Crassostrea angulata (Portugese oyster): 128161277
Help
Entry
128161277 CDS
T09348
Name
(RefSeq) serine-aspartate repeat-containing protein I-like
Organism
canu
Crassostrea angulata (Portugese oyster)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HSP90
DUF6721
HATPase_c_3
HATPase_c
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128161277
NCBI-ProteinID:
XP_052680491
EnsemblRapid:
LOC128161277
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(21407987..21433344)
Genome browser
AA seq
2062 aa
AA seq
DB search
MRWKTFYLGLFCVFLVAGVCSAADEEGDVTLEDDIGKSRDGSRTDDEAVQREEEAIKLDG
LNVAQMKELREKAEKHVFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRFLSL
TDKSALSATEELSIKIKADKDNHVLHVTDTGIGMTHNDLINNLGTIARSGTSEFLTKLGE
AHSQTEMSDLIGQFGVGFYSSFLVADRVIVTSKNNDDEQYVWESDSESFSVVKDPRGNTL
GRGTTISLHLKEEAHDFLEENTVKDLVKKYSQFINFPIYIWASKTEEVEEPLEEEEEKKE
EATKDEDKEEDEEGKVEEEKDEDKPKTKKVSKTVWDWELMNSVKPIWTRKTDDVSDDEYN
EFYKSISKDSEQPLARTHFTAEGEVTFKSILYVPKASPHDMFSNYGKKLESIKMYVRRVF
ITDDFEDMMPKYLSFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIKKKLVRKTLDMIKKIGK
DDYEKFWKEYSTNIKLGVIEDQSNRTRLAKLLRFYSSNSDTEQTSLPDYIERMKEKQEAI
YFVAGTSRSEVEKSPFVERLLKKGYEVLFLVEPVDEYCIQSLPEFEGKKFQNVAKEGLTI
DDSEKAKERKEAMEKEYEPLTKWLQELDSLKEKISKATVSDRLTKSPCALVASTYGWSGN
MERIMRSQAYAKQQDPSQQFYSTQKKTLEINPRHPLIKELKSRVDANADDQIAKDLAVVM
FETATLRSGFALQDSAGFAERVEHMLREAMSIPQDAKIEDEPEDDEAVEEDKPEEVGDED
EDDKFSCGSNCQPRRKLLWFGDDKDKDTDGDGIPDHLDDDDDNDGIPDSKDNDDDGDGIS
DDKEYCDKDGCKTLKDSDGDGIPDHLDDDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDGDG
IPDDKDNDDDGDGVPDNMEDTDGDGIPDHLDKDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDD
DNDGIPDSQDKDDNGNGIPDHLEVDSDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDHLDKDDKEKDTDGD
GIPDYLDDDDDNDGIPDVDDDDADGDGIPDKLEIDTDGDGIPDYLDNDDDGDGIPDSEDK
DDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDGDGIPDSEDKDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIP
DYLDNDDDGDGIPDSLDNDDDGDGITDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDSEDDDAD
GNGIPDYKEKDTDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDHLDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYL
DDDDDGDGIPDDKDNDDDGDGIPDNQEDSDGDGIPDSLDKDDDGDGIPDDQEIDTDGDGI
PDYLDDDDDNDGIPDHLDDDDDGDGIPDYKEIDTDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDSQDSDA
NGNGIPDYMEKDTDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDDQDDDDDGDGIPDSKEDTDGDGIPDYL
DNDSDGDGIPDKLPDSDGDGVPDKFDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDHDDDGDGI
PDAQDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDGDGIPDSQDNDDDGDGIPDDKQKDT
DGDGIPDYLDDDDDGDGIPDAQDNYDDGDGIPDDKQKDTDGDGIPDYLDDDDDGDGIPDS
QDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDGDGIPDSQDNDDDGDGIPDDKEKDTDGD
GIPDYLDDDDDGDGIPDAQDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDNDDDGDGIPDDKEK
DTDGDGIPDYLDDDDDGDGIPDSKDNDDDGDGIPDDKEKDTDGDGIPDYLDDDDDGDGIP
DKLDSNYDVIDKEVDTDGDGIPDYLDDDDDNDGIPDSQDADANGNGIPDFMEKDTDGDGI
PDYLDDDDDNDGIPDDEDDDDDGDGIPDDQEDADGDGIPDYLDTDSDGDGVPDKLPDLDG
DGIPDKFDKDDDGDGIPDVREGKRINPSSKVSQSKTNNPKSKTKSDDDDDDDDDDENDSQ
QSLFSRIVTAVKEMVLPSDVSSEDKSRNLKKNPNPTRIKNKGKQLKGHEEELDLVDLVKS
AFSENKDKNDNQKEKAKQRNVS
NT seq
6189 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtggaaaaccttttacctgggacttttctgcgtgtttttagtggcgggtgtttgc
tcagcagctgatgaagaaggggacgtgacattagaggatgacattggaaagagtcgtgat
ggttccaggacagacgatgaagcagtgcagagggaagaggaggcaatcaagttagatgga
ctgaatgtcgctcaaatgaaggaactacgggaaaaggcggagaaacatgtattccaggcg
gaggtcaaccgtatgatgaaacttatcatcaactccctctacaaaaacaaagagattttc
ttgagagagttgatctccaatgcttctgacgctttggataaaatccgtttcctgtcactt
acggataaatcggctctgtcagcaacagaagaactcagcatcaagattaaggctgacaaa
gacaaccatgtcctgcatgtcacagacactggaatcggtatgactcacaacgatctgatc
aacaacctcggtaccatcgcacgatccggcaccagcgagttcctgaccaaactcggtgaa
gctcattctcagactgagatgtccgatctcattggacagtttggagtcggtttctattca
tctttcttggttgctgaccgtgtgattgtgacctcaaagaacaacgatgatgagcagtat
gtctgggagtctgactccgagagcttctctgttgtgaaggacccccgaggaaacactctg
ggcagaggaaccacaattagtcttcacctgaaggaggaggctcatgacttcctggaggag
aatacagtcaaggacttggtgaagaaatattctcagttcattaacttccccatctacatc
tgggctagcaagactgaagaagttgaggagcctcttgaagaggaggaagagaagaaagag
gaagccaccaaggatgaggacaaggaggaagatgaggaaggaaaggttgaggaggagaag
gatgaggacaaacctaagaccaagaaagtctccaagactgtgtgggactgggaactgatg
aacagtgtcaaacctatatggaccagaaaaactgatgatgtaagtgatgatgagtacaac
gagttttacaaatccatctccaaggacagtgagcagcccctggctaggacccatttcacc
gcagaaggagaggtcaccttcaaatccatcctgtatgtccccaaggcctccccccatgac
atgttctcaaactacggaaagaaattggaatccatcaagatgtatgtcagaagagttttt
atcactgatgactttgaagacatgatgcccaaatacctcagctttgtcaagggagttgtg
gactctgatgatctacctctgaatgtttcccgtgagaccctgcaacaacacaaactcctg
aaggtcatcaagaagaagttggtcagaaagacactggacatgatcaagaaaatcggcaag
gacgactacgagaagttctggaaggagtactccacaaacattaaactgggagtgattgag
gaccagtccaacagaactcgtctggccaaactgcttaggttctactcctccaactctgac
acggaacagaccagtctgcccgactacatcgagaggatgaaggagaaacaagaggccata
tacttcgttgctggaaccagcaggagcgaggttgagaaatctccatttgtggaacgcctt
ctgaaaaagggatacgaagtcctcttccttgtggagcctgttgatgaatactgcatccaa
tctctcccagagtttgaaggcaagaaattccaaaatgttgccaaggaaggactgacaatt
gatgactctgaaaaggccaaggagcgcaaggaagccatggagaaagaatatgaaccattg
acaaaatggctgcaggaacttgactctctgaaggagaagatcagcaaggctacagtgtct
gacagactaacaaagtctccctgtgccctggtagctagcacctatggctggtcaggaaac
atggaaaggatcatgagatcccaagcatatgccaaacagcaggatccttctcaacaattt
tactcaacccagaagaaaactttagaaatcaaccccagacatcctttgattaaagagctg
aaatcacgagttgatgccaatgctgacgatcagattgccaaagaccttgctgtagtcatg
tttgagacagccaccctccggtcaggatttgctctgcaagactctgctgggttcgctgag
agggtagaacatatgctgagagaagccatgagcattcctcaagatgccaaaattgaagat
gagcctgaagatgacgaggcagtggaagaagataaaccagaagaggttggtgatgaggat
gaagatgacaagttttcgtgtggatcaaactgtcaaccaaggagaaaattactttggttc
ggtgatgataaggacaaggatactgacggagatggtatacctgaccatcttgatgacgac
gatgacaacgatgggattcccgatagcaaagacaacgacgacgatggcgatggaataagc
gatgacaaagaatactgcgacaaagacgggtgcaaaaccttgaaagattccgatggggat
ggaattcccgatcacctggacgatgatgatgatggcgatgggattcccgacgataaggaa
aaagacacagatggcgatgggattcctgattatttggatgatgatgacgatggggatggg
attccagacgataaagacaacgatgatgatggggacggggtaccagacaatatggaggac
acagatggagatggaatccctgatcatttggataaggatgatgatggagatggcattcca
gatgacaaagagaaggatacggatggtgacggaattccagactatctagatgacgatgat
gataatgatgggatccctgactcccaggacaaagacgataatggaaatggtattccagat
catttagaagtcgacagtgatggagatggaattccagattacctcgatgatgatgatgat
aatgacgggatccctgaccatttggacaaggacgacaaagagaaagacactgatggtgac
ggaattccagattatctagatgacgacgatgataatgatggaattcctgacgttgatgat
gacgatgccgatggcgatggtattcctgataaacttgaaattgatacagatggtgatggg
ataccagattacttggataatgatgatgatggggatggaattcctgactctgaagataaa
gacgatgatggcgacggaattccagatgacaaggaaaaagatacagacggtgacggtatc
ccggattatcttgatgatgatgacgatggagatggtattccagatagtgaagacaaagat
gatgatggggatggtattcctgatgacaaagaaaaagatacagatggagatggcattcca
gattatctcgataatgatgacgatggtgatggaattccagatagtttggacaatgatgat
gatggtgacggaataactgatgataaggaaaaagacactgatggagatggaattccagat
tacttagacgatgatgacgataatgatggtattccagactcagaggatgatgatgccgat
ggaaatggcattcctgattacaaggaaaaagacacagatggtgatggtattccagactac
ttagatgacgatgatgataatgacggaattcctgatcatcttgataatgacgatgatgga
gatggaatcccagatgacaaggagaaagacacagatggtgatggaattccagattactta
gacgacgatgatgatggtgatggaattcccgatgataaagacaacgatgatgatggagat
ggaatcccggataaccaggaagactcagacggtgatggaattccagatagcctagataaa
gatgatgacggcgacggaatacccgatgaccaagagattgacacggatggtgacggaata
ccggattatttagatgatgacgacgacaatgatgggattccagatcatctagatgatgat
gatgacggcgatggtattccagattataaagagatagatactgatggtgatggtattcca
gattatctggatgacgatgacgataatgatggtattccagatagtcaagactcggatgct
aatggaaatggcattccagattatatggaaaaagataccgacggagatggaattcccgat
tatctagatgatgatgatgataatgacggtattccagatgatcaagatgatgacgacgat
ggtgacggtattccggatagcaaagaagacactgatggcgatggtattcctgattatcta
gacaatgacagtgacggggacggtatccccgataaactgcccgactctgatggagacggc
gttcctgataaatttgataatgacgatgatggtgatggaatcccggatgataaggagaaa
gacacagatggtgatggcattccagattatcttgaccatgatgatgatggtgatggtatt
ccagatgctcaagacaatgatgatgatggtgatggtattccagatgacaaagagaaagac
acagatggagatggaattccagattacttggacgatgatgatgatggtgatggtattcca
gattctcaagacaatgatgatgatggtgatggtattccagatgacaaacagaaagacaca
gatggagatggaattccagattacttggacgatgatgatgatggtgatggtattccagat
gctcaagacaattatgatgatggtgatggtattccagatgacaaacagaaagacacagat
ggtgatggtattccagattatcttgacgatgatgatgatggtgatggtattccagattct
caagacaatgatgatgatggcgatggaattccagatgataaggagaaagacacagatggt
gatggtattccagattatcttgacgatgatgatgatggtgatggtattccagattctcaa
gacaatgatgatgatggtgatggtattccagatgacaaagagaaagacacagatggagat
ggaattccagattacttggacgatgatgatgatggtgatggtattccagatgctcaagac
aatgatgatgatggcgatggaatccctgatgacaaagaaaaagacacagatggagacgga
attccggattatttagacaatgatgatgatggcgatggaattccagatgataaagaaaaa
gacactgatggtgatggaattccagattacttggacgatgatgatgatggtgatggtatt
ccagattctaaagataatgatgatgatggcgatggaatccctgatgacaaagagaaagac
acggatggagatggaattccagattacttagacgatgatgatgatggcgatggaatacct
gataaattagatagtaattatgatgttatagacaaagaggtggatactgatggcgacgga
atacctgattatttagatgatgacgatgataatgatggtattcctgatagccaagacgct
gatgccaatggaaacggaattccagattttatggagaaggatactgatggtgatggtatc
ccggattacttggacgatgatgacgataatgatggcatcccggatgatgaagacgatgac
gatgatggtgatggcataccagatgaccaagaggatgctgatggtgatggaattccagac
tatttggatacagatagtgatggagatggagttccagacaaacttccagacttagacggt
gatggcattccagataaatttgataaagatgatgacggtgacggaattccagatgttcga
gaaggcaagcgtataaatccttcatccaaagtatctcaatctaaaactaataatccaaaa
tctaagactaaaagtgatgatgatgatgatgacgatgatgatgatgaaaacgatagccaa
caatctttattttctagaattgtgaccgccgtaaaggaaatggttttaccgagcgatgtg
tcttctgaggataaatcaaggaatcttaagaaaaatcctaatccaacacgaatcaagaac
aaaggaaaacaattaaaaggacatgaagaagaattagatctcgtagacttggtaaagagt
gcattttctgaaaataaagataaaaatgacaatcaaaaggaaaaagctaaacaaagaaat
gtgtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
