Campylobacter vicugnae: CVIC12175_0194
Help
Entry
CVIC12175_0194 CDS
T05727
Name
(GenBank) glycosyltransferase, family 1 (tetratricopeptide repeat protein)
Organism
camz
Campylobacter vicugnae
Pathway
camz00552
Teichoic acid biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
camz00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00552 Teichoic acid biosynthesis
CVIC12175_0194
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyphos_transf
Glycos_transf_1
Glyco_trans_1_4
TPR_1
TPR_2
TPR_6
TPR_12
TPR_8
TPR_19
TPR_16
ANAPC3
TPR_9
TPR_7
Glyco_transf_4
TPR_17
TPR_11
ARM_TT21_C
Sel1
GT4-conflict
ARM_TT21_4th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARR03348
LinkDB
All DBs
Position
179394..182744
Genome browser
AA seq
1116 aa
AA seq
DB search
MLNPLFNYYFSMGALYYHRNKNYQKALDYYIKANSYNKNNAKCIFKIGMCYFKMQDWNNA
KTYIQNAIALNPNQKHWKKQLDQSQNHIESGGISRGKLWWKEVEDLKDEIATKGGNFARY
KNLAIALEMMLRFKEAALAYSQALKLLKDLSSIDAEYYYKMGYCYEKGMENQSDLDLAKE
LYKKAISIDEKLESNLYGIGVFHQNKGLWIDANKAYLEYYNDNISTNHDDNMLYKIGMSF
DRLYDWENAAIYYEKALEINYHRPYTHYRLGFVYERQKEYEKAAYYYQEAVARNSEHKPY
WYYRLGYCLNKLGKFEEANKAFIEQNITSQNPYGVDDKILKNKAFKDRAIYTHYLENTAI
ISKTILYETFHGRLMSCNPYAIFLHCINSVDFKDFTHIWVLESAYDMKPEFRKMKNIIVI
KRGSHTYLKYLAQSEYLINNTTFHSYFTRREGQKYLNTWHGTPWKSLGKHIKTSFMEHAN
TQRNFLQTTHIINPSKFVEDVILKDYDIDGTYNGKTLISGYPRIDLTLKKQLQLKERFGI
KEGEKVLLYAPTFRGHFGSPRFEAQSIMKHLEKLCIMPFKVLFKGHHETLRYIEGENLNF
CSANDRDIDTNELLSIVDVLITDYSSIAFDFMLLDRPIIYFTYDYEEYKNERGLYFDINE
ITQNRCDTIDDVINLLSNKEFLDKKNRYMHLKDKFFPYEDGDATKRVVDFFFFNKYDDIS
SNKTNDKINILFFEGPFMPNGITSSMKNLINNIDQEKYRIFLSIEPNSIAPYPERLEQFN
DIIDKVHVLPKVGAKNLTLEESYIESKFNPKSNKEQENILQNIYKREFKRIYADSKFDIV
INFEGYNVYWARLFAYGTKLKKIIYMHNNMLGEFNKRFPSLEMVFYTYKYYDKLISVSKE
TKNTNQISLSKNYNIDLNKFDYIENAINYQEIIEKSNIALPASIENAYFQNRFKVFINVA
RLSIEKDQEKLIRAFKDVNTKYPNTKLIILGDGPLKEKLENLIKRLKLKKSVFLLGRISN
PYPYLKKADCFVMSSNHEGQGLAMIEALILKKPVISTNFSCAYDVLDSGKYGLIVNNNIN
CLAEAMKKFISQGLKFNTFKYKEYSEKAILDFYNII
NT seq
3351 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaccctctatttaattactatttttctatgggagctttatattatcatcgtaac
aaaaactatcaaaaggcacttgattactatattaaagcaaattcttataataaaaataat
gctaaatgtatttttaaaatcggaatgtgttattttaaaatgcaagattggaataatgca
aaaacatatattcaaaatgcaatagcattaaatccaaatcaaaaacactggaaaaaacaa
ttagatcaatctcaaaaccatatagaatctggcggcatatcccgtggtaagctttggtgg
aaggaagtagaggatttaaaagatgagattgcaactaaaggcggtaattttgcaagatat
aaaaatcttgctattgctcttgagatgatgttaaggtttaaagaagctgcattggcctat
tcccaagcattaaaattattaaaagatttatctagtattgatgctgaatattattataaa
atgggttattgttatgaaaaaggcatggagaatcaaagcgatttagatttagcaaaagag
ttatacaaaaaagcaatatccattgatgaaaaattagaatcaaatttatatggaataggc
gtattccatcaaaataaaggtctatggatagatgctaataaagcatatttagaatattat
aatgataatatatcaactaaccacgatgataatatgctatataaaataggaatgagtttt
gataggctttatgattgggaaaatgcagctatatattatgaaaaagcattagagattaat
tatcataggccttatactcattatagattgggttttgtttatgagagacaaaaagagtat
gaaaaagcagcttattattatcaagaagctgtagctcgcaatagcgaacataaaccatat
tggtattataggctggggtattgtcttaataaattaggcaaatttgaagaagcaaataaa
gcatttatagaacaaaatataacttcgcaaaacccgtatggtgttgatgataaaatatta
aaaaataaagcttttaaagatagagctatatatactcattatctggaaaataccgcaatc
atatcaaaaactatattgtatgaaacattccatggcagactcatgagttgtaatccatat
gctatatttttacattgtattaatagtgttgattttaaagactttacgcatatatgggta
cttgaaagcgcttatgatatgaaacctgaatttagaaaaatgaagaatataatcgtaatc
aaaagaggaagtcatacatatctaaaatatctagcacaatcagagtatttaattaataat
acaacttttcattcatattttactagaagagaaggacaaaaatatctaaatacatggcat
gggacaccttggaaatcgcttggcaagcatattaaaaccagttttatggagcatgctaat
actcaaaggaattttttacaaactactcacataataaaccctagtaaatttgtagaagat
gtcatattgaaagattatgatatagatggtacttataatggcaaaactcttattagtggc
tatcctagaatagacttaaccttaaaaaaacaattgcaattaaaagagagatttggtatt
aaagaaggggagaaggttttattatacgctcctacatttagaggacattttggaagtcca
agatttgaggctcaaagcatcatgaaacacttagaaaagttgtgcataatgccctttaaa
gttctctttaaagggcatcatgaaacacttagatatatagaaggggagaatttaaatttt
tgcagcgcaaatgatagagatatagatacaaatgaacttttaagtattgtggatgtattg
attactgattattctagtattgcatttgattttatgctgcttgatagacctattatatat
tttacatatgattatgaagaatataaaaatgagcgtggattatattttgatataaacgag
attacacaaaatcgctgcgatactatagatgatgtgataaatctattatctaataaagaa
tttttagataagaaaaatagatatatgcacctaaaagataaattttttccttatgaagat
ggagatgctactaagcgtgttgtcgatttctttttctttaataaatatgatgatatatca
tcaaataaaacaaatgataagataaatattttatttttcgaaggaccatttatgccaaat
ggtataacaagctcaatgaaaaatttgatcaataatatagatcaagaaaaatatagaata
tttttatcaattgaaccaaatagcatagctccatatcctgagagattagagcaatttaat
gatatcattgataaggttcatgttttgcctaaagtaggtgccaagaatcttacattagaa
gaatcttatatagaaagtaaatttaacccaaaatcaaacaaagaacaagaaaatatctta
caaaatatttataaaagagaatttaaacgcatttacgctgatagtaaatttgatatagtt
attaattttgaaggttacaatgtctattgggctagattgtttgcatatggtacaaaatta
aagaaaattatttatatgcataataatatgctaggagaatttaataaacgatttcctagt
ttagaaatggtattttacacttataaatattatgataaactaatatcagtatcaaaagag
acaaaaaatacaaatcaaataagtttatcaaaaaactacaatatagatttaaataaattt
gactatatagaaaatgcgataaactatcaagagattatagaaaaaagtaatatagcattg
cctgctagtattgaaaatgcttattttcaaaatagatttaaggtatttataaatgtagct
agattatctatagaaaaagatcaagaaaaattaattcgtgctttcaaagatgtgaataca
aaatatccaaataccaagttaataatactaggagatggacctttaaaagaaaaattagaa
aatttaatcaaaagattaaaattaaaaaaatctgtatttttacttggtagaatatcaaat
ccatacccttatttaaaaaaagcagattgctttgtaatgagttcaaatcatgaagggcaa
ggtttggctatgatagaagctttaattctaaaaaaaccagttattagtactaatttttct
tgtgcttatgatgtattagatagtggtaaatatggattaattgtaaataacaatataaat
tgtttagcagaagctatgaaaaaatttatatctcaaggattaaaatttaatacatttaag
tacaaagaatatagtgaaaaagcaatactcgatttttataatattatttag
DBGET
integrated database retrieval system
