Cyclobacterium amurskyense: CA2015_3575
Help
Entry
CA2015_3575 CDS
T03993
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
camu
Cyclobacterium amurskyense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
camu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
camu02000
]
CA2015_3575
Transporters [BR:
camu02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CA2015_3575
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
DUF7382
Big_1
DUF2969
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP52954
UniProt:
A0A0H4PFH5
LinkDB
All DBs
Position
4348250..4351426
Genome browser
AA seq
1058 aa
AA seq
DB search
MKKPIRYLFQKVPKTLLIGGFLQCFVSANLLAEGNPDLLGIALTNAEFTHSIAENINLKN
VSGTVSDSDGEPVPGATVVIEGSTTGTVTDIDGKFSLEVPDNAVLLISFIGYQTQRINPG
NQSNLAITLVEDATSLDEVVVVGYGVQQKVNLTGAISTVDFDDELSNRPLTNASQALGGT
ASGVWVSQNSGKPGSDGAQIRVRGWGTLNNSNPLIIIDGVEGTFSQLNPNDIENISVLKD
AASAAIYGSKAANGVVLVTTRMGKKNEAMQVNVNSYFGIQSLGRRYDVINNSAEHMELTN
TALLNEGSTPLFSESLISAFRNGTDPYKYPNTDWFKVIFNTANIQEHNVSIRGGSEQSSS
FISFNYLNQEGMVPNTSSERYGLRANISSNVKDWLTVSGRFNYIHKDSDEPYADVTYGSL
GRVFEMLGGSAPYIAPYTRDGRFGSVQAISEDGNLLFDNRNALIDAANGLTNTEENILTL
NLTADIKLTDYLSFKTTVSSNGNWNLIDRYNTSVFGYTDTGIETTTRNYNREGLEINRTQ
ISSMQNNLFSTINFNKEYNDIHSISAIGGLQLETFKVQNMFSRRSEPPKEGLTQVDAGTS
GIQGEGNMNGFRIFSYFGRANYTLMSKYLFEANVRADASSRFNKANRWGVFPGFSAGWRL
SEEDFIKDISEISNLKVRASWGQLGNQNISGYWPYLTVIGQNNNLSYSYNGSFSPGAAVT
ALVDQNITWETSASLDIGLEVGVLDDMITLEADYFQKTTKDILVQLPIPSVMGGISSPYE
NVGEMSNNGVEFILNYNNLKFDRDQLGFNMGLNMTYIQNEVTKFRGGDSPDQLYLLREGY
SFRTLYGYNAIGIYQSDDEAKEHMHSNPFTPTAGNLKFEDLNNDGRLNFEDKMGLGNTLP
KYTFGISSGFKYKGFDLNLLFQGILGVNMYTQNNFTDLDWENRMISTRWRDAWSPENPDS
ENPSLKFNNPWDGSQSSYWVNEVDFIKLKNVQLGYSFPPSVAEKLGVQKIYLYVNGQNVF
SIASKGYEGYDPERNTFDAGYQLYPTPRILSAGINLNF
NT seq
3177 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaccaattcgctaccttttccaaaaggtacctaagaccttgcttatcggaggg
tttttgcaatgttttgtctcggcaaaccttctggcagaaggaaatcctgatttactaggg
attgccttaacgaacgctgaatttacccactcaatcgcggaaaatataaacctgaaaaat
gtttcaggaacagtgagtgacagcgatggtgaaccagttccgggagcaactgtagtcata
gaaggctcgactactggtacagtaacagatattgatggtaagtttagcctggaggtacct
gataatgccgttcttttgatctcttttataggttatcaaactcaaagaatcaatcctggt
aatcaaagtaatcttgccatcactttggtagaagacgcgacttccttggatgaagtggtg
gtagtgggctatggtgttcagcaaaaagtgaatctcactggtgctatttctacggttgac
tttgatgatgaattgtccaatcgaccattgaccaatgcttcacaagccttaggaggtacc
gcttccggtgtttgggtaagtcaaaattcaggcaaaccaggcagtgatggtgctcagatt
agagtaaggggatggggaaccctaaacaattccaaccccttgattattatcgatggtgtt
gaaggcacctttagccagctgaatccaaatgatatcgaaaatatctctgtattgaaagat
gctgcaagtgcagccatttatggatctaaggcggccaatggagtggttttagtgactacc
agaatggggaaaaagaacgaagcgatgcaggtgaatgtaaattcctatttcgggattcag
tcccttggtagacgttatgatgtaatcaataacagtgctgaacacatggaactcaccaac
actgcattattgaatgaggggtctaccccacttttttcagaaagtttaatctcagcattc
aggaatggaaccgatccttataaatacccaaatacggattggtttaaggtaatattcaat
actgccaatattcaggaacataatgtttccattagaggtggttcggaacaatcttcctcg
tttatatccttcaattacctcaatcaagaagggatggtgcctaacacgagttcagaaagg
tatggactaagggcaaacatttcttccaatgtcaaagattggttgactgtaagtggacgg
tttaattatatccacaaagactcagatgaaccttatgcagatgtcacttatggctcttta
ggtcgggtatttgaaatgctaggtggttcagcgccttatatagctccgtatacaagagat
ggacgatttgggtctgttcaggcgattagtgaagatggtaacttattgtttgacaataga
aatgcacttatagatgctgccaatgggctgacaaacactgaggagaatatattgacactg
aatttaactgctgacattaaattaaccgattacctatcttttaagaccacagtttcttcc
aatggaaattggaacttgatagacaggtacaataccagcgtttttgggtacacggataca
gggattgaaaccaccacaaggaattacaacagggaaggcttagaaatcaatagaacacag
atttccagcatgcaaaacaacctcttctccacaattaatttcaacaaagaatacaatgat
atacatagtatatcggctattggagggttacaattagagaccttcaaggttcaaaacatg
ttttcaagaaggtcagaacctccgaaagaaggcttgactcaggtggatgcaggtacttca
ggaatccagggggaaggaaatatgaatggtttccgcatattctcctattttggaagagca
aattacaccctgatgagcaagtatttatttgaagcgaatgttagggctgatgcttcttcc
aggtttaacaaagccaatcgttggggcgtattcccaggcttctctgcaggttggcgattg
tctgaagaagatttcatcaaagatatttcagagatttctaatctgaaagtcagggcttct
tggggtcagttaggaaaccagaatatttcagggtattggccttatttaacagtcatcggt
caaaataacaaccttagctatagctataatgggagtttttctccaggagcagcagtaacc
gctttggtagatcagaacattacctgggaaacttcggcttctttggatataggtttagag
gttggtgttttagatgacatgattacactggaagctgactattttcagaaaaccaccaag
gatattttggttcagctacctattccatctgtaatgggtggtatttcctcaccctatgag
aatgttggtgaaatgtccaataatggagttgaattcatactcaattacaacaatttaaaa
tttgatagagatcaattgggctttaatatggggctgaacatgacttatatccaaaatgaa
gtcaccaaattcaggggaggagattctcccgaccaattgtatttacttagggaagggtat
tcctttagaacgctatatggctacaatgccataggcatttatcaatctgacgatgaagca
aaggaacacatgcattccaatccatttacaccgacagctgggaatttaaaatttgaagat
ttaaataacgatggaaggttgaattttgaggataagatggggcttggaaatacacttcca
aagtatactttcggaatatcgtcgggttttaaatacaaaggttttgacttaaatctcttg
tttcaggggatattgggtgtgaacatgtacacgcagaacaatttcacagatcttgattgg
gaaaacaggatgatatctacccgatggagagatgcatggtcacctgagaacccagattca
gaaaatccaagtttgaaatttaataatccatgggatggttcccagtcctcttattgggta
aatgaagtggacttcataaaattaaagaatgttcaattgggttattctttcccaccttct
gttgctgaaaaactgggagtacagaaaatttatctgtatgtaaatgggcaaaatgttttc
tctattgcaagcaaaggctatgaaggctacgatccggaaagaaatactttcgatgctggt
taccagttgtatcctacccctagaattttatcagcaggtatcaatttaaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
