Capnocytophaga sp. oral taxon 902: HW278_11810
Help
Entry
HW278_11810 CDS
T08773
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
capo
Capnocytophaga sp. oral taxon 902
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
LysM1_NFP_LYK
Peripla_BP_6
ANF_receptor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLF51334
LinkDB
All DBs
Position
2741526..2743454
Genome browser
AA seq
642 aa
AA seq
DB search
MKQLFTLALLLCLGVAYAQPQTYTANNYESIENIAKTYRFSPADILKLNPGLKDGVQKGM
TINIPISKVKHYNTQRPVGFTTHLVKGGETFFGLSQKYNITIDDLKRYNLDLYIRELQEG
ERITIPLFSKTAEMVQKSVQGQKRYVVKPQETLWRIAKNHNVSVEELEKLNKNEKGFNPN
SIREGQEIWVPASSTDSTEPEPPARPNTKKEVVLYLVERGEGFYSLERKFGLSEAELVKL
NPSLKDGLKSDAQIWIPKENYEHYKSASQNNTANYNFQNSNNTLRSASSPANVKEISYIL
PFKLSDVSTGQIAIIKSRLTENKLTPVATDFYSGALIALDSLQKMGYKFKVNVYDSEGDL
KKIASNASVQNSQVVIGPFTTKSFNTLASLVTSNNTILLAPLSNKNITLNPNVYQTLPND
EVLQAQMIDYLNKNYSDENMIILADSKNSSLREKLERSFPNAKVVTEMSANGFVNALNYN
KENVVLLQSNDIGYVSMAVRLLHNALKSKRNNTFPKIMLATVDRGSVYDSNNLSNNQLSD
LRFTYPTVNKYSNGTDSFSARYLKTYGILPNKYAIRGFDLTMDAVLRLGVSGNLTSANTR
IGETSYLENKFAYLKNAYKGGGYENQGVYIVQYDNMEVKELK
NT seq
1929 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaactttttacattagctttgttattgtgcttaggagttgcctatgcacaaccg
caaacgtacacagcaaataactatgaaagtattgaaaatatagctaagacctatcgcttt
tcgcccgctgacatcttaaaactcaatccagggcttaaagatggagtacaaaagggaatg
accattaatattcctattagtaaagtgaagcattacaatacccaacgtcctgtagggttt
acgactcacttggtaaaagggggtgagactttctttggtctgtcgcaaaaatacaacatc
actattgatgatttaaagcgttataatttagacctctatataagagagttacaagagggt
gagcgtattactattccgctatttagcaaaacagctgaaatggtacaaaaaagcgtacaa
ggacaaaagcggtacgtagtaaaaccacaagaaacgctttggcgcattgctaaaaaccac
aatgtgagtgtagaggaattggaaaagctgaacaaaaacgaaaaaggtttcaaccctaat
agtataagagaagggcaagaaatctgggtgccagcctcttctaccgatagtacagagcct
gaaccaccagctcgccctaatactaagaaagaagtggtgctttatcttgtggagagaggg
gaaggattttacagcttagaacgtaagtttggtttatcggaagctgaacttgtgaaacta
aatcctagtcttaaagatggattgaaaagcgatgctcaaatatggataccaaaagagaat
tacgaacactataaaagtgcttcacagaataatacagcaaactacaactttcagaattct
aacaataccttgcgttcagcatcttcaccagccaatgtgaaggagatatcttatatttta
ccttttaaactatcggatgtcagcactggccaaattgctattataaaatctagacttact
gaaaataaactaactcctgtggctactgatttctattcaggagctctaatagctttggac
tctcttcaaaaaatgggatataagtttaaagtgaatgtatacgatagtgaaggtgactta
aagaagatagcttctaacgcctcagtacagaactcacaagtagtaataggtccttttacc
accaaatcgtttaatactttagcatcattggttacaagtaacaatacgatattattagcc
cccttatctaataagaatataactctcaatcctaatgtgtatcagaccttaccgaacgat
gaggtgttacaagcacaaatgattgactatctgaataaaaactattcagatgagaatatg
attatcttagctgatagcaagaatagttctttgcgtgagaaattagagcgttcattccct
aatgctaaggtagtaaccgaaatgtcagctaatggatttgttaatgctctaaactacaac
aaggaaaatgtagtgttattacagtcgaatgatataggttacgtgtcgatggcagtgcgt
ttgttgcacaatgcgcttaaatctaaaaggaacaataccttccctaagattatgttggcg
actgtggatagaggttcagtatacgattctaataatctttctaacaaccagctatccgat
ttacgttttacttatcctactgtaaataaatattctaatggtacagatagtttttctgcg
cgatatttaaagacttatggtattctacctaataagtatgctattcgcgggtttgacctt
actatggatgctgtattgcgtttgggagtatcgggtaatcttaccagtgccaatacacgt
ataggggagacttcttacttagagaataaatttgcctacctaaaaaatgcttataaggga
ggtggctatgaaaaccaaggcgtatatattgtacagtatgacaatatggaagtaaaagaa
ttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system