Cellulophaga algicola: Celal_4219
Help
Entry
Celal_4219 CDS
T01404
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
cao
Cellulophaga algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cao00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cao02000
]
Celal_4219
Transporters [BR:
cao02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Celal_4219
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV51461
UniProt:
E6X478
LinkDB
All DBs
Position
complement(4812011..4815133)
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MNLKTKLLLIAITLLNISLYAQDSYQLKGVVSDANNVPIPGVSVVVATTTRGTATDFDGN
YEITVKKGDIISFSSIGYGNKKVTISNQQTVNVSLTEDASLLEEVVVVGYGTQKKSTITG
SISKVTNETLDQIAVSRVDEALIGQVSGVNIQSTNAEAGGAPTITIRGVGSVTADSGPAL
VIDGVVVSSDFLGNLDMNDVESFEVLKDAASAAIYGSEGSNGVILITTKSGKSGKTKFSY
QTYTGFKEAHGSDDYSQTVAGWAAIEQAATGTLTNETQYAQLLVATTGVDRSWQDVFFDG
GNVTSHSLSARGGSEDTKFSTSLRYLHDEGVVITDDYKLFSANMKVDSKIGDKVRFGIRA
TPSYTKQRTLPTSIHNPIRQSPWLPIYHTEESLQFVNRNSPTDDYYFPDVQVGDYFREEH
LRELDVNGDGDASRPRTSGDSNPYAQYVEREHFEYNTKLFGSTYLSYELADGLTAKTSLG
VTLEQRKRTRYDGTLYHASGASNSAYYLANRFRTRIISDNTLDYSKTFNDDHDLNVLVGA
SIQKRKSEESITTGSGFSNDLLKNFQGATLVDLPSETNTELKKLGYFARVNYSYAGKYLL
NASIRRDGSSVFGIASKWGNFPAVSIGWNAAKENFLLDSEAVNTLKFRASYGLTGAENFN
VGDDVVNAWPYLALLQNSNSIDEGSIAAGVSPLNIANALLQWEASKELTIGLDYGFLQNR
ISGSLDYYKRTSDELLLNNPVSYITGFNSGIVNLGEVQNSGFELEVRTRNITGEKFSWNS
TFIASTNKNELLSFGDSNNALIEDDYGRNSQWINRIGEPISSFWGYVVDEEAFDETSFRT
TYVDNPWNRINGQSDDTIVKDLNGDGLITEEDKTILGNPYPDLVYSFTNEFKLGDFDFSF
MVQGSLGAQVNNIGDQYFYNWFGNRTRSGGELEAVADGLVSDVSFIQEKVLTSEVIASAD
YFSLRNVNLGYNFPNDVTDQIGLEGLRIYATAQNLIYVTADDYHGFNPEHVDGSNPRAYG
SQRAGTPIYKTVTFGVNIDF
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttaaaaactaaactattattaattgcaataacattgcttaatatttcgctttat
gcgcaggacagctaccaactgaaaggtgttgtttctgacgcgaataatgttcctatccca
ggagtaagtgttgttgtagctaccacaacaagaggtactgctacagattttgatggtaat
tatgaaataactgttaaaaaaggagatataattagcttttcttctataggctatgggaat
aaaaaagttactatatctaaccaacaaaccgtaaatgtatctctaactgaggatgcaagt
ttattagaggaagttgttgtggtagggtatggtactcaaaagaaatctaccattacaggt
tctatttctaaggtgacaaatgaaactttagatcaaatagctgtttcaagagttgatgaa
gcgcttatcggtcaagtttcaggggtaaatattcaatcaacaaatgcagaggcgggtggc
gctccaaccattactattagaggtgttggatctgtaacagctgattctggtcctgcatta
gttattgatggagttgttgtgagttcagattttcttggaaatcttgatatgaacgatgta
gaatcttttgaagttttaaaagatgcagcttctgctgccatttatggtagtgaaggttct
aatggtgtaattttgattactactaaaagtggtaaatcaggaaaaacaaaatttagctat
caaacgtatacaggttttaaggaagcacatggtagtgatgattatagtcaaactgttgct
ggctgggctgcaatagaacaagcagcaactggtacactgactaatgaaacgcaatatgcg
caattattagttgctactactggagtagatagaagttggcaagatgttttcttcgatgga
ggaaacgttactagtcattccttatcagcgagaggtggttctgaagatactaagtttagt
acctctttaagataccttcatgatgaaggtgttgtaattacagatgattacaaattattt
tcggcgaatatgaaagtagattcgaaaattggtgataaagtaagatttggtattagggcg
acgccatcttatactaagcagagaactttgccaacgtcaatacataatccaatacgtcaa
tcaccttggttacctatttatcatacagaagagtcactgcagtttgttaatagaaactcc
cctactgatgattactattttccagatgttcaagtaggtgattattttagagaagaacac
ttgagagaactggatgtaaatggtgatggagatgcaagtagacctcgtacttctggtgat
tcaaacccatatgcacaatatgtagagagagagcattttgagtataatacgaaattattt
ggctctacttatttaagctacgaacttgcggatggccttacggctaaaacatcattaggt
gttactttggagcaacgaaaaagaacaaggtatgacggcacattgtaccatgcgagtggt
gctagtaattcagcatattatttggccaacagatttagaactagaatcatttccgataat
accttagactattctaagacatttaatgatgatcatgatttaaatgtattagttggtgct
tccattcaaaaaagaaaatcggaagaaagtattactacaggtagtggtttttctaatgat
ttacttaaaaactttcaaggtgctactttagttgatttaccttcggaaacaaacacggag
ctaaaaaagttaggatattttgctagagttaattattcatatgcgggtaaatatttactt
aatgcatctattagacgtgacggtagttccgtttttggaatagcatctaaatggggtaat
tttcctgcggtatctataggttggaatgctgctaaagaaaatttcttattggatagtgag
gcggtaaatactttaaagtttagagctagttacggacttactggagctgagaattttaat
gtaggtgatgatgttgtaaatgcttggccttatttagcattattgcaaaattctaattca
attgatgagggtagtattgctgctggtgtttctccactcaatattgcgaatgcgttattg
caatgggaagcttcgaaagaattgactattggacttgattacggatttcttcagaataga
atatcaggatctttagattattataaaagaacaagtgatgagttattattaaataatcct
gtttcatacattactggtttcaatagtggtattgtaaatttaggtgaagtacaaaactca
ggatttgaactagaagtgagaactagaaatataaccggcgaaaaattctcttggaattct
acattcatagcttctaccaataaaaatgagttattaagtttcggtgattctaataatgca
ttaattgaggatgattatggtagaaattctcaatggatcaacagaataggtgagccaata
tcctctttttggggttatgtggtagatgaagaagcttttgatgaaacttcttttagaaca
acatatgttgataatccttggaatcgaattaacggtcaatctgatgatactatcgtaaaa
gatttaaatggtgatggtttaattacagaggaagacaaaacaattttaggtaatccttat
ccagatttagtatatagttttactaatgaatttaagttaggtgattttgatttttcattt
atggttcaaggtagcttaggtgctcaagtgaataatatcggagatcaatatttctacaat
tggtttggaaacagaacaagaagtggaggagaattagaagcggttgctgatggtcttgtg
tcagatgtttcttttattcaagaaaaagttttaacaagtgaagtcattgctagtgcggat
tatttttcattacgtaatgtaaaccttggctataactttccaaatgatgtaacagatcag
ataggtttagagggcttaaggatttatgctacggctcaaaacttaatttatgtaactgca
gatgattatcatgggtttaaccctgaacatgtagatggtagtaatccaagagcatatggt
tctcagagagcgggtacacctatatataagacggtaactttcggtgtgaacattgacttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system