Cicer arietinum (chickpea): 101511754
Help
Entry
101511754 CDS
T02819
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cam
Cicer arietinum (chickpea)
Pathway
cam03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cam00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
101511754
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cam03019
]
101511754
Messenger RNA biogenesis [BR:
cam03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
101511754
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101511754
NCBI-ProteinID:
XP_073223948
LinkDB
All DBs
Position
4:2570652..2575561
Genome browser
AA seq
473 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTNEEKLKEHFGNYGDVLNTSVMREKNTGKPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKRAFSREDQQISVTSRTGNSNSGMNSGNGGNVRTKKIFVGGLP
PTLAEEKFRQYFEAYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASSRMMGGSGGGSGGIGGYQGYGASGGNQNAYDGRTDSSRYMQPQ
SAAGGFPPYGSSAYSAAGYGYGSASNGLGYGAAYGSYGGAAAGYGGPAAATYGNPNVPNA
AYAGGPPGGPRTSWPAQAPSGYGSMGYGNTAAWGAPSGGAGSGSXXXXXXXXXXSGAAAY
GNQGYGYGGYGGGYGGSDSSYGNPGVYGAVGGRTGSAPNSNASGSELQGSGGSGSYMGSG
YGDANGNSGYGNAAWRSEQAQASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQGQQQ
NT seq
1422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggaaagcttttcatcggtgggatttcatgggatactaatgaggag
aaactgaaggaacattttggaaactatggtgatgtgttgaacacttcagtcatgagagag
aagaacactggtaaacctagaggctttggttttgttgtcttctcagatccttctgttctt
gatagggttcttgaagacaagcatgttattgatggcagaacggttgatgccaagagagct
ttctcaagagaggaccaacagatttctgtcacttcgagaactggaaactcgaattctggc
atgaattcgggtaatggggggaatgtcaggactaaaaagatatttgttggagggttgcct
cccactctggcagaagaaaaattccgccagtactttgaggcttatggacatgtaactgat
gttgtagtcatgtatgaccagaatactggacgaccacgaggatttggatttattacattt
gataccgaggaggcagttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatggtaaa
caggtagaggtgaagcgtgcacttccaaaggatgccaatcctggtgcaagtagccgaatg
atgggaggttctggaggtggcagtggtggaatcggtggttatcaagggtatggagcttct
ggtggcaatcaaaatgcatatgatggtcgtacagattctagtaggtatatgcagcctcaa
agtgctgcaggtggattcccaccttatggttcatctgcttacagtgctgctggatatggg
tatggttcagctagcaatggtcttggttatggtgcagcgtatggaagttacggcggtgct
gctgccgggtatggtggacctgctgctgcaacatatgggaaccccaatgtccctaatgct
gcttatgcaggtggtccaccaggtgggccaaggacttcatggcctgctcaggctccctct
ggatatggctctatgggttatgggaatactgctgcttggggtgctccaagtggtggtgct
ggatctggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtggagctgctgcatat
gggaatcaaggttatggatatggtggctatggcggtgggtatggtggaagtgacagttct
tatgggaatccaggtgtatatggtgctgttggtgggcgtactgggagtgctccaaatagc
aatgctagtgggagtgagctacaaggtagtggtggcagtggcagctatatgggcagtggc
tatggggatgcaaatggaaattctggttatggaaatgcagcttggagatctgaacaggct
caagcatctggtaattatgggactcctcagggaaatggtgggcaagttggttatggtggt
ggctatggtggtgctcagtctcgacaaggccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
