Capnocytophaga sp. H4358: CGC49_02485
Help
Entry
CGC49_02485 CDS
T05519
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
caph
Capnocytophaga sp. H4358
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Hanta_Gc_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATA72274
LinkDB
All DBs
Position
complement(584525..587368)
Genome browser
AA seq
947 aa
AA seq
DB search
MIINVLLKEEAEQLEEVVVTALGIKRQEKSLSYATQTVSGKELTDVPSSNVLNTLAGKTA
GMSVSGSGSGVGSSVKIVLRGNRSIQGNNQPLYVVDGTPISSGAFSGSAIGDGYGGGIDT
GDGMAGINPEDIESINVLKGATAAALYGSQAANGVILITTKRGNSEKIAVSVTSSVQADV
PYLTYKFQDRYTMGVDGVSQSSMDAWGAPRTNQDLSNDFVKNFFNTGFMSQNGVSVSGGN
KVTKNFLSYQNTTATGIMPNNTFDKHNLSLRSTTSLFDDFIEVDGSVALTHQDTGNAPAA
PGQYFNPILGLYLFPAGTTAFNSYRDVYEVPDPSRNGLMTMNWANQIDVYKNPYWLINRH
NYSYNVEKAIVKLNTKFNFTSWLNLQLRGSYDKTATLGERKVHAGMTTLTGKGGRYDHKT
QNYALMYADALLTANKSYEKFSISATLGTSISDTKETTNEIQIHNLAIANLFDLRNYIGI
EGGSDNKRTHRQLQSVFGTVSLGYNEMLYLDVTGRNDWSSTLPANNRSYFYPSVGTSFVF
TEMLDQNEAKPEWLDFGKLRFSWTQVGNDMPWGLTEPYDKLQKGGVIEANTVKPFDDLKP
ERSNSLEAGVNLRFLGGRFTFDAAVYKTVTENQYFKVDNTSGSGYSQYYINAGEVENKGF
ELTLGFTPIKTNDFQWNGYLNYSTNKNTVLSLPSQYLDKGFEISSVGYRFRLKEGEEWGR
MYEKRLKRDNQGNILLTQTIENGVDKGIQLQQSDDFEYIGNVNPKFLIGFKNEFSYKNFS
LGLLIDGRFGGNVISSTQNILDRFGRSQRSAEARDNGGIPLTGTLVTTTKVTGSPDVVTQ
TAFNQKIDAQTYYKVAPAGETSVYSATNVRLRELSLSYTLPKSLVERIKYVESVRLSLIG
RNLGFFYNEAPYDPEITLSTSSNGLSNADLFSMPASRSIGFSMNINF
NT seq
2844 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgataatcaacgttttactaaaagaagaggcagagcaattggaagaagtggtggttacg
gccttgggtatcaagcgacaagaaaaaagtttgtcgtatgctacacaaactgtttcaggt
aaggaattgacggatgtcccttcgagcaacgttttgaacactttggcaggaaaaacggca
ggtatgtctgtttcaggttcaggttcaggagtaggtagctctgtaaaaatagtgttgcgt
ggtaatcgttctattcaagggaacaaccaacctctttacgtagtggatggaacgcctatt
agcagtggagctttttcaggttctgctattggtgatggctacggcggaggtattgatacc
ggagacggtatggcaggtattaacccagaagatattgagagtatcaacgttttaaaaggt
gctacagctgcggccttgtacggtagtcaagcagctaacggtgtaattttgattaccact
aaaagaggtaattctgaaaagatagcagtgtcagttacttcttctgttcaagcagacgtt
ccttatttgacttataaattccaagatcgttatacaatgggagttgatggtgtgagtcaa
tcatcaatggatgcttggggagcgccacgtaccaatcaagatttgagcaatgattttgtg
aaaaatttcttcaacacaggattcatgtcacaaaatggggtttctgttagcggagggaat
aaagtgactaaaaattttctttcctatcaaaatactaccgcaacaggtattatgcctaat
aatacgttcgataaacataatttgagtttgcgttctacaacttctctttttgatgatttt
attgaagtagacggaagtgttgcacttacgcatcaagatacaggaaatgcacctgctgct
ccaggacagtattttaaccctatcttaggattatatcttttccctgcaggaacaacagca
tttaattcatacagagatgtttatgaagtgcctgatccttcacggaatggcttaatgacc
atgaactgggcaaaccaaatcgatgtttataaaaacccatactggttaatcaatcgtcat
aattattcatacaacgtagagaaagcgattgtaaaattaaatactaaatttaattttaca
agttggttaaatcttcaattgcgaggaagttatgataaaacagctactttaggagaacga
aaagtacatgcaggaatgactaccctaacaggaaaaggaggtcgttatgatcataaaacc
caaaattatgctttgatgtacgcggacgctcttttgactgcaaacaaatcatatgaaaaa
ttctcaataagtgccacattagggacaagtatttctgatacaaaagagactactaatgaa
atccaaattcacaacttggcaatagcaaatctttttgacttgagaaactacattggaata
gaaggaggttccgataataagagaacacatagacaattgcaatctgtattcggaaccgtg
tcattaggttataatgaaatgctttatttagatgtgacaggacgtaatgactggtcttct
actttacctgccaacaatagaagctatttctatccatcagtaggtacatctttcgttttt
acagaaatgttggaccaaaatgaagcaaaaccagagtggcttgatttcggtaaacttcgt
ttctcttggacacaagtaggtaacgatatgccatggggattaacagagccttatgacaaa
ttgcaaaaaggaggggttatcgaagctaataccgtgaaacctttcgatgatttaaaacca
gaacgctctaattctcttgaggcaggggtcaatctaagatttttgggtggacgctttact
tttgatgccgctgtatataaaacagttactgaaaatcagtactttaaggtagataacacc
tctggttcggggtattcacaatactacatcaatgctggagaagttgaaaataaaggattt
gaacttactttaggtttcactccaatcaaaacaaatgatttccaatggaatgggtattta
aactattcaaccaacaaaaatactgtactttcattgccatctcaatatttggataaagga
tttgaaatatcgtctgttggttatagattccgtcttaaagaaggagaggaatggggacgt
atgtacgaaaaacgtcttaaacgagacaatcaaggaaatattcttcttacgcagactatc
gaaaatggtgtagataaaggaattcaattgcaacaaagcgatgattttgagtatatcgga
aacgttaatccaaaattcttgataggatttaaaaatgagttttcatataaaaacttttca
ttaggattgttaattgatggacgttttggaggaaatgtcatttcatcaacacaaaacatc
cttgaccgtttcggacgtagccaacgttcagcagaagctcgtgataacggaggtattcct
ttaacaggaacacttgtaactacaacaaaagtaacaggaagcccagacgtagtaacacaa
acagctttcaatcaaaaaatagacgctcaaacttactacaaagtagcacctgcgggagaa
acttcagtttattcagcaactaatgttcgtttaagagagctttcactgtcttacactctt
ccaaaatcacttgtagaacgtatcaaatacgtagaaagtgttagattgtctcttatagga
cgtaatttaggtttcttctacaacgaagctccttacgaccctgaaattacactatcaaca
agtagtaacggattgtctaatgcagacttattcagtatgcctgcttcacgaagtatagga
tttagcatgaatattaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system