Cellulophaga algicola: Celal_2011
Help
Entry
Celal_2011 CDS
T01404
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
cao
Cellulophaga algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cao00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cao02000
]
Celal_2011
Transporters [BR:
cao02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Celal_2011
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CooC_C
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV49308
UniProt:
E6X3Y3
LinkDB
All DBs
Position
2288915..2291998
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MKYEFQKSIIFIVFLIFGFSGVAQIKVTGTVKSNDGIPLLGVTIMENGSATNGVTTDFDG
NFSIEMNNLNTELVVSYIGFVTQTISVNSSAAITVILEEDLEQLSEVVVVGYGSVKKSDL
TGSVTSVEMANIPSKPSNSIDGLLQGQVAGVQVIAASDTPGAGAVIRIRGGSSLRGGNDP
LVVVDGFPIGYAGDLKQISPQDIASMEVLKDASAAAIYGSRGANGVIIITTKKGAKHSTE
VTVSQQNTFTRFTSDLNLWRDPVLMAELSNESRTNGGFTPVYIGSRDANGVYYPSVGELK
NGDWSYNTRWDDVVFRDPVSNNTNLAIRSQTDRTQFSLSTTYYTNEGVYIEDDYEKLNIN
LNVTHKIYDDKVTIGGNVIYSKGNRNNNGGLAYWRNPIFPVYLEGNPSNDYFLAGSQDYS
HPTALTENRTNKNKFLDFIGSAFVEIQFIPTLKLKTQVNHKFGRSITDYYNPKRYTEDGT
FNNGSGGVNNWESSETVAETFLTFNDMFKEKHSFTAMAGFSYQGYEARTSDLRAYDFLNE
SLGNGNLAAGNPEKQSVANSLSETVMYSGLGRLNYSYDDKYLATFTVRTDGSSKFGANNQ
WAMFPSGALGWKLHKESFIENLNVFDEFKLRASYGISGNQGISPYLINSRYGQDQYYVNG
RWQTTIGPGYVVGQDSQSGKKTWGGIPNPDLKWETTAQFNIGADIAFLNNRVKITADYYK
KSTSDLLRERLLSPSSSYDKIWVNDGEIENQGVEVTLDGTMVNKEDWGLNGMFIFSRNKN
KVVSLGDAVSSGLNTDALTGVKYEFSGNQVEAFRAIPNILAIGQPINVFYGYKVAGIIQS
EAEGLAAGLTGDLAQPGEFKYRDLNEDGVIDENDRAIIGNPNPDFIASFNLNARYKNFDF
SLFFNSSIGQDIFNTKAFSEPSNTPLRWTQDNTTNNYPSLRDGRTVYMSDWFIEKGSFLR
LQNLSVGYTVKDLKTAWLKKGRIFMNGTNLFTITDFKGYDPELGGDGIYWGGYPKLRNWT
LGVELTF
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatgaatttcaaaaaagcataatttttattgttttcttaatttttggcttctct
ggggttgcacaaattaaggtaaccggaacagtaaaatctaacgacggaattcctttgctt
ggtgtaaccattatggaaaatggttctgctacaaatggagtaacaacagattttgatggg
aatttttctattgaaatgaacaatcttaatactgaactcgtagtttcttatataggtttt
gtaacacagactatttctgtaaacagtagtgctgcaataacggttattcttgaagaagat
cttgagcagctttctgaagttgttgttgtaggatatggttctgttaagaagagcgattta
acgggatctgtaacttctgttgaaatggctaacatcccatcaaaaccatcaaattctata
gatggcttattgcaaggtcaagtggctggtgtgcaagttatcgcagcttcagatactcca
ggggcgggcgcagttattagaattagagggggtagttctttacgcggtggtaatgatcct
cttgttgtagtggatggttttcctattgggtatgccggagatttaaagcaaatatctcct
caagatattgcctcaatggaagtgttaaaagatgcatctgctgccgctatttatggttct
agaggagctaatggtgtcattataataactacaaaaaaaggagcaaaacacagtaccgaa
gtaaccgtttcccaacaaaatacatttaccaggtttacgtccgatttgaatttatggagg
gatccagttttaatggctgagctaagtaacgagagcagaactaatggtggttttacacca
gtttatattggttctagagatgcaaatggggtgtattacccttctgtaggggagcttaaa
aatggggattggtcttacaatacacgttgggatgatgtcgtttttcgtgatccagtatct
aataataccaatctagctatacggagtcagacagatagaacccaatttagtttaagtaca
acctattacacgaatgaaggggtttacatagaggatgattatgagaaattgaacattaac
cttaatgttactcataaaatttatgatgataaagttaccattggaggaaatgttatttac
tctaaaggaaatagaaataataatggaggactggcatattggcgtaatcctatttttcca
gtttatttggaaggaaatccttctaatgattattttttagccgggtcacaagattattca
caccctactgcattaactgaaaatagaacgaataaaaataagtttttagattttattggt
tctgcttttgtagagattcaatttattccaactttaaaattaaaaacccaagtaaaccat
aaatttggtcgttctattacagattattataatcctaaaagatatacagaggatggtact
tttaataacggttctggaggtgttaataattgggaaagtagtgaaaccgttgcggaaacg
ttcttaacgtttaacgatatgtttaaagagaaacatagctttactgcaatggcaggtttc
tcataccaaggatatgaggctagaacttctgatttgagagcctatgattttttaaatgaa
tctttagggaatggtaatcttgctgcaggtaatcctgaaaagcaatctgtagcgaacagc
ttatctgaaaccgtgatgtactctggtcttggtcgtttaaattattcttatgatgataaa
tatttagcaacatttaccgtgcgtaccgatggttcttcaaaatttggagcgaacaatcag
tgggcgatgtttccttctggtgcgttaggttggaagttgcataaggagagctttattgaa
aatttaaatgtttttgatgagtttaaacttcgcgctagctacggtatttctggtaatcaa
ggtatttctccttatttaattaatagtaggtacggacaagatcaatactatgtaaacggt
cgttggcaaacaacgattggccctggttacgtagtgggtcaagatagtcaaagtggtaag
aaaacctggggtggtattcctaatccagacttaaaatgggagactacagcacaatttaat
ataggagctgatattgcctttttaaataatagagtaaaaatcacagcagattactataaa
aaatcaacctcagatttattacgcgagcgtttactttctccttcttcttcttatgataaa
atttgggttaatgatggtgaaatagaaaaccaaggggtagaagtaactttagatggtact
atggttaataaagaagattgggggctaaacggaatgttcattttctctagaaacaaaaac
aaagtagttagcctaggagacgctgtatcatctggtttaaataccgatgctttaactggg
gttaaatatgaattttctggaaatcaagttgaagcttttcgtgctataccaaacatctta
gctattgggcaacctataaatgttttttatggttataaggtagctggtattatacagtct
gaggccgaaggtttggctgcgggactaacgggtgatttggcacaaccgggagaatttaaa
tatagagatttaaatgaggatggagttattgatgagaatgaccgtgctataattggtaac
cctaatccagattttatagcaagttttaatcttaatgcgcgctataagaattttgacttc
tcgcttttctttaacagtagtattggtcaagatatttttaatacgaaagcatttagcgag
ccaagcaatacacccttacgttggacgcaagataacacaacaaacaattacccaagttta
agagatggccgtactgtttatatgtcagattggtttatagagaaaggaagttttttacgc
ttacaaaacctttctgtaggctatactgtaaaagacctaaaaacggcatggcttaaaaaa
ggtagaatttttatgaacggaacaaacctattcaccataacagattttaagggttatgat
cctgaattaggcggagacggtatttattggggaggttatcctaagttaagaaactggacc
ttaggcgtagaactaaccttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
