Cyanobacterium aponinum: Cyan10605_2570
Help
Entry
Cyan10605_2570 CDS
T02376
Name
(GenBank) transcriptional regulator, AraC family
KO
K07506
AraC family transcriptional regulator
Organism
can
Cyanobacterium aponinum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
can00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
can03000
]
Cyan10605_2570
Transcription factors [BR:
can03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
AraC family
Cyan10605_2570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
MAGUK_N_PEST
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ54648
UniProt:
K9Z8F1
LinkDB
All DBs
Position
complement(3057341..3058189)
Genome browser
AA seq
282 aa
AA seq
DB search
MPNQVIVNSPSIVHESVHRIIQVYQNYHSTGEDPKPKILDRHLIGLTTNQICYLTLKHNS
DKLKEIRYSTEELMIFPAGINHWASWKNSTGIFLSIDNKLFDSYAQKLLDGQTFQLISHL
KMRDNFLRELIGAIALVSKKSSEIDDLYLESLFSTLSLHLISNYTEKKTINKSNYGGLAP
HKLSIVIDYIKSNLNEKITIATLANLLALSEYHFIRCFKESTGISPYQYILKERLKKAVE
MIKKTDENLAHISLICGFSSQSQMSVMLKKHFNLIPKDLRDS
NT seq
849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaatcaagtaattgttaattccccttccatcgtccatgaatctgtacatagaatt
attcaagtttatcaaaattatcatagcaccggggaagatccaaaacctaaaattttagat
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gccacattagctaatttattagccttaagtgaatatcattttatccgttgctttaaagaa
agtacaggaattagtccctatcaatatatcttaaaagaaagactaaaaaaagctgttgaa
atgattaaaaaaaccgatgaaaatttagctcatatttcccttatttgtggtttttcttct
caaagtcaaatgagtgttatgttaaaaaaacattttaatttaatacctaaagatttgcgt
gatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
