Capnocytophaga sp. H2931: CGC52_02435
Help
Entry
CGC52_02435 CDS
T05889
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
capq
Capnocytophaga sp. H2931
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
OMP_b-brl_3
TTR_TEN1-4
MetallophosN
Hanta_Gc_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATA74398
LinkDB
All DBs
Position
complement(577501..580617)
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MKVKILTLFIFVLGWCSSSLLAQTVSVKGVVTDENKIPLAGVSVSVKNTSRGVSTDFDGN
YEIKVNSGDVLVFSSLGFTSQEKIVTGGGKDLIINVLLKEEAEQLEEVVVTALGIKRQEK
SLSYATQTVSGKELTDVPSSNVLNTLAGKTAGMSVSGSGSGVGSSVKIVLRGNRSIQGNN
QPLYVVDGTPISSGAFSGSAIGDGYGGGIDAGDGMAGINPEDIESINVLKGATAAALYGS
QAANGVILITTKRGNSEKIAVSVTSSVQADVPYLTYKFQDRYTMGVDGVSQSSMDAWGAP
RTNQDLSNDFVKNFFNTGFMSQNGVSVSGGNKVTKNFLSYQNTTATGIMPNNTFDKHNLS
LRSTTSLFDDFIEVDGSVALTHQDTGNAPAAPGQYFNPILGLYLFPAGTTAFNSYRDVYE
VPDPSRNGLMTMNWANQTDVYKNPYWLINRHNYSYNVEKAIVKLNTKFNFTSWLNLQLRG
SYDKTATLGERKVHAGMTTLTGKGGRYDHKTQNYALMYADALLTANKSYEKFSISATLGT
SISDTKETTNEIQIHNLAIANLFDLRNYIGIEGGSDNKRTHRQLQSVFGTVSLGYNEMLY
LDVTGRNDWSSTLPANNRSYFYPSVGTSFVFTEMLDQNEAKPEWLDFGKLRFSWTQVGND
MPWGLTEPYDKLQKGGVIEANTVKPFDDLKPERSNSLEAGVNLRFLGGRFTFDAAVYKTV
TENQYFKVDNTSGSGYSQYYINAGEVENKGFELTLGFTPIKTNDFQWNGYLNYSTNKNTV
LSLPSQYLDKGFEISSVGYRFRLKEGEEWGRMYEKRLKRDNQGNILLTQTIENGVDKGIQ
LQQSDDFEYIGNVNPKFLIGFKNEFSYKNFSLGLLIDGRFGGNVISSTQNILDRFGRSQR
SAEARDNGGIPLTGTLVTTTKVTGSPDVVTQTAFNQKIDAQTYYKVAPAGETSVYSATNV
RLRELSLSYTLPKSLVERVKYVESVRLSLIGRNLGFFYNEAPYDPEITLSTSSNGLSNAD
LFTMPASRSVGFSININF
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaaaattttaacattgtttatctttgtgttaggctggtgttccagttcgtta
ttagcacaaactgtatcagtaaaaggagtcgttactgatgaaaataaaattccgttagcg
ggagtgagtgtttcagtcaaaaatacttctcgtggagtttccacagacttcgatggaaac
tatgaaatcaaagtcaattcgggtgatgttttggtttttagttccttaggttttacctct
caagagaagattgtgacaggggggggtaaagatttgataatcaacgttttactaaaagaa
gaggcagagcaattggaagaagtggtggttacggccttgggtatcaagcgacaagaaaaa
agtttgtcgtatgctacacaaactgtttcaggtaaggaattgacggatgtcccttcgagc
aacgttttgaacactttggcaggaaaaacggcaggtatgtctgtttcaggttcaggttca
ggagtaggtagctctgtaaaaatagtgttgcgtggtaatcgttctattcaagggaacaac
caacctctttacgtagtggatggaacgcctattagcagtggagctttttcaggttctgct
attggtgatggctacggcggaggtattgatgccggagatggtatggcaggtattaaccca
gaagatattgagagtatcaacgttttaaaaggtgctacagctgcggccttgtatggtagc
caagcagctaacggtgtaattttgattaccactaaaagaggtaattctgaaaagatagca
gtgtcagttacttcttctgttcaagcagacgttccttatttgacttataaattccaagat
cgttatacaatgggagttgatggtgtgagtcaatcatcaatggatgcttggggagcgcca
cgtaccaatcaagatttgagcaatgattttgtgaaaaatttcttcaacacaggattcatg
tcacaaaatggggtttctgttagcggagggaataaagtgactaaaaattttctttcctat
caaaatactaccgcaacaggtattatgcctaataatacgttcgataaacataatttgagt
ttgcgttctacaacttctctttttgatgattttattgaagtagacggaagtgttgcactt
acgcatcaagatacaggaaatgcacctgctgctccaggacagtattttaaccctatctta
ggattatatcttttccctgcaggaacaacagcatttaattcatacagagatgtttatgaa
gtgcctgatccttcacggaatggcttaatgaccatgaactgggcaaaccaaaccgatgtt
tataaaaacccatactggttaatcaatcgtcataattattcatacaacgtagagaaagcg
attgtaaaattaaatactaaatttaattttacaagttggttaaatcttcaattgcgagga
agttatgataaaacagctactttaggagaacgaaaagtacatgcaggaatgactacccta
acaggaaaaggaggtcgttatgatcataaaacccaaaattatgctttgatgtacgcggac
gctcttttgactgcaaacaaatcatatgaaaaattctcaataagtgccacattagggaca
agtatttctgatacaaaagagactactaatgaaatccaaattcacaacttggcaatagca
aatctttttgacttgagaaactacattggaatagaaggaggttccgataataagagaaca
catagacaattgcaatctgtattcggaaccgtgtcattaggttataatgaaatgctttat
ttagatgtgacaggacgtaatgactggtcttctactttacctgccaacaatagaagctat
ttctatccatcagtaggtacatctttcgtttttacagaaatgttggaccaaaatgaagca
aaaccagagtggcttgatttcggtaaacttcgtttctcttggacacaagtaggtaacgat
atgccatggggattaacagagccttatgacaaattgcaaaaaggaggggttatcgaagct
aataccgtgaaacctttcgatgatttaaaaccagaacgctctaattctcttgaggcaggg
gtcaatctaagatttttgggtggacgctttacttttgatgccgctgtatataaaacagtt
actgaaaatcagtactttaaggtagataacacctctggttcggggtattcacaatactac
atcaatgctggagaagttgaaaataaaggatttgaacttactttaggtttcactccaatc
aaaacaaatgatttccaatggaatgggtatttaaactattcaaccaacaaaaatactgta
ctttcattgccatctcaatatttggataaaggatttgaaatatcgtctgttggttataga
ttccgtcttaaagaaggagaggaatggggacgtatgtacgaaaaacgtcttaaacgagac
aatcaaggaaatattcttcttacgcagactatcgaaaatggtgtagataaaggaattcaa
ttgcaacaaagcgatgattttgagtatatcggaaacgttaatccaaaattcttgatagga
tttaaaaatgagttttcatataaaaacttttcattaggattgttaattgatggacgtttt
ggaggaaatgtcatttcatcaacacaaaacatccttgaccgtttcggacgtagccaacgt
tcagcagaagctcgtgataacggaggtattcctttaacaggaacacttgtaactacaaca
aaagtaacaggaagcccagacgtagtaacacaaacagctttcaatcaaaaaatagacgct
caaacttactacaaagtagcacctgcgggagaaacttcagtttattcagcaactaatgtt
cgtttaagagagctttcactgtcttacactcttccaaaatcacttgtagagcgtgtgaaa
tacgtagaaagtgttagattgtctcttataggacgtaatttaggtttcttctacaatgag
gctccttacgaccctgaaattacactatcaacaagtagtaacggattgtctaatgcagac
ttattcactatgccagcttcacgaagtgtaggatttagtattaatattaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
