Cellulophaga algicola: Celal_3737
Help
Entry
Celal_3737 CDS
T01404
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain protein
Organism
cao
Cellulophaga algicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV50986
UniProt:
E6XAM4
LinkDB
All DBs
Position
complement(4273433..4277521)
Genome browser
AA seq
1362 aa
AA seq
DB search
MLLANKHFTPVLGIDIHIVILLGIPTPLPHPFIGMVMDPMDYIPFIGSTVNVNSVPKGNS
QTAGMLGTYFHIPMGGPFLMAPMIGHDSMNFFGSTTVNAEDNYFSPSGHMLMTCSDIGMP
LSLTPGKKMRPIPSMYLPTSMTIPLPMGKTVMLGGPYAPDLMGLLMGLVMSYGFGSIMKL
GGKALKKFNHSVLKKFDATEGLSKKFCKMGFEPVDLVTGRMVYDGEDFIIPGPIPIQWER
NWYSDSDYKGLMGHGFHSNYDLSLHVVQEEQTLVLRLPDGRITALPMLHIPEEEYYHREE
KLTLRYIDTYTYEIVDKNSGLTYTYKKHTPALFKPTEISNTDGFKLQLEYNSANALTTII
DGIGRVVALKLDQYNRVTNIQVTHNQKVRQLISYGYNKEGDLIRITDALDQHTLMEYENH
LMLKKTDRNGQAFYWKYDGNKTGAKCIETWGDGAILSGTLEYKKGHNIITNSLGHKTLYY
FNELNLCTQVTDPLGGNIFHEYTAFMEPYRDIDEEGNSTGYSYDAQGNLTSIHQPDGAVV
TFVYDEKDRLVLTKYPVGGAVVRSYKKDKLHAVIGTDGGVTSFDYNDKGLIKEVRDNAGN
ISELVYDDDYNLAQMYLPNEAVAEWEYDVWGRCIKTKNAAGHEESFIYDELDRVRQVVEP
DQNQILFKYNAYDEVTEMHQRNGKIKFEYTPMGSLKMREERGRKVFFNYDTEEQLRYIDN
EHGERYRFKRNSNGAIVQEIGFDGLTRYYQRDRAGKVQRVNRPQGRFTDYEYDNNGRITR
AEHSDGTWETYSYNQNGQLIEAVNLHTKVQFIRNASGAVIAEYQDGHLLKSSYDKLGNRT
KITSSLGAEIDLLRDRTGQIETMNAQVQSDETSAVEQKAIKANPWTANFAYNSIGMEVER
VLPGGIVASKKYDEAGRPIQHTVTRGRNEMRYRTYKWNANDRLTKMVNELTEGIVTYSYD
NFGSLAACKYENHDIDYKLPDEVGNLYRIKGQNDRKYNAGGQLAEANGVKYTYDEEGNLT
RKITAKGDWNYEWYGNGMLKAVERPDQRTISFEYDALGRRTAKIDQPKFGSQGTITRFIW
DGSVPLHEWNYELKNRPELVVDEFGLLTQSTPEPIDNLITWVFDENTFKPSAKITAEDTY
SIITDYLGTPVEMYDSKGEKTWQVEYDIYGKVRKLVTGSLADCPFRYQGQYEDVETELYY
NRFRYYSPDTGTYISQDPIGLASGEPNFYAYVPDVNSMIDVFGLSYGDLGKLNSKLSALE
KASSNAANTRVLPDGRTRYYGAERASRTPGPTRGASYVTEYDPKTGNVRSWMESYDHSGK
VNRVHPKMVNGVQVDLPHYPPTKADIDAGKATPSGKAIKGCH
NT seq
4089 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattagccaacaagcattttacacctgtattaggaatagacatacatatagtaatt
cttttagggatacctacaccgctaccacacccatttataggtatggtgatggatcctatg
gattatattcctttcattggttctacagtaaatgtaaatagcgtacccaaaggaaatagc
caaacagcaggaatgctgggtacttattttcatattcctatgggaggtccttttttaatg
gcaccaatgattgggcatgattctatgaacttttttgggagtacaacggtgaatgctgaa
gataattatttctctccttctggtcatatgttgatgacctgtagtgatattggtatgcca
ctatcgctaacacctggaaaaaagatgagaccaatacctagcatgtatttacctacctca
atgaccatacccttacctatggggaaaacggtaatgcttggcggtccctatgcaccagat
cttatggggttattaatgggactagttatgagttatggctttggttcaattatgaaatta
ggcggtaaagccttaaaaaaattcaatcattccgttttaaaaaagtttgatgccacagaa
ggcttaagcaaaaaattctgtaaaatgggctttgagcctgtagatttggtaacagggcgt
atggtatatgatggggaagattttattattcctggcccaatacctatacaatgggaacgt
aattggtattcagactctgattataaaggacttatgggacatggttttcatagcaattat
gatctttctctgcatgtagttcaagaagaacaaactttggttttaagacttccagatggg
cgcattaccgccttaccaatgttgcatattcctgaagaagaatattaccaccgggaagaa
aaacttacactgcgttatattgatacatacacttatgagatagtagataagaacagcggt
ttaacctacacttataaaaagcatactcctgccctatttaagccaacggaaattagtaat
acagatggttttaagttgcaattagagtataatagtgccaacgcacttactactataatt
gatggtataggcagagttgtagccttaaaattagaccaatacaaccgtgtaaccaatata
caagttacccataaccaaaaagtaagacaattaatctcctatggttacaataaagaaggt
gatttaattagaattactgatgctttggaccaacatacgcttatggagtatgaaaaccat
ctaatgctcaaaaaaaccgatagaaatggacaagcattttattggaaatacgatggtaac
aaaacaggtgcaaaatgtatcgaaacttggggagatggtgctattctttctgggactttg
gaatataaaaaagggcataatattataaccaattctttaggtcataaaaccctctactat
tttaatgagctaaatttatgtacccaagttacagaccctttgggaggcaatatttttcat
gaatatactgcatttatggagccttatcgcgatattgatgaagaagggaatagtaccggc
tatagttacgatgctcaaggaaatcttaccagtattcatcagccagatggggctgtagtt
acttttgtttatgatgaaaaagatagattagtacttaccaaatatcctgtaggcggcgcc
gtagtccgctcctataaaaaagataaattacatgctgtaattggtactgatggtggggtc
acctcatttgattataatgacaaaggattaattaaagaagtgcgagataatgccggaaat
atttcagagttagtctatgacgatgattataatttagcacaaatgtatctgcccaatgaa
gcagttgccgagtgggaatatgatgtatggggacgctgtataaaaacaaaaaatgccgca
ggccatgaagaaagttttatttatgatgagttagaccgcgtacggcaagtggtagagcca
gatcaaaatcagattttattcaaatacaatgcctatgatgaagttacagaaatgcaccaa
cgcaatggcaagataaagtttgagtacactcctatggggagtttaaaaatgcgggaagaa
cggggcagaaaagtattttttaattatgataccgaagagcaattacggtatatagataat
gaacatggtgaacgttaccgttttaagcgtaatagcaatggtgctattgtacaagaaatt
ggttttgatggcttaactaggtattatcaacgagaccgtgcaggtaaagtgcaacgtgta
aacaggcctcaaggcaggtttaccgattatgaatatgacaataacggacgaattacccgt
gccgaacatagtgatggtacctgggaaacctatagctacaaccaaaacggtcaattaatt
gaagcggtaaacctgcacacaaaagtacaatttatacgcaatgccagcggcgcagtcatt
gctgaataccaagatgggcatttgttaaaaagcagctatgataaattaggaaaccgtact
aaaataaccagtagccttggtgcagaaatagacttattaagagatagaacggggcagata
gaaacaatgaatgcacaagtgcaatcagatgaaactagtgctgtagagcagaaggctata
aaagctaatccttggactgctaattttgcttacaactctattggtatggaggtagaacgg
gtattacctggtggaatcgttgcttcaaaaaagtatgatgaagccggcagacctatacaa
catacggtgacccgtgggcgtaatgaaatgcgctaccgaacctataaatggaatgctaat
gataggctaaccaaaatggtgaatgaacttacggaaggaattgttacctatagttatgat
aattttggaagtttagctgcttgcaaatatgaaaatcatgatattgattacaaattacct
gatgaagtaggtaatttgtaccgtatcaaagggcagaatgaccgtaaatacaatgcagga
gggcaattagcagaagccaatggtgtaaaatatacctatgatgaagaagggaatttaacc
cgtaaaattactgcaaaaggagattggaattacgagtggtatggcaacggaatgctaaaa
gcagtagaacgcccagaccaaagaaccattagttttgagtatgatgccttaggcaggcga
accgcaaaaattgaccaacctaaatttggcagtcaagggacaattacccgttttatttgg
gatggcagtgtacccttgcatgaatggaactatgagctaaaaaacagacctgaattagtt
gttgatgaatttgggttgttaacccaaagtacccctgaacccattgataatttaattaca
tgggtctttgatgaaaacacctttaaaccctctgctaaaattacagcagaagatacctac
tctattattacagattacttaggtacacctgtagaaatgtatgatagtaaaggtgaaaaa
acgtggcaggtagaatatgatatttacggaaaagttcgtaaacttgtaacgggttcattg
gccgattgcccttttaggtatcaggggcagtatgaagatgtagagactgagttgtattat
aataggtttagatactactcaccagatacgggaacttatatctctcaagacccgattggg
ttggcttcgggagaacctaacttctacgcttatgtacccgatgtaaattcaatgattgat
gtttttggattaagttatggagatttaggcaaacttaacagcaaattaagtgcgttagaa
aaagcttcatcaaacgcagctaatacgcgagtattacctgacggaagaacacgttattat
ggagcagaaagagcatctcgtactcctggacctacaagaggagcgtcttatgttactgaa
tatgatccaaaaacaggaaatgttcgttcttggatggaaagttatgaccattcaggaaaa
gtcaatagagttcacccaaaaatggttaatggagttcaagtcgacttaccacattatcca
ccaacgaaagctgatatagatgcaggaaaagcaacaccttcaggaaaagcaataaaagga
tgtcattag
DBGET
integrated database retrieval system
