Campylobacter porcelli: CSUIS_0103
Help
Entry
CSUIS_0103 CDS
T05900
Name
(GenBank) autotransporter domain protein
Organism
camy
Campylobacter porcelli
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4573
DUF6071
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARQ99959
UniProt:
A0A1X9SUI2
LinkDB
All DBs
Position
111255..115370
Genome browser
AA seq
1371 aa
AA seq
DB search
MSSMLKKSLISLIASQTYLFGAWINLTPCGWDDDCAISSDVSVEGVYGVGGGKLSINQGA
TITNSGSVTIYHNGDFDIENSGNIVFTENSSSNSGIYAFTTNDLNINNSGTIENKSSNKA
AILVGGGGKINSITNSGTISSNGYGILSGSEDSNFGVDSIGKITNTGTISTTSGQNAIYG
FGTIESIDNNQGGKITGINVSNTITNLNNYGIIEGNVVAKKITKLNNAGSISGDLIVEDE
IESVDGTGSIGGRFILAGGDNKDISIKHNLGSGFVIQSDKDRITNETQLISNSAVAFEVN
ANVGEIINKNTIQSSANKPSLQVASDKVVKKLENQSTGKILGEEGIVNSGKIVMLDNLGD
ITKFNNQGELENLNNQKNISNLTNQSNIDKIDNSGNIADIKNQGQIDNLNNKNIITSIDN
IKNIQTINNQGKIDRLNNQGSISSLDNKDKISNLANQSNIDKIDNSGNISNLINTHTITT
LNNSNKIDNIDNQKDINSISNQSKITTINNQGSIDEIINEKDINNISNKHIIDSIKNQGK
IVMLDNLGDITKFNNQGRLENLNNQKNISNLTNQSNIDKIDNSGNIADIKNQGQIDNLNN
KNIITSIDNIKNIQTINNQGKIANLQNFKTIGGGKIGINNSNKIGSLINHGTITAKIGLD
NSGVIDKIDNQGVIAGDKFGINNSSVISNLINSGTISGKEAAINNEGVIEKLTLMPSSKL
LSDSQTIIKNSGIIGEIDSQIQIDKKTSIVIDNDSVLSRVNIKTDMSGLDYGVKNSGEIT
DLIINANLEGENHAGISNNNTISKITNSSTLSGYNGIYNDNYIGTIENNGTIISHSSTAI
YNDGTIDKIDNNGKIVGDIINNSPNTIKQLINSGEITGNMINNAGMNVGLYTQDKAIENK
GKIAGIINHGTIRAKKYGIYNDIGANISNLANYGKIIFKDQNGAQIYNNGNIDITMWGIS
LGGTSLSSIDTTNGNANIDDRIFVAGDNVDGIKFGNNSIIVSSGSSTGGVHALDNMVLKH
NGTSYIGVGDEIGINCDTLVFNNNGIMNMTCITLAGGGQAINIISNKAKVDIPRVWINNH
TISSNTHMDILRKLNLTNFDLSSDDWVGFATPYASHTKLNLQNGKATTNTYGALIGASKT
LDIGAMVALYTGYEYASTNMPRSSSLDDRSYYTGVSYYGELNLLDRIDAYVKLHSAYKYT
KSKIVKLDEARTTTLEYLNSDRARLSSIGASAALGVNIYQNNNTISPELSLGYDRINISN
YTLGYEEYAKSHLNLPNLSASIAWQKDYENIYTTAKIGVKRLLSDTHKTALKYQNLNMDK
ADTKLINTYIDTSLALGCKVDDNTNLSIIYYGNYANEAKSHSIMAQMESKF
NT seq
4116 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtcttcaatgcttaaaaaatcattaatttctcttatcgcttctcaaacttatctattt
ggtgcttggataaatttaaccccttgtgggtgggatgatgattgtgctatttctagcgat
gttagcgttgaaggtgtttatggtgttggtggtggcaaactaagtataaatcaaggtgcc
actataactaatagcgggtctgtaacaatttatcataatggtgattttgatattgaaaat
agtggtaatattgtatttacagaaaattcgagtagtaattctggcatatacgcatttacc
acaaatgatttaaatataaacaatagtgggacaatagagaataaatcatccaataaagct
gctatattggtcggtggcggcggtaaaataaacagcattacaaactctggcaccataagt
agcaatggatatggtatattgagtggttcagaagattcaaactttggagtagatagcata
ggtaaaataaccaacacaggcaccataagcactacaagcggacaaaatgccatctatgga
tttggcacgatagagagtatcgataataatcaaggtggcaaaatcactggtataaatgtc
tcaaatacgattacaaatttaaataattatgggattatagaggggaatgtagtagctaaa
aagataacaaaactaaataacgctggaagtattagtggagatcttatagtagaagatgag
atagaaagcgtagatggcacggggagtataggtggtagatttatacttgctggtggggat
aataaagatattagcatcaagcataatctaggtagcggatttgtcatacaaagcgataaa
gataggatcacaaatgaaactcagctaatatcaaatagtgcagtggcgtttgaagttaat
gctaatgtaggagagataataaataaaaatactatacaaagcagtgctaataaaccatct
ttacaagtggcatctgacaaggtggttaagaagctagaaaaccaaagcaccggtaaaatc
ttaggcgaagaggggattgtaaatagcggcaaaatagttatgctagataatcttggcgat
ataactaaatttaacaaccagggcgagttagaaaacctaaataatcaaaaaaatatatca
aatttaaccaatcaatcaaatatagataaaatagataattctggaaatatagctgatatt
aaaaatcaaggacaaatagataatctaaataataaaaatattatcactagcattgataat
ataaaaaacattcaaactataaacaaccaaggtaagatagatagattaaataatcaaggc
agtataagcagtctagataataaagataagatatcaaatttagccaatcaatcaaatata
gataagatagataactctggaaatatatcaaatttaatcaacacccacactataaccaca
cttaataactcaaataaaattgataatatcgataatcaaaaagatataaacagtattagc
aaccaaagcaagataactacaatcaataatcaaggcagtatagatgagataataaatgaa
aaagatataaataatatctctaataagcatataatagatagcattaaaaatcaaggcaaa
atagttatgctagataatcttggcgatataactaaatttaacaaccaaggcaggttagaa
aacctaaataatcaaaaaaatatatcaaatttaaccaatcaatcaaatatagataaaata
gataactctggaaatatagctgatattaaaaatcaaggacaaatagataatctaaataat
aaaaatattatcactagcattgataatataaaaaacattcaaactataaacaaccaaggc
aaaatagcaaatttacaaaattttaaaactataggtggcggtaaaatcgggattaataat
agtaataaaataggttcattaatcaatcacggcactataactgcaaagattgggctagat
aatagcggagtgatagataagatagataatcaaggcgtcatcgctggagataaatttggt
ataaataatagctcagtaatctcaaatttgattaattcagggactataagtggcaaggaa
gcagctataaataatgaaggcgtgatagaaaagctaactcttatgccaagctcaaaactc
ttaagcgactcacaaacgataatcaaaaatagcggaattataggcgagatagatagtcaa
atacagattgataaaaaaacttcgattgttattgataatgatagtgtgcttagtagggtt
aatattaaaactgatatgagtgggctagattatggggtgaaaaatagcggcgagattaca
gatttgataattaatgcgaatttagaaggcgaaaatcacgctgggattagcaataataac
accatatcaaagattacaaatagtagcactctaagcggatataatggaatttacaatgat
aactacataggcactatagaaaataatggcacgattatatctcattctagcacggctatt
tataacgatggaacaatagataagatagataataatggtaagatagtaggcgatattatc
aataactcgccaaatactattaaacagctaataaactctggcgagataactggaaatatg
ataaataacgctggaatgaatgtaggtctatacactcaagataaagctatagaaaataaa
ggcaaaatagctggaataatcaaccacggcaccataagagcgaaaaaatatggaatttat
aatgatattggtgctaatatatcaaatttagctaattacggcaagataatatttaaagat
caaaatggtgctcaaatatataataatggaaatatagatattactatgtggggcattagc
ttaggcgggactagcctaagcagtatagataccactaatggcaatgccaatatagatgat
aggatatttgtagctggggataatgtagatgggattaaatttggtaataactccatcata
gtctcatcaggtagtagcaccggtggcgtgcatgcactagataatatggtattaaagcat
aatggcactagctatatcggagtgggcgatgagattggtataaactgtgatacgctggta
tttaacaataatggaataatgaatatgacttgtataaccttagctggtggcggacaagct
ataaatataatctctaataaagctaaagtagatataccgcgagtatggataaacaatcac
actatatctagcaacacccatatggatatactaaggaagctgaatttaacaaattttgat
ttaagcagtgatgactgggtgggatttgctacgccatatgctagccatacaaagctaaat
ttacaaaatggcaaagccaccacaaatacttatggtgctctaataggagctagtaaaacc
ctagatataggtgctatggtggcactttatactggctatgagtatgctagtaccaatatg
ccaagaagctctagcttagatgatagatcatactacacaggggttagctactatggggag
ttaaatttgttagataggatagatgcgtatgtcaaattacatagtgcatataaatatact
aaaagcaaaatagttaaattagatgaggctaggacaacgacgctagagtatctaaattca
gatagagctagattaagctccataggtgctagtgcggctcttggggtcaatatctaccaa
aataataacaccatatccccagagctatctctaggctatgatagaataaatataagcaat
tatactttaggctatgaagagtatgctaaatctcatctaaacttgccaaatttatcagcc
tccatcgcatggcaaaaggattatgaaaatatttacaccacggcaaaaattggggtaaaa
aggctattaagcgatactcacaaaaccgccttaaaatatcaaaatttaaatatggataag
gcagatactaagctcattaacacctatatagatacaagcttagccttaggatgtaaggta
gatgataatacaaatttatctataatctactatggcaattacgctaatgaagcaaaaagc
cactctattatggctcaaatggagagtaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
