Cyclobacterium amurskyense: CA2015_4560
Help
Entry
CA2015_4560 CDS
T03993
Name
(GenBank) Transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain
Organism
camu
Cyclobacterium amurskyense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
HTH_41
HTH_36
Aminotran_5
HTH_Tnp_ISL3
HTH_50
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP53896
UniProt:
A0A0H4PH86
LinkDB
All DBs
Position
complement(5692843..5694243)
Genome browser
AA seq
466 aa
AA seq
DB search
MTLFEKLAGNFENLIAKGTLKLGDKMPSIRTVSKEYGVSKNTVIQAYLLLESRSCIVSRP
QVGFFVCLKEDQRLPMPQASSPSINGAPGKEDGLIGKVFSNFVNKSITQMSLSVPDESFF
PVARLNKCLQTATKTLAAGGTGYDDIQGNLRLRKNVSKWSFTWGGNLGADELVTTSGAMH
AISLAFMALTKPGDRIGVESPVYFGILQLAKNMGLKVVELPTDPEFGVLPQDLEELIGEI
DICLLVSNFNNPLGSCMPDENKKSVVELLTRYNVPLIEDDLYGDVYFGASRPKPCKAFDT
EGMVLWCGSVSKTLAPGYRVGWMAPGKFIKSILKLKLFHSISSTTVTQEAIGLFLENDYY
EKHLRQLRATLYSNSLHFIRAIADYFPKGTKISRPQGGFVLWVELDKKWDTGKLFDKVLS
RGISIAPGRMFTLQSQFHNCLRLNYGLPWTDKLEQELKLLGQILKE
NT seq
1401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccctatttgagaagcttgctggaaattttgaaaacctcattgccaaaggaacccta
aaattaggggataaaatgccttctatacgtaccgtaagtaaagagtatggggtaagtaag
aacactgtgattcaggcctatttgctcttggagagcaggtcatgtatagtgtcacgtcct
caagtcggattttttgtttgtttaaaagaggatcaaagacttcctatgcctcaggcaagt
agtcctagcattaatggtgctccaggtaaagaggatggtttaatagggaaagttttttca
aactttgtaaataaaagcattacacaaatgtccttaagtgtacctgatgaatcgttcttt
cctgtggctagattaaataaatgtctacaaacagccactaaaacacttgctgcgggagga
acagggtatgatgatattcagggaaatcttcgcttacgcaaaaatgtgtccaaatggtct
tttacttggggaggtaatttgggtgcggatgaattggtaactacctcaggggccatgcat
gccatttctttggcttttatggctttgaccaagccgggtgataggataggagtggagagt
ccagtgtattttggtattttgcaattggcgaaaaacatgggcctaaaagtagtagaacta
cctacagaccctgaatttggtgttttgccgcaagatttagaagaattgattggggaaatt
gatatctgcttgctggttagtaatttcaataacccattgggcagttgcatgcctgatgaa
aataaaaaatctgttgttgaattattgaccaggtacaatgtgccattgatagaagatgac
ctttatggtgatgtttattttggtgctagccgaccaaaaccttgtaaagcctttgataca
gagggaatggttttgtggtgtggctctgtgtcaaaaactttagcgcctggctatagggtc
ggctggatggcaccgggtaagtttataaaatctattttaaaacttaaactgtttcattcc
atttctagcacaactgtgacccaggaggcaattgggttatttctggaaaacgattattat
gaaaaacatttgaggcagctaagggctactttatatagtaactctctacattttatacga
gctattgcagattactttcctaaaggcaccaaaataagtagaccacagggaggttttgta
ttgtgggtggagctggataaaaaatgggatactggaaaactatttgataaagtattgtct
agaggtatcagtatagctccaggtcgaatgtttaccttgcagagtcaatttcacaattgc
ctcaggttaaattacggacttccatggactgataaattggagcaggaattaaagctattg
ggccagatcttaaaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system