Cyanobacterium aponinum: Cyan10605_2629
Help
Entry
Cyan10605_2629 CDS
T02376
Name
(GenBank) Exonuclease RNase T and DNA polymerase III
Organism
can
Cyanobacterium aponinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_T
AAA_16
NACHT
AAA_22
ResIII
TniB
AAA_5
nSTAND3
RNA_helicase
Bac_DnaA
SWI2_SNF2
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ54703
UniProt:
K9Z8N2
LinkDB
All DBs
Position
3127994..3130525
Genome browser
AA seq
843 aa
AA seq
DB search
MNFIVIDTEGSDTLREIAIINQDGKLIYEAFVRTRGSTTKRLNHKPLTEIVRDLQNILPN
QTIICHNVQHDRAILDKSFYKCRQQLPQAQFICTLELAQQKYPNFDSYQLGNLSRRFFLQ
VDNLYFKRVQAHRARYDAQFTLQLYLYLTSHPRIEDKPAMRVEKIVTTPSVKNPFSSSRV
DDPYQNHLDFEHIYKSQFYHLKSLVEEIKQDKENQQSRGALILGEAGSGKTHLMMRLAKA
TLKTNRLLYVRQPNNPNSVMHHIYSRILESFAQKVDIEGTQRTQLDLLLAHVFVNILKTI
QQEDKTQKLEQIIQLLQDDSLILYERLGGENTQRNRDNWKYIETKITQWWENNYSASGYA
PNILKGIIKYCSYKDIKTKDKVRRWLTGNELDSQICEEIGLNNWQEDNLSKEDFALEGIR
LFGQLSTLDEPLIIIFDQLEYLIHKPDILTSFGNALREIITHVPNSLIVVNLFPDRWQSF
QGYFDDSTIDRLSINQLILQTPSTGELKKMLAMKCERVGTTLEELFKPEDLQIILKQSSI
RKVINKASDYYHYRVLNLPLPEELPRINKASVEERLVSLENALTQIALICQPLLNHNNEK
QLNIETHKNINNNGLDNEKQEDIIFDFEINKTESTKPNDEKIKVTKNNKLSQEKIVLNYF
EENEQLISQKYDKPNIITDDDEYGKLVTIMEAFKSYDSRIELDHLTLGNRVLPSNLLIIK
DKIKLAVGFLNIGGSAFTNRIRNFNELVVSSPQTKFYLLRDEKEGEITATGGRNRIEQLN
YTSNGQFMVVDKEARVIFESIYKMILDINQNDLEVSMNDAIKVVLNRYANYWLIREIFAT
NHN
NT seq
2532 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttattgtcatcgataccgaaggaagtgacaccctcagagaaatagccattatc
aaccaagacggaaagctaatttatgaagcctttgttagaacaagaggcagtacaacaaaa
agactaaatcacaaacctctaacagaaatagtcagagacttacaaaacatcttacctaac
caaaccattatctgtcataatgtacagcacgatcgcgccattcttgataagagtttttat
aaatgccgacaacaattacctcaagcacaatttatttgcacccttgaattagcacaacaa
aaataccccaacttcgacagttatcaactaggcaatctcagccgtagattctttctgcaa
gttgacaatctttattttaaaagagttcaagcccatcgcgctcgctatgatgcacaattt
accttacaattatatttatacttaacttctcacccccgaatagaagataaaccagcgatg
agagtagaaaaaattgtgacaacaccctctgttaaaaatccctttagtagcagtcgtgta
gatgacccttatcaaaatcatttagactttgaacatatatacaaaagccaattttatcat
ctaaaatccttagtagaagaaattaaacaagataaagaaaaccaacaaagtcgaggcgca
ttgatactgggggaagcaggaagcggaaaaactcacctgatgatgcgcctagccaaagcc
accttaaaaaccaatcgcctcttatatgtgcgtcaaccgaataatcctaactctgtgatg
caccatatttactcaagaatactagaaagttttgcccaaaaagttgacatcgaaggcact
cagcgcactcaattagacttacttttagctcatgtttttgtcaatattttaaaaacaatt
cagcaggaggataaaacccaaaaattagagcaaataattcaacttttacaagatgatagc
ctaattttatatgaacgtttaggaggagaaaatacccaaagaaatagggataattggaaa
tatatagaaacaaaaataactcagtggtgggaaaataattattccgctagtggttacgct
cctaatattcttaaaggtatcattaaatattgtagctataaagatataaaaaccaaagat
aaagtcaggagatggttaacaggaaacgaattagacagtcaaatttgtgaagaaataggc
ttaaataattggcaagaagataacctaagtaaagaagattttgccttagaaggaatccgt
ttatttgggcaactatccaccctagatgaaccattaattattatctttgatcaattagaa
tatctcatacataaacccgacattttaaccagttttggtaatgctttaagggaaattata
acccatgttcctaactcgttaattgtagttaatctttttccagatcgatggcaaagtttt
cagggatattttgacgattctaccattgacagactatctattaaccaactaattttacaa
actccttcgacaggtgaattaaaaaaaatgttagccatgaaatgcgaaagagttggcaca
actttagaggagttatttaagcctgaagatttacaaattattttaaaacaatcttctatc
agaaaagtaattaataaagcctcagattattaccattatcgagtgttaaatttaccctta
cctgaagaattacctcgtattaacaaggcttctgtagaagaaagattagtaagtttagaa
aatgccttaacacaaattgctcttatttgtcaacccttattaaatcataataacgaaaaa
caattaaatatagaaacacataagaatattaataataatggattagataacgagaaacaa
gaagatataatatttgattttgagatcaacaaaacggaatcaacaaagcctaatgatgag
aaaataaaagtaacgaaaaataataaactatctcaagaaaaaatagttttaaattatttt
gaagaaaatgagcaattaatttctcaaaaatatgacaaacctaacattattaccgatgat
gatgaatatggaaaattagtaacaattatggaagcatttaaaagttatgattcaaggata
gaattagaccatttaactttaggaaatagagtacttccttcaaatttattaattattaaa
gacaagattaaattagcagttggttttctcaatattggtggttcagcttttaccaataga
atcaggaatttcaatgaattagttgtttcttctcctcagactaaattctatttattaaga
gatgaaaaagaaggagaaataactgctacaggaggtaggaatagaatagaacaattaaat
tacacaagtaatggtcaatttatggtagtagataaagaagcaagagttatttttgaatca
atttataaaatgattttggacattaatcaaaatgatttagaagttagtatgaatgatgct
attaaagtggttttaaataggtatgcaaattactggttaatcagggaaatttttgcgaca
aatcataactaa
DBGET
integrated database retrieval system
