Capnocytophaga sp. oral taxon 902: HW278_09055
Help
Entry
HW278_09055 CDS
T08773
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
capo
Capnocytophaga sp. oral taxon 902
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLF50826
UniProt:
A0A7H8YTJ6
LinkDB
All DBs
Position
2098972..2101998
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MKVKISMLMFVFALFSGALMAQTKVTGTVTGSDGMPLPGVSVVIKGTTRGVSTDFDGKYE
LQAAANETIEYSFLGYSTLQRKVTKASGTLTLDVVLQEEAQQLGEVVVTALGIKRQEKAL
SYNVQQVKSEELTKVKDVNVVNSLNGKVAGVNIQRSSSGVGGSTKVVMRGLKSLDGNNGV
LYVIDGVPLFNKQSDGGGNNFGRPGGGEGISDINPEDIESINVLTGPSAAALYGSEAANG
VILINTKKGKEGKTEVNLSSSVELMTPILLPEFQNTYGSNGDKSWGAKLATPSTFEPRKF
FNTGTNFMNSVTFSTGNAQNQTFVSAAQTNAEGLIPNNAYYRYNVGVRNTANFAKDKLHL
DVSGNFIRQGSRNMMAGGGYFNPLVGLYLMPRSMDYRDVQAYERYNPSRGIYERYQPYSD
RVDSYFSENPYWVANRELFLNNKKRYMMSASLKYDILDWLNVTGRVRLDNDYGTAEEKLY
ASTTNFLIGWKTEWGPNNNGSYANTQTKDEQTYADIMFNVNKNFGEKFSLTANVGSSYND
RYSTGLSARGVLFRLPNLFSTTNFDPQRGGSGQSYSRAKNVAVFASAELGYKGMLYLSAT
GRNDWSSQLVNSAEPSFFYPSVGLSAVISQMAKLPEFINYLKVRGSYTEVGSPISKTGIT
PGTITHELTADGLKTNKVYPYPEFKAERTTSWEAGLNTKLFGNSLSVDLTLYKSNTYNQF
FEQQLSASSIYSSFYLQAGNVENRGIELSVNYNKEFLNKELNWNSTLTYSRNVNEIKELV
RGYRNPFTGELFDITEVRKGSTVLREGGSMSDVVVRGVLLRDVNGDLIEEASQYKFDKTQ
EVKLGRSTPDFQMGWRNTLSYKGIDLSFLFNGSFGGIVLAGTQPMLDAYGVSKASADARD
NDGVVVNGKKYDAQKYYNTIKDLPGYYSYDATNVRLQEVSLNYTIDGKHFWDKVKSVTIG
AIGTNLWMIYNKAPFDPQLTYGVGTYATTEFFMTPSAATYGASLKIKF
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaaaatatcaatgctaatgttcgtttttgcattgtttagcggtgcgctaatg
gcacaaacgaaagtaactggtacagttacaggcagtgatggtatgccactgccaggtgta
agtgttgtgattaaaggtacaacacgtggtgtttcaactgactttgacgggaagtatgaa
ctacaagcagctgccaatgaaactattgagtacagcttcttggggtatagtactctgcaa
agaaaggttacgaaagcgagcggtactcttactttagatgtggtgttacaagaagaagca
caacaacttggtgaagtagtggtaaccgctttgggtatcaaacgccaagagaaagccttg
agttataacgtacaacaagtgaagtcggaagaacttaccaaagtgaaagacgtgaacgtg
gtaaatagcctcaacggtaaagtagcgggggtgaatatccaacgtagctcttctggggta
ggtggttctaccaaagtggtaatgcgtggtctcaaatcattggacggtaataacggtgtg
ctctatgtgattgatggggtgcctttgttcaacaaacaaagtgatggcggaggtaataac
ttcggtcgtccaggtggaggagaaggtatttcagatatcaaccctgaggatatcgaaagt
atcaacgtacttacaggtccttcggcagcagctttgtacggtagtgaagccgctaacggg
gtaatccttatcaacactaaaaaaggtaaagaaggtaaaactgaagtaaacctatccagc
agtgtagagttgatgactcctatattattacctgaattccaaaatacttatggtagtaat
ggtgataaaagctggggagctaaattagcaacaccttctactttcgaacctcgtaaattc
ttcaatacaggtacaaactttatgaactctgttaccttctctacagggaacgctcaaaac
caaacttttgtatcggctgcacaaaccaatgccgaaggtctcattcctaacaacgcttac
tatcgttacaacgtaggggtgcgcaataccgctaattttgctaaagataaattgcactta
gatgtaagtggtaactttatccgccaaggtagccgtaatatgatggcgggaggtggttat
ttcaaccccttagtaggtttgtatttaatgccacgcagtatggattatcgcgatgtacaa
gcttatgaacgctacaacccttcaagaggtatttatgaaagatatcaaccttattctgat
agagttgacagttacttctccgaaaacccttattgggtagcgaatcgagaactcttcttg
aacaacaagaaacgctatatgatgtcggcttctttgaaatacgatatcctcgattggttg
aacgttacagggcgtgtgcgtttagataacgactacggtactgctgaagaaaaactatat
gccagcactaccaacttcttaatcggttggaaaactgaatgggggcctaacaacaacggt
tcttatgctaatacccaaactaaagatgagcaaacttatgccgatataatgtttaacgtc
aataaaaactttggcgaaaaattctctttaacagctaacgttggttcaagttataacgac
cgttatagcacaggtctttcggcaagaggcgtgttgttccgtttgcctaacctcttctca
acaactaacttcgaccctcaacgaggaggctcaggtcagagctattctcgcgctaaaaac
gtagcggtattcgcaagtgccgaacttggctataaaggtatgttatacctctcagctaca
ggtcgtaacgactggtcttcacaattggtaaactctgccgaaccttcattcttctatcct
tcagtagggctttccgcagtgatttctcaaatggcaaaattgcctgagtttatcaactat
ttgaaagtacgtggttcatatactgaggtaggttctcctatcagcaaaacaggtattact
ccaggtactattactcacgaacttactgccgacggcttgaaaactaataaggtatatcct
tatccagaatttaaagctgaacgcactacttcttgggaagctggtttaaataccaaattg
ttcggtaatagcttgtcagtagatttgactttgtacaaatctaacacttataatcaattc
tttgaacaacaattgtccgcttcttctatctactcttctttctatttgcaagcaggtaac
gttgaaaaccgcggtattgagttgtcagtaaattacaataaagaattccttaacaaagaa
ctcaactggaattctactcttacctattcacgcaatgtgaacgaaataaaagaattagtt
cgcggttaccgcaatcctttcactggtgaattatttgatattacagaagtgcgcaaaggt
agcactgtattgcgcgaaggcggtagtatgtccgatgttgtagtaagaggtgtattgctc
cgcgatgtgaacggtgatcttatcgaagaagcttctcaatacaaatttgataaaactcaa
gaagtaaaattaggacgttctacccccgatttccaaatgggatggcgcaacaccctttct
tataaaggtatcgatttgagcttcttgttcaacggtagctttggaggtatcgttttagca
ggtacacaacctatgctcgatgcttatggagtatcaaaagcttctgccgatgctcgtgat
aatgatggagtagtagtgaatggtaaaaaatacgacgctcaaaaatactacaataccatt
aaagaccttcctggttattactcttacgacgctactaacgtacgtctccaagaagtatca
ctcaactatactatagatggtaaacacttctgggataaagtgaaaagcgtaacgattggt
gccattggtactaacctttggatgatttacaacaaagctcctttcgaccctcaacttact
tatggtgtaggtacctatgctactactgagttctttatgactccaagtgcagctacttac
ggtgcgagcttgaaaattaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
