Calothrix sp. PCC 6303: Cal6303_3235
Help
Entry
Cal6303_3235 CDS
T02372
Name
(GenBank) GAF sensor signal transduction histidine kinase
Organism
calt
Calothrix sp. PCC 6303
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
GAF
GAF_2
HisKA
GAF_3
HATPase_c_5
DUF3369
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ02176
LinkDB
All DBs
Position
complement(3822972..3824219)
Genome browser
AA seq
415 aa
AA seq
DB search
MIINDFYWQQKMRTLEVLSSLSHRTGELSGYLQEITFGVNELIGIDWSIVTICQQGFAKV
LASSINLDQEIESYSVHGELSGTVIETGCSLIVENTKICQQYGQAPEGYQAYLGVPLRTS
QNKVIGTICSFHKEPRNFCQQEVEIVELFAERAATAIDNYYLYQQQRQFNEILEAEVIRR
TEELKVVQTKLIEQERLAAIGEFATGIVHEIRNPLTTMKMGLNYFNKQDLTETAKIRLSL
ALDEGARLERLLQEILLYAKPQNLQLSPINLHEFIADNMKSLENMPEAEGRLIKLISTQN
AMGILADGDKIKQILINVVRNACEAVNIGDIVSLSLKNILDTNQVEISVHNFGEPISRDI
LSSLTQPFFSTKPSGTGLGLAIVKRIVEAHHGELTIKSNMNEGTIVTIKLPKLGG
NT seq
1248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattaatgacttctattggcagcaaaaaatgcggacattagaagttttgtcgtca
ctgagtcatagaactggtgaattaagcggatatttacaagaaataacctttggtgttaat
gaattaattgggattgactggtctattgtcactatttgtcagcaaggatttgccaaagta
ttagccagtagtatcaatttagatcaagaaatagaaagttattctgtacatggtgaatta
tcaggaactgtaatcgaaactggttgcagtttaatagttgaaaacaccaaaatctgtcaa
caatatggtcaagctccagaaggatatcaagcatatttaggagtacctttgcgtacttct
caaaataaagtaatcggaacgatttgttcatttcataaagaaccacgtaatttttgtcag
caggaagttgaaattgttgaattatttgcagaacgtgctgcaactgcaatcgataactat
tatctttatcaacagcaacgccaatttaatgaaatattagaagctgaagttatacgaaga
acagaagaattaaaagtagttcaaacaaaactgattgagcaagaacgtcttgcggcaatt
ggtgagtttgccactggtattgttcatgaaattcgtaatcccctaacaacgatgaaaatg
ggattgaactattttaataaacaagatttgacagaaacggcaaaaatacgactatctcta
gcattagatgagggtgctaggttagaaagattactacaggaaatattactttatgcaaaa
ccacaaaacttacaattatcaccgattaatcttcatgaatttattgctgataatatgaaa
tctctggaaaatatgccggaagcagaaggaagattgattaagcttatatctactcaaaat
gctatgggtatattggcagatggggataaaattaaacaaatactaattaatgttgttcgt
aatgcttgtgaggcggtaaatattggagatatagttagtttatctttaaaaaatatctta
gatactaatcaagttgaaattagtgtgcataactttggtgaaccaatttctagagatatt
ttatcttcccttactcaaccgtttttctcaacaaaaccttccggtactggattgggatta
gctatagtgaaacgtattgttgaggcgcatcacggagaattgacaatcaagtctaatatg
aatgaaggaacaattgtgactataaaattaccaaaattgggaggttga
DBGET
integrated database retrieval system