Campylobacter porcelli: CSUIS_0419
Help
Entry
CSUIS_0419 CDS
T05900
Symbol
addA
Name
(GenBank) exonuclease V, helicase AddA
Organism
camy
Campylobacter porcelli
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_12
Cas_Cas4
PDDEXK_1
DEAD
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARR00260
LinkDB
All DBs
Position
422334..425093
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MSFESYLCLEASAGSGKTFALSVRYIALLLQGNHPSKILALTFTNKAANEMFHRIITTFC
NLHEDKQKGELAELCELLDKEPKQILALRDEMMDEFLSSELKISTFDSFFATILRQFSLN
LGIMPDFNSVENNKILVKNEFKKLLISNSMITSVAKYLNSTNSKESDLFDKLDMLSQCKF
KPYSSICPTTKLAMKKYEELCDVALKLSSHKNYIKNFNKNLSLKDIVEKPIVKAINTDYF
EKVIDNAEFNSARDAFISAAKEYYLALEKYEIAQISNLINLYKQAIINVNRRENSLSFAD
IANWVNELLTSKNKQDIDMLYFRLDARIKHILIDEFQDTSVNQYEILEPLIAESVAGIGQ
SGLGSFFYVGDTKQSIYRFRGGQSGLFNKLKDDFSQIKTQNLGKNYRSDKFIVEYVNNIF
RSKYTNYIDQIPNSKDDGYVKVDRFDFNEYLDKIYENITHLSQSGVAYSDMAILCWKNDD
IYKIKNFLESKGLIVSTQMTNMLIKSANVAAVVAFVKYCILGDEIYSLIVYEILKSKNDK
LELKIDAPISSTLKFIAKYLGIEPYDIDMLKLYEISNNYSDIYDFIFNIDEDQTKSAKSS
QNGITIMTLHKSKGLQFDHVIVMDSIAKSSVDRNKFLIEYDLNSNRWEIRLNNKAFENLG
DESYIKLKNRQKELDKIDKINALYVALTRAKHSLIILAKDDPNGKNISYFTQYISNHNTV
EYLNLDECELGSIKPAIKEQESSLVKPVELEPFIKVARQEIVKDDEIKSEKNLDLIYFGN
ALHYYLESLNFNDIKSQKIANNCLYNRFGAYLDSDCLEDIISRANRLINNIEFLEIIDGK
ELYKEQEIGFNGALKRIDLLCMNESEIYIVDYKSSDKNLDKDRAQVEQYLEILSQIYPDK
SVKAAIIYILSEKIQILKL
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttgagagctatttatgcctagaagcaagtgctggaagcggtaagacatttgca
ctttctgttagatacatcgccttattattacaaggcaatcacccaagcaagattcttgcg
ctaacttttacgaacaaagctgccaatgagatgtttcataggattataaccacattttgt
aatctacatgaagataagcaaaaaggcgagttagcagaactttgtgagcttttagacaag
gagcctaagcagattttggctttaagagatgagatgatggatgagtttttatcaagtgag
cttaaaatatctacatttgactcattttttgctacgattcttaggcaatttagcttaaat
ttaggcattatgcctgattttaattcagtagaaaataataaaatattagtaaagaatgag
tttaaaaaactgctaatttctaactctatgattactagcgtagctaaatatttaaatagc
acaaatagcaaggagagcgatctatttgataagctagatatgcttagccagtgtaaattt
aaaccctatagctccatatgccctaccaccaaactagcgatgaaaaagtatgaagagcta
tgtgatgtagcgttaaaattaagtagccataagaactatataaagaattttaataaaaat
ttaagcttaaaagatatagttgaaaagccaattgtcaaagctataaatacagattatttt
gaaaaagtaattgataatgccgagtttaatagtgctagagatgcatttataagtgcggct
aaagagtattatctagctcttgagaagtatgaaatagctcaaatttcaaatttgattaat
ctatataaacaagctattataaatgtaaatcgccgtgaaaatagcttgagttttgctgat
attgcaaactgggtaaatgagctactaacgagcaaaaataagcaagatattgatatgcta
tattttcgccttgatgctaggattaagcatattttgattgatgaatttcaagatactagc
gtaaatcagtatgagattttagagccattaatcgctgaaagtgtggctggaatagggcaa
agtggtcttgggagcttcttttatgtaggcgatacaaagcagagtatttatagatttcgt
ggtgggcaaagtgggctttttaataagctcaaagatgatttttcacagatcaaaactcaa
aatttaggtaaaaattatcgcagcgataagttcatagtagagtatgtaaataatattttt
agatcaaaatatacaaactatatagatcaaattccaaatagcaaagatgatggctatgta
aaggttgatagatttgattttaatgagtatttggataaaatttatgaaaatatcacccat
ctaagccaatctggcgtagcatatagcgatatggcgatactttgctggaaaaatgatgat
atttataaaattaagaattttttagaatctaaaggcttgatagtatctacgcagatgaca
aatatgcttattaaaagtgctaatgtagctgctgtggtggcatttgtcaaatattgtatt
ttaggtgatgagatttactccttaatagtctatgagattttaaaaagcaaaaatgataaa
ttagagttaaaaatcgacgcccccatctctagcactcttaaatttatcgcaaaatatctt
ggcattgagccttatgatattgatatgctaaagctatatgagattagcaataactatagc
gatatatatgattttatttttaatattgatgaggatcagaccaaaagtgctaaaagtagc
caaaacggcattactataatgacacttcataagagcaaagggttgcagtttgaccatgtg
attgtgatggatagtatagcaaaatctagtgtagataggaataaatttctaattgagtat
gatttaaattcaaatagatgggagattagattaaataataaagcttttgagaatttaggc
gatgagagttatataaagcttaaaaatagacaaaaagagcttgataaaattgataagata
aatgcactctatgtcgcactaactagagcaaagcatagcttaataatcttagcaaaagat
gatccaaatggcaagaatatatcatattttacgcaatatataagtaatcataatacagtg
gagtatctaaatttagatgagtgtgagctaggaagtataaaaccagccattaaagagcaa
gagagtagcttggttaagccagttgagcttgagccatttatcaaggtagctcgtcaagag
attgtaaaagatgatgagataaaaagtgagaaaaatctagatttaatatattttggaaat
gcgttacactactatcttgagagtttaaattttaatgatataaaatcacaaaaaatagct
aataattgcctatataatagatttggagcatatcttgatagtgattgtttagaagatatt
atatcaagggctaatagacttataaataatatagaatttttagaaattatagatggcaaa
gagctatataaagagcaagaaattggctttaatggagcattaaaacgcatagatttgctc
tgtatgaatgagagcgaaatttatatcgttgattataaaagttcagataaaaatttagat
aaagatagggctcaagtggagcaatatttggaaattttatcccaaatttatccagataaa
tcagttaaggcggctataatttatatattaagtgaaaagattcaaattttaaaactctaa
DBGET
integrated database retrieval system
