Cyclobacterium amurskyense: CA2015_1922
Help
Entry
CA2015_1922 CDS
T03993
Name
(GenBank) ASPIC/UnbV domain protein
Organism
camu
Cyclobacterium amurskyense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
UnbV_ASPIC
Itfg2
FliC_D2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP51349
UniProt:
A0A0H4PAW5
LinkDB
All DBs
Position
2306323..2309619
Genome browser
AA seq
1098 aa
AA seq
DB search
MKFISNCLIYCFLISFLFSCKQENPNALFTEVSSSSGIVFNNLVKESDAFNVLNYGYFYQ
GGGVAVGDIDNDGLPDIYFTGNMMASKLYLNKGDFKFEDITASAGVEAAGLWNTGTTMAD
VNGDGLLDIYICRSAAKDHNNRKNLLYINQGDLTFKEAAKEYGLDDPGYSTQASFFDYDN
DGDLDMFLLNHSTQEYAGFSRIDGSYKNRIGDFLGDRLYRNDGGQFIDVTEESGIIGNVL
GFGLAVTVSDYNNDGWLDIYVSNDYNEEDYLYYNQQDGTFNEELKVHMGHVSLFSMGADA
ADMNNDLMSDLLTMDMMPEFNFNQKAILGPENYSKYSELLNKGFYPQSMRNMFHLNQGEG
NFVEIAQFSGVAHTDWSWAVLAADFDNDGWKDIFISNGYARNYLDMDFMNYLVSERLKTN
QTGKEAALMELIDKMPPIYVRNYLYRNQGNLKFENKAYEWGLEDATVSNAAAYADLDGDG
DLDLIVCHTNDPVSVYRNNIEKLSNHSFLKVRLKGEGLNSKGIGTKVLVYSDGDQFHQEL
IPTRGYQSSVDQELLFGLGENTTIDSLEVFWPTGEHQIISQVPINQILVLNQAEGKIKRT
KAVKISTLLEEVPGALGINFVHHETSFLDFTQDRLMPNSMGGIGPKLAVADVNGDQLDDL
FIGGGKNQSGVLYVQNAKGEFSVSKQAAFEADSSFTDTDAVWLDANGDGNLDLYVVSGGI
DHPRDSELYQDRLYINDGKGEFQRSHSLPKMPFSGAAVASTDFNGDGFPDLFVGGRYLPG
NYPEAPRSYLLENDGKGNFKDVTQDYNPLLMNPGMVSDACFVDTDGDGKEELVIAGEWMG
IQIYGLQENQFVAIQKELTESTKGWWLNLFATDLDDDGDIDLLAGNYGENLVYQTNAEQP
LKVVFKDFDNNGRTDPIFTYYKADTNSFAFSRDEIIGQLPKLKNKFVDYRSFAQTSVEGI
FESLDLSGADTLTADNLSSIALINDGKGNFSQSKLPVELQLSPLFAMNKAVPSQGKESLL
LTGGNISKTRVSTGKLDANPGFVFTINKENKALKAIPVQKSGLFFQDEVRDIKTIRVGEE
FYYIYAFNNEAIKVFKIR
NT seq
3297 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttatttctaattgcctgatatactgttttttgatttcttttcttttttcctgt
aagcaagagaatccaaatgccctgtttactgaagtgtcttcctcctcaggaatagttttt
aataatctggttaaagagtccgatgcttttaatgtactgaattacggttatttttatcag
ggtggaggagtggctgttggtgatattgacaatgatggtttgccagatatttattttact
ggaaatatgatggcaagtaaactttatttaaataaaggagattttaaatttgaagacatt
actgcctccgcaggtgtagaggcagctggattatggaatactggtactaccatggctgat
gtcaatggcgatggacttttggatatttatatatgtagatcagcagccaaggatcataac
aataggaaaaacctgttgtatatcaaccaaggagacctgacatttaaggaagccgcgaaa
gaatatggattggatgatcccggttattccacacaggcctcatttttcgattatgacaat
gacggggatctggatatgtttcttctcaatcactctactcaggaatatgcaggatttagc
aggattgatggttcgtacaaaaatagaataggagactttttaggcgatcgtttgtataga
aatgacggtggtcaatttattgatgttactgaagaaagtggaattattggtaatgttttg
ggttttggcctggctgtgactgtgagcgattataataatgatgggtggttggatatctat
gtcagcaatgattacaatgaagaagattacctctattacaaccaacaggatggtactttt
aatgaagaattgaaagtacatatgggccatgtatccctgttttctatgggagcagatgca
gctgacatgaacaatgacctgatgtcagatttgcttactatggatatgatgccagagttt
aattttaatcaaaaggcaattttaggacctgaaaactacagtaaatacagtgaattactg
aataagggtttttacccacaaagcatgcgcaatatgtttcacttgaatcaaggtgaaggc
aactttgtggaaattgcccaatttagtggagtggctcatactgattggagctgggcggtt
ttagcagcagattttgacaatgatggttggaaagatatttttatcagcaatggttatgcc
cggaattacctggacatggactttatgaattatctggtaagtgagcgtcttaaaaccaat
caaacagggaaagaagcagctttaatggagcttattgataagatgccacctatctatgtt
agaaattacctttatcgtaatcagggtaatttgaaatttgaaaacaaagcttatgagtgg
ggacttgaagatgcaacagtatctaacgctgctgcctatgctgacttggatggagatggt
gatttagatttgatagtttgccataccaatgatccggtatctgtctatagaaacaatatt
gagaagttatccaatcattcctttttaaaagtgaggctcaaaggagaaggtttaaatagt
aaaggtataggtactaaggtattggtttactcagatggagatcaatttcatcaggaatta
attcctacacgtggttaccagtcttcggtagatcaggaattgttatttggtcttggtgaa
aacactactatagatagtcttgaggttttttggcctactggtgagcaccaaatcatttct
caagtaccgattaatcaaatcttagtactgaatcaagccgaagggaaaataaaaaggacc
aaggcagttaaaatcagcactttactggaagaagttcctggtgccttaggaattaatttt
gttcatcatgagaccagttttttggattttactcaagacagactaatgcccaattcaatg
ggggggataggacccaaattggccgttgcagatgtgaatggagatcaattggatgattta
ttcataggtggaggaaaaaaccaatcaggagtattgtatgttcagaatgccaagggggaa
ttctcagtaagcaaacaggctgcatttgaagctgacagtagttttacggataccgatgct
gtctggctggatgccaatggcgatgggaatctagacctttatgttgttagtggtggcata
gaccacccgagagacagtgaactttatcaagacaggctttatattaatgatgggaagggt
gagttccaaagaagccattcacttcctaagatgccttttagtggggccgcagtagcaagt
actgattttaatggggatggttttcctgatcttttcgtaggtggacgctatttgcccgga
aattacccggaggctccaagaagttacctgttggaaaatgatgggaagggaaacttcaag
gatgtaactcaggattacaaccctttattgatgaatccgggaatggtaagtgatgcctgc
ttcgtagacactgatggggatggtaaagaggaattagtcatagctggagagtggatggga
attcaaatatatggtttgcaagaaaatcaatttgtagctattcaaaaagaattgacagag
tctaccaaaggttggtggctaaacttatttgccacagacctcgatgatgatggagacata
gaccttcttgcagggaattatggtgaaaaccttgtttaccaaaccaatgctgagcaacct
ttgaaagtggtcttcaaagactttgacaataacgggagaacagaccctatttttacctat
tacaaagccgataccaattcatttgcttttagtagggatgaaattattgggcaattgcct
aaacttaaaaacaagtttgttgattatagatcttttgctcagacaagtgttgaaggtatt
ttcgagagcctggatctcagtggtgcggatacgcttactgcggataatttatcttctatt
gcattaataaatgacgggaaaggtaatttttctcaaagtaaacttcctgtagaacttcag
ctttcaccactctttgcaatgaataaagctgtaccttctcaaggtaaggagtccctttta
ctaacaggtggaaatattagcaaaacgcgggtgagtactggaaaattggatgccaaccca
ggatttgtatttactattaacaaggaaaataaagctttgaaagctattccagtacaaaaa
tccggtttgtttttccaagatgaggtaagggatataaaaaccattagggtaggagaagaa
ttttattatatttatgctttcaataatgaggcaataaaagtctttaaaatcaggtag
DBGET
integrated database retrieval system
