Calothrix sp. NIES-3974: NIES3974_31170
Help
Entry
NIES3974_31170 CDS
T09641
Name
(GenBank) polyketide synthase phosphopantetheine-binding HglE
Organism
cals
Calothrix sp. NIES-3974
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
PP-binding
KAsynt_C_assoc
TPR_Epg5
Thiolase_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ06456
LinkDB
All DBs
Position
3798887..3804346
Genome browser
AA seq
1819 aa
AA seq
DB search
MSASWIENALAQLEAQINNCEQAVIRVIEDKKRIESKSMANDSLNRKLQYSPIAIVGMAS
LFPQSRTLEDYWENIIHQVDCITDVPESHWHVDDYFDPNPRTTKDKTYSKRGGFIPHVDF
NPMEFGLPPNILEVTDVSQLLSLVIAKEAMEDAGYGLSREFNRDKVGVILGVAMARNLGI
PLSARLQYPIWEKVLKSSGISDQDTQKIIEKMQAAYIKWDENAFPGMLANIVAGRIANRL
NLGGINCVVDAACASSFAALKMAISELVEHRCDMMLTGGVDTDNSITAYISFSKTPALTP
SDKVRPFDAKSDGMMLGEGIGILVLKRLEDAERDGDKIYAVIKGIGTSSDGRYKSIYAPR
PEGQMTALRRAYEDAGFEPATVGLIEAHGTGTMAGDPTEFASLREYFGEENPRRQYIALG
SVKSQIGHTKAAAGAASLIKTSLALYHKVLPPTINVTEPNPKFNIENTPFYINTQTRPWI
RPQGEVPRRAGVSAFGFGGTNYHVVLEEYTGKPSPELRVHHTPYQILIDGVNPEELRSQL
ENLLVDLGASTGQVKFIELVKLSKEKEIPVHHARVGFVAQSREEAVKYLEIAIAQLKKQP
DAAVWEHPQGVYYRQQGMELQGKVVALFSGQGSQYLEMGREVVMNFPVMQEFYGYMDSLL
LKDNMRPLSDVVFPPPVFNENDRAMQVSALQRTEYAQPAIGMMSAGLYKILHQAGLKPDF
VAGHSFGEITALWAAGVFSDADYCGLVKARGQAMAPPQDPDYDAGAMLAVRENLSTIEAY
LKPFSQVSVANLNSPRQVVLAGPTEEITKVRQVLVEQGFAAMLLPVSAAFHTSLIAFAQK
SFAIALKSTEFKPQQITTYSNVTAHPYPQEPQKIKQILETHLANPVLFKQQIENIYNAGG
YCFVEFGPRRILTNLVQDILGERPHIAIALNPSDRKNSDRSLREAVVQLRVHGVQLQDID
PLQKLPTPPVPENPKALNVRLNGVNYVSPKTAKTIAEALQPDPNLKVVIPQSTVNKASTN
GKTKIVDIKSEIVPGIPATSSSSTTSVQLPSGHSQKTPPDITTGVETSATNSPTQPSKPN
PTSPVVKSTMEQVPNQRINYQQVLESLEFVLSQFQQNNSENLQVHGLYLNHQQKYVETFF
QLLQQQHKLLIDQTSATNNIKSMVTESLERSMTQFSSQQAETLRVHEQYLQNQLAYTQNF
FQFLQQEYQGLLSGQVRVTQAPVNPVVQKPIQEAAINPVVAPIPQKPIQEAAINPVVAPI
PQKPVQEAATNPVPQPTPTTSIATPSIAAGDVAETLLAITSEKTGYPVEMLELDMDMEAD
LGIDSIKRVEILGAMQEAYPNLPQPNVEDLGELRTIGQVVNYIQSLMGQGGETSPVQTLT
QVNTQSVNTQPTVAHVTTNIQNPIPVREPITVSATPSVDLANATTSVIPETPTPAIAIAT
TPVTTPIEPEVPASFGVNAEEMAQTLLNITSEKTGYPVEMLELDMDMEADLGIDSIKRVE
ILGAMQETYPDLPQPNVEDLGDLRTIGQIVNYLQTLTGGEKKNHHPQSELTELSQPQVNQ
PGEQATQPTTPTEPSTASLNNSPLRRQVFLKTLPQPDYLEFSLPEGHIGLITDDGTLTTT
KLASELTHLGWRVVVLSFPETIVSQRSPLPSGIERVELDNMDEPHLQEKLNAICQHFGNI
AAFIHVNPRFELNQNGRIPYIPSEKAVVKHVFFIAKHLKTSLNQAAKLGRACFCTVARLD
GAFGLDHNLNYSPISAGLFGLTKTLNWEWEKVFCRAIDLNPTINADQSSKNIIAELHDPN
RYITEVGYGLNGRTTLVSQ
NT seq
5460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgcttcctggatagaaaatgctttagcgcagttagaagcacaaataaataattgc
gaacaagcagtaattcgtgttatcgaagacaaaaaaaggatagagagtaaatctatggca
aatgatagcttaaatcgtaaattacagtatagtccgattgcgattgtgggaatggcttca
ttatttccccaatcacggacattagaggattattgggaaaatattattcatcaggtagat
tgtattactgatgtaccagaaagtcattggcatgtggatgattattttgaccccaatccc
cgcacaactaaagataaaacctattctaaaaggggtggatttattccccatgttgacttt
aatccgatggaatttggtttaccaccgaatattttagaggtgactgatgtttcccaattg
ttgagtttggtaatagccaaagaagcaatggaagatgcgggatatggtctatctcgtgaa
tttaatcgggataaggtgggggtaattctgggtgtggctatggctagaaatttgggaatt
cccctgtctgcgaggttacaatatccgatttgggaaaaggtactcaaaagtagcggaatt
agtgaccaggatacgcagaaaattattgaaaaaatgcaagctgcttatattaagtgggat
gaaaatgctttccccggaatgcttgcaaatattgttgctggacggattgccaatcgttta
aatttgggtggaattaattgcgttgttgatgcagcttgtgcgagttcctttgcagcttta
aaaatggcaattagtgaactagtggaacaccgttgcgatatgatgctaactggtggggtg
gatacggataattcgattaccgcatatatttcctttagtaaaacccccgctctgacaccc
agtgataaagtgcgtccctttgatgcgaaatccgatgggatgatgttgggtgaagggatt
ggtattttggttctcaaacgcttggaggacgcagaacgggatggagataaaatctatgcg
gtaatcaaagggattggtacatccagtgatggaaggtataagagtatttatgcaccccgt
ccggaaggtcaaatgacggctttgcgacgtgcttacgaagatgcgggttttgaaccagct
acggttggtttaattgaagcccacggaactggaacgatggctggagacccgacggaattt
gcatccttgcgtgaatactttggcgaggaaaatccccgtcgtcagtatattgccctgggg
agtgtgaaatcgcagattggccatacaaaagcggcggcgggagcagctagtttaattaaa
acatctttggcgctgtatcacaaggttttaccgccaactattaacgttaccgaacccaat
cccaaatttaatattgaaaatacacccttttatattaatacccaaacacgtccgtggatt
cgtccccagggtgaagttcccagaagggctggtgtgagtgccttcgggtttggtggtact
aattatcacgtagtactagaggaatatactggtaaaccgagtccggaactgcgggttcac
cacacaccctatcaaatattgattgatggggtaaatccggaagaattgcgatcgcagttg
gaaaatctgttggtggatttaggtgcatccacgggtcaggtaaaatttattgagttggtt
aagttgagtaaagagaaggaaatccctgtccaccatgctagggtgggatttgtggctcag
tcgcgggaagaagcggttaaatatctggaaattgcgatcgctcaactgaaaaaacagcca
gatgcggcagtttgggaacatccccagggagtatattaccgtcaacaggggatggaattg
cagggtaaggtggtggctttgttctctggacagggttcccaatatttggaaatgggtcgg
gaagtggtgatgaatttcccggtgatgcaggaattctatggttacatggatagtttgctg
ctcaaggataatatgcgacctttgtcggatgtggttttcccaccacccgtgtttaatgag
aatgaccgagctatgcaggtgagtgccctacaacggactgagtatgcccaaccagccatt
gggatgatgagtgcaggattgtataaaattttgcatcaagctggattgaaaccggatttt
gtggctggtcatagtttcggtgaaattacggcactgtgggcggctggtgtatttagtgat
gctgattactgtgggttggtgaaagcgcggggacaagcgatggctcctccccaagacccg
gattatgatgcgggagcgatgttagcagtgagggagaatttaagtacgattgaagcttat
ttgaaacctttttcccaggtaagtgtggcgaatctgaattcaccccgtcaggtggtatta
gcaggaccgacggaggaaattaccaaagtgcgtcaggtgttggtagaacagggatttgcg
gcgatgttattaccagtttcagctgctttccacacctctttgattgcctttgcccaaaaa
tcctttgcgatcgccctcaaatcgacagagtttaaacctcaacagattactacctatagt
aatgttacagcccatccctatccccaggaaccgcagaaaattaaacaaattctggaaacc
catttagccaatcccgtactgtttaaacagcaaattgagaatatttacaatgcgggggga
tattgcttcgttgaatttggtccacgacggatattaaccaacctggttcaagatatttta
ggtgaaagaccccacattgcgatcgccctaaatcccagtgatagaaaaaatagcgatcgc
agtttacgggaagcggttgtacagttacgggtacatggggttcagttacaggatattgac
cctctgcaaaaacttcccacacctcctgtaccggaaaatcccaaagctttgaatgtgcgt
ctcaatggtgttaactacgtttcccccaaaacagcgaaaaccatcgcagaagcactgcaa
ccagacccaaacctgaaagtggtcattccccaatcgacggtgaataaagcttccactaac
ggtaaaaccaaaatcgttgatattaaatcggaaatagtcccagggattccagctactagt
agttctagtactacttctgtccaattacctagtggtcatagccaaaaaactccaccagat
atcaccactggtgtcgaaactagtgcaactaactcccccacccaaccatcgaaaccaaac
cccacatcacctgttgtcaaatcaacgatggaacaagtaccaaatcagcgaattaattac
caacaagttctcgaaagcttggaattcgttctcagtcagtttcagcaaaataacagcgag
aatttgcaggttcacggactctatctcaaccatcagcaaaaatacgttgagacgtttttc
caactcctacagcaacagcacaagctgctaattgaccaaacctctgctaccaacaatatc
aaatcaatggtgacagaaagtttggaacgtagcatgacccaatttagctctcagcaagct
gaaaccctgcgggtacatgaacaatatctccaaaaccaattagcctatactcaaaacttc
ttccaattccttcaacaggaatatcaaggtttgctttctggtcaggttcgggtgacacaa
gcacctgttaatccagtggttcaaaaaccaatacaggaagcagcaatcaatccagtagtt
gcacctatccctcaaaaaccaatacaggaagcagcaatcaatccagtagttgcacctatc
cctcaaaaaccagtacaggaagcagcaaccaatccagttccccaaccaacaccaacaaca
agtatagctactcccagcattgcagcaggtgatgttgcagaaactttactcgcaatcacc
agtgaaaaaaccggttatccggtggagatgttggagctagacatggatatggaagcagac
ctggggattgactccattaaacgggtagaaatcctcggtgcaatgcaggaagcctatcct
aatttaccccaacctaacgttgaagatttaggcgaactacggacaattggtcaggttgtc
aattatatccaatccttgatgggtcaaggtggggaaacttccccggttcaaacacttaca
caagttaatacccagagtgtaaatacgcagccaacagtcgcacatgtaacaacaaatatc
cagaatccaattccagtgagggaaccaattaccgtgagtgcgacaccttcggtggactta
gccaacgcaactacatcggtaattccagaaacaccaactccagcgatcgcaatagccact
acaccagtgactacacccattgaaccagaagttccagccagtttcggtgtgaatgcggag
gaaatggcccaaactctactaaatatcaccagtgaaaaaaccggttatccggtggagatg
ttggagctagacatggatatggaagcagacctggggattgactccatcaaacgggtagaa
atcctcggtgcaatgcaggaaacctatcccgaccttccccaacccaatgtggaagacctg
ggggatttacgcaccatcggtcaaattgttaactacctgcaaacgctgacaggtggagaa
aaaaaaaatcaccaccctcagtctgaattaactgaattaagtcaacctcaagtcaatcaa
ccaggggaacaagcaacccaaccaactacccccaccgaaccatcaacagcaagtctcaac
aatagtcccctacgtcgtcaggtgtttctcaaaacccttccccaacctgattatttggag
tttagtttaccagagggacacatcggtttaattaccgatgatggaaccctcaccaccacc
aaacttgcaagcgaactaactcacctaggttggagagtcgtcgttttgagtttcccagaa
accatcgtttcccaacgctcacccctaccctccgggattgaacgggttgaactggacaac
atggatgaaccccacctccaggaaaaactgaatgcaatctgccaacattttgggaatatt
gctgcatttatccatgtcaatccccgctttgaactcaaccaaaatggacgtattccctac
atccccagcgaaaaagccgttgtgaaacatgtatttttcatcgctaaacacctgaaaacc
tcccttaaccaagcagcaaaactcggtagagcatgtttttgcacagtagctcgtttagat
ggtgcttttggactcgaccacaacctcaactacagtcccatcagcgctggactatttgga
ctcaccaaaaccctgaattgggaatgggaaaaagtcttctgtcgagcaattgacctcaac
cccaccatcaacgctgatcaatccagcaaaaacatcatcgctgaactccacgaccctaac
cgctacattaccgaagttggttacggattgaatggacgcacaacattggttagtcaatag
DBGET
integrated database retrieval system
