Capsicum annuum (peppers): 107873586
Help
Entry
107873586 CDS
T04646
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cann
Capsicum annuum (peppers)
Pathway
cann03015
mRNA surveillance pathway
cann03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cann00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
107873586
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107873586
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cann03041
]
107873586
Spliceosome [BR:
cann03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
107873586
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107873586
NCBI-ProteinID:
XP_016575976
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(5975730..5983138)
Genome browser
AA seq
657 aa
AA seq
DB search
MAGTYGYNDGRSAVPPTDGGSGGDRYSGSSTGGGGYGEVYGGVYGGPGGGAYGYNDGRSA
PPLADGGYAGSSGDMYSGSSGGGGGGYGGSGGRGGYGGGEHGSADAYGGYGGPGGSGGGY
GGSDGSGGGSSGGYGGSGSGGGYSGSGSGGYGGYGGSGGAYGGYGGGGGYGGSGSGGYGG
SGGSGGYGGSGGSGGYGGSGSGGYGGSGSGGYGGSGCGGYGGSGGSGGYGGSGSGGYGGS
DGGNGEYGGSGSGGYGGSGSGGSYGDYGGNGAGYGNSDRGGRKGGGYGGGSHNRGGGGYQ
GGGSGGGGRGGGRGGGTGRDGDWSCPNPSCGNLNFARRVECNKCGAPSPVGNDDRGSRGG
SSYSRGGNDGGYANNRGERGDNYDRGGGGISINGSYSGNQGRDDGGYGHRPSHGGPDNNY
PPPSNTYGGNPDYAPDAVHQPTSYSGGPTSYPPSYASTGGYGGNIHSDARGGGRGGSRGG
YDRGYGSGPRTEVGSYGSAPVEAPAMVKQCDEQCGDSCDNSRIYISNLPPDVTIEELQEL
FGSIGQVARIKQKRGYKDQWPWSIKLYTDEKGNNKGDAVLSYDDPFAAHSAGGFFNNYDF
RGYKISVSMAEKSAPKAPPAYGSGGGGRGGYGGDRRRGNYGSGPDRNFHGGNRSRPY
NT seq
1974 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggtacatacggctacaacgatgggcgatccgctgtgccaccgactgacggtggc
tccggcggcgatagatacagcggctcatccaccggcggtggtggatacggtgaagtatat
ggcggtgtatacggtggccccggtggcggagcatacggctacaacgacggaagatcagct
ccgccacttgctgatggaggatacgcaggctccagcggtgatatgtacagcggctcatcc
ggcggcggcggtggtggatatggtggttccggtggccgtggtggatacggtggcggcgaa
catggtagtgccgatgcatatggtggatacggtggtccgggcggcagcggtggtggatat
ggtggttctgatggcagcggtggtggcagtagtggtggatatggtggttctggtagtggc
ggtggatacagtggctcgggcagtggaggatacggtggttatggtggaagcggtggtgca
tatggtggttatggtggcggcggtggatacggtggctctggcagtggaggatacggtggt
tctggtggcagtggtggatacggtggctctggcggaagtggaggatacggtggctctggc
agtggaggatacggtggctctggcagtggaggatacggtggctctggctgtggaggatat
ggtggttctggtggcagtggtggatacggtggctctggcagtggaggatatggtggttct
gatggaggcaatggtgaatacggtggctcgggtagtggaggatacggtggttctggaagc
ggtggttcatatggtgattatggaggcaatggtgcaggatatggcaacagtgatagaggc
ggccgaaaaggaggaggatatggtggtggttctcataatcgaggtggtggtggatatcaa
ggaggaggtagtggtggcggtggaagaggtggtggtcgtggtggaggaactgggagggat
ggtgattggagttgccctaatcccagttgtggaaacttgaactttgctcgaagagtcgag
tgtaataaatgtggtgcaccttcacctgtgggtaatgatgatcgtggcagcagaggtggt
agcagttacagtagaggtggaaatgatgggggatatgcaaataatcgaggggaaagaggt
gataattatgatagagggggtggaggtatcagtataaatggctcgtattctggtaatcaa
ggaagagatgatggtggctatggtcatcgtccatctcacggaggccctgataacaactat
ccaccaccatccaacacttatggtgggaacccagattatgcccctgatgcagttcatcag
cctacaagttacagtggtggacctacgtcatatcctccttcatatgctagcactggtggc
tatggtgggaatatacactctgatgcccgtggtggtggtcggggtggctcgcgaggagga
tatgataggggctatggcagtggtcctcgaacagaagtaggtagttatggcagtgctcct
gttgaggctccagcaatggtaaagcagtgtgatgagcaatgtggagattcctgtgacaac
tccagaatatatatctcaaatttgcctcctgatgtcaccattgaagaacttcaagaactt
tttggaagcatcggacaagtggcgagaatcaagcaaaaacgaggctacaaggaccagtgg
ccttggagcataaagttatacacagatgaaaaaggaaacaacaaaggagatgcagttttg
tcatatgacgatccttttgcagcgcactctgctggaggctttttcaataattacgacttc
agaggttataagatcagtgtctcaatggctgagaagtctgcaccaaaggcccctccagca
tatggttctgggggcggtggtcgaggcggttatggcggtgacaggcgcagaggtaactat
ggttctggtccagacagaaactttcacggtggaaatcgttcacgtccctactga
DBGET
integrated database retrieval system
