
K9PNK8
LinkDB
All DBs
Position
4730182..4732305
Genome browser
AA seq
707 aa
AA seq
DB search
MLSNFVVRRGIQIVVSSLIVTQGMLWKNHSTKATEVPQQEGSAKDLQPVAEIISQNTPTS
TTETEPDIELTVIDKLLNEPVFSPFRREGTVKDSTRPIYVITGEEMEAQGARTVREALKF
LPGILPDGTVGTEPNALSGQFIRGSNTGQVLILLDGRPINNLGSGGFDLSEFTTSNIERV
EILPGGGSTLYGSDAIGGVINIVTRRPTNKITTSAKVNVGAYGLNQQSIQNSGKTGNIGW
VIGYNSTRSEYDYPFAIPEANFEGTRKNNDSLYNNFSIKLDADLGKRNTLAFSTQYLGKE
QGVPGGVPIPIPKNGQGFFNSLTDNNRKYTDQVLSDLTWNSKLGGGDNSLLTARVYGDFV
NTRFDNRSNALSSQNRFDSNQISYGIQTTHSWNFSKNQSLVYGFDYRSVNVKSSSFSYFT
NIGTINYNNSIGQGALFARYEINLTPSWTVNLGLRQDFSSLMNSSATSPSMGTKLALSDS
TTLRANYIRNFRVPTIANLFNINPSNIGNPALKPEIGNSFDVGIDQKIGDIGLLRLTFFY
NRVSDTIAFKSLIPPVNGNTGTWENIGLVETKGIEAALNLQLAKNVYAFVNYTANDPRIL
KSSNPAEIDKELRFAGADSINAGINYENSQGLYMGLLMHSVGKYPTNNINTEFSSGYTTF
DVKFRVPLSDNLAVNGSVDNILDQRYQLFAGFPDAGRVFQVGLSASF
NT seq
2124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttagtaattttgttgtcagacggggaattcaaattgttgtgtctagtttgattgtc
acccaggggatgctatggaaaaatcacagcacgaaagccacagaagttccacaacaggaa
ggttcagccaaagacttacaaccagttgcagaaataatatctcaaaatacaccaacctcc
acaacagaaacagaacccgatattgaactgacagtcattgacaagctattgaatgaacct
gtgttttcaccatttcgtcgtgaagggacagtcaaagattctacccgtccaatttacgtg
attacgggcgaagaaatggaagcacaaggtgctagaactgtgagagaagcgctaaaattt
cttccaggtattttacctgatggaactgtaggaacagaaccgaatgccttaagtggtcaa
tttattcggggttctaatacaggtcaagtattaatattactagatggtagaccaattaac
aatctcggtagtggtggttttgacctttcagaatttactactagtaatattgaacgagtt
gaaatattaccaggaggtggttctacactctatggttccgacgcaataggtggggtaatt
aacattgtcactcgtcgtcccacaaataaaatcacaacgtcagctaaagtcaatgttggc
gcttatggcttgaatcaacaaagcattcaaaatagtggaaaaaccggaaatattggttgg
gtaattggatataatagcactcgatctgaatatgattatccttttgcaattcctgaagcc
aattttgagggaactagaaaaaataacgactctctctacaataatttcagcattaaactt
gatgcagatttaggtaaacgcaatacgcttgctttttccacacaatacttaggaaaagaa
cagggtgtaccaggaggagtacccattccgataccaaaaaatggtcaaggtttttttaac
tcccttaccgataataatcgcaaatacacagaccaagttcttagtgatttaacctggaat
tccaaattgggaggtggagataattcacttttgacagcaagagtttatggtgattttgtt
aatacccgctttgataatcgcagtaatgcgctttcatctcaaaaccgctttgattctaat
caaatttcctatggaattcaaacaacacatagttggaattttagcaaaaaccaaagctta
gtttatggctttgattatcgcagtgtgaatgtaaagagtagctcatttagttattttact
aatattgggactataaattataataatagtattggacaaggagcattatttgccagatac
gaaataaacttaactcctagctggacggtcaatttaggattgagacaagattttagcagt
ttgatgaatagttcagcgacatctccatctatgggtacaaaacttgctctttctgactcg
acaaccctgagagcaaactatatcagaaatttccgagttcccactattgctaatctattt
aatatcaatccctcaaatattggcaacccagcactgaaaccagaaataggtaatagtttt
gatgtgggaattgatcaaaaaatcggtgatattggcttgctacgcctaacatttttttac
aatcgagtttctgatacaattgcttttaagtcactgattccgcctgtaaacggaaataca
ggaacttgggaaaatatcggcttagttgagactaaaggaatagaagcagccttgaatttg
caactggcaaaaaatgtctatgcttttgtcaattatacggcgaatgatccgcgaatttta
aaaagctctaaccctgcagaaattgacaaagaattacgttttgctggtgctgatagtatt
aacgcgggaattaactatgaaaactcacaagggttatatatgggattactcatgcattca
gttggtaaatatccaactaataacatcaacactgaattttcatcgggatacacgacattt
gatgttaagttccgagtaccattaagcgataatttagcggtcaatggtagtgtagataat
atcttggatcaaagatatcaattatttgctggttttcccgacgcaggtagagtttttcaa
gtcggtttgagtgctagtttttag
DBGET
integrated database retrieval system