KEGG   Capsicum annuum (peppers): 107859147
Entry
107859147         CDS       T04646                                 
Name
(RefSeq) phytochrome E isoform X1
  KO
K12123  phytochrome E
Organism
cann  Capsicum annuum (peppers)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cann00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09193 Unclassified: signaling and cellular processes
   99995 Signaling proteins
    107859147
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF PAS_4 HisKA PAS_9 HATPase_c PAS_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 107859147
NCBI-ProteinID: XP_047262727
LinkDB
Position
2:121274701..121278247
AA seq 1139 aa
MELQNSKTRKGTTPTGQNNKNNKDTYEDSTFSASSAASHMKHKANKATMAQYNADAKLMA
EFEKSTVSGKSFDYSKSVPYAPEDANEEEIIAYLSRIQRGGLVQPFGCMVAIEEPSFKII
GYSENCFDMLGLKIVEPAKLKGLIGVDARTVFTPSSGDSLAKVMASRELSLLNPIWVHSR
SNHKPFYAILHRIDVGIVIDLEPANSSDPALLLAGAVQSQKLAVRSITRLQSLPGGDVGI
LCDTAVEDVQKLTGYDRVMVYKFHDDNHGEIVSEIRRSDLEPYLGLHYPAADIPQAARFL
FKQNRVRMICDCNAQPVKIVQSEELKQPICLVNSTLRSPHECHSKYMGNMGSIASLVMAV
LINTGDSMKLWGLLVCHHTSPRYVPFPLRYACEFFTQAFSLQLNMELQLASQLAEKKTLQ
MQTLLCDMLLRDVPFGIVTQSPTIKDLVKCDGAALYCGGKCWLLGVTPTEEQVKDIANWL
LVAHKDSTGLSTDCLVEAGYPGAAFLGDAVCGMATARVASNDFLFWFRSHTAKEVKWGGA
KHHPDDEDDGGKMHPRSSFNAFLEVVKSRSLPWEVPEINAIHSLQIIMRESIQEIENSSL
KTTTSSQQSGADGPSMDELSSVAMEMVRLIETATAPIFGVDPSGLINGWNEKIADLTGLH
ASEAVGRSLLNDIVHEDSHATVEKFLHRALLGEEDKNVEIKLRSFGKDPPESVIYLVTNT
CTSRDHKNDVVGVCFVAQDITPEKAVMDKFIQLRGDYEAIVQSLNPLIPPIFASDENACC
SEWNAAMERLTGWTRYEVMGRTLPGEIFGGLCHLRGQDALTKFMILFYQAIGGHDTKKLP
FSFFNRTGELVEVILTANKRTGEHGNVTGCFCFLQPTMVDPETSDERQDDKEPLSKFKEY
AYVRQQMKNPLSGIQFTHKLLEATCISDNQKQLLETSEACEKQILSVIDNMDFRAIEDGS
KVELNMKEFILGNVVDAIVSQVMIFLKEKNLQLLRDIPDQIKTLPLYGDQIKLQRVLSDF
LLTIVHHAPSPDGWVEIKVLPGLRLVQDGKELIHMQFRMAHPGQGVPAALIDAMSGGRNR
WTTEEGIALNVSQKLLNIMNGNVHYVREENKCYFLIDVELKTSKSTQVPSSEGTQETEI
NT seq 3420 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagttgcagaacagtaaaacaagaaaaggaacaacacccacaggccagaataacaaa
aacaacaaagacacttacgaagattccaccttttctgcttcctctgctgctagtcacatg
aaacataaagccaacaaggctaccatggctcagtacaatgctgatgcaaagcttatggct
gaatttgaaaagtctactgtgtctggtaagtcatttgactattcaaaatcagtgccttat
gcaccagaagatgctaatgaagaagaaatcattgcttatctttcaagaattcaaaggggt
ggtctcgtccagccatttggttgtatggttgctatcgaggaacccagtttcaagattatt
ggttatagtgagaactgctttgatatgttgggtttaaagattgttgagcctgctaagttg
aaaggtttaattggggttgatgctagaaccgtttttaccccttcttctggggattcattg
gccaaagttatggcatctagggaactttctttgttgaaccctatatgggttcattctagg
agtaaccataaacccttttatgctatacttcataggattgatgtgggaattgtgattgat
ttagaacctgctaattctagtgatcctgcattgctgctagctggggcagtccagtcacaa
aaactggctgtccggtcgataactaggttgcagtcacttcctggtggagatgtagggatt
ctctgtgataccgcggtggaagatgtgcagaagctgactggatatgatagggtaatggtc
tataagtttcatgatgataatcatggcgaaatagtgtctgagattaggagatcagacttg
gaaccttatttgggtttgcattatcctgcagcagatataccacaagctgctcgattcttg
ttcaaacaaaatagagttagaatgatatgtgattgcaatgcacagcctgttaagattgtt
cagagcgaagaactaaagcagccgatttgcttagtaaattcaactcttagatcgcctcat
gaatgccatagcaagtatatgggcaacatgggatctattgcgtcgttagtgatggcagtt
cttattaataccggtgattcaatgaagctttggggtttgcttgtttgtcatcacacttct
ccccgctatgtgccttttccacttcgatatgcatgtgaattcttcacgcaggcatttagc
ctgcagcttaatatggagctccaattggcatcacaattggcagagaagaaaactctccaa
atgcagacattactatgtgacatgcttcttcgagatgttccatttggtattgtaacacaa
tcccctactattaaggatcttgtgaagtgtgatggagctgcactttattgtggtggaaaa
tgttggttgcttggggtgacgccaactgaagaacaagttaaagatattgcaaattggttg
ctagttgctcataaggattccacaggtttaagtacggactgtcttgtagaagctggttat
cctggtgcggcttttctgggagatgcagtttgtggcatggctactgcgagagttgcttcc
aacgattttctattctggttcaggtctcacacagcaaaggaagtcaagtggggaggtgct
aagcatcatccagatgatgaagatgatggaggaaaaatgcacccgcgatcttcatttaat
gccttcctcgaagttgttaaaagcagaagtttgccatgggaggtcccggagattaatgcc
attcattctctacaaatcataatgagagaatcaattcaagagattgagaacagctcgcta
aaaactactacctcttctcagcagagtggtgctgatgggccaagcatggatgaacttagt
tctgtggcaatggaaatggttaggttgattgagacagccactgctccaatttttggagtt
gatccatctggcttaataaatggatggaatgagaagattgctgacttgacaggattgcat
gctagtgaagctgttggaaggtctctccttaatgatattgttcatgaagattcacatgca
actgttgaaaaatttctacatagagctctgttaggtgaggaggacaaaaatgtggaaata
aaactgcgaagttttggaaaagatccaccagaatcagttatataccttgtgaccaatacc
tgcacaagcagggaccacaaaaatgatgttgttggtgtgtgctttgtggctcaagatatc
acccccgagaaagctgtcatggataaattcattcagttgcgaggagattatgaggctatt
gtacaaagtcttaatccattgattccaccgatatttgcttctgatgaaaatgcttgttgt
tcggagtggaatgcagcaatggagaggttgactggttggacaagatatgaggtcatgggg
agaacacttcctggtgaaatttttggtggtctttgtcatcttaggggacaagatgccctt
accaaatttatgattcttttctaccaagcaattggtggccatgacaccaaaaagcttcca
tttagcttttttaataggacaggggagttggtggaagtgatcctaacagcaaacaagaga
actggtgagcatggaaatgtaactgggtgtttctgcttcttgcagcctacgatggttgac
ccagagacatcagatgagagacaagacgataaagaacccctttcgaaatttaaagaatac
gcttatgttcgacagcagatgaaaaatccattgagtgggatccagtttacccataaactc
cttgaagcaacctgtatttcagataatcagaaacaacttctggagacaagtgaagcctgt
gagaaacagatcctgtctgttattgacaacatggatttcagagctatagaggacggcagc
aaagtagagctaaacatgaaggaattcattctaggaaatgttgtggatgctattgtgagt
caagtaatgatttttctgaaagagaagaacttacagctgctgcgtgatatacctgaccag
atcaaaacccttcctctatatggtgatcaaattaagcttcagcgtgttctgtcagacttc
ttgcttactatagttcatcatgcaccttctccggatggttgggtggaaatcaaggtgtta
cctggtttaagacttgtacaagatggaaaggaattaattcatatgcagttcagaatggct
caccctggccaaggagtacctgctgctctaattgatgccatgtctggaggaagaaatcga
tggacaacagaagaaggaatcgcgttgaatgtttcccagaaacttctcaatattatgaat
ggaaacgtccattatgtcagagaggaaaacaaatgttatttcctaattgacgtggaactc
aaaacatcgaaatctacacaagttccgagttcagaaggaactcaagaaacagaaatctag

DBGET integrated database retrieval system